BLASTN 2.11.0+ Reference: Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000), "A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000; 7(1-2):203-14. Database: SS_all_quivered_hq.fasta 42,166 sequences; 76,657,983 total letters Query= 4541 Length=1191 Score E Sequences producing significant alignments: (Bits) Value c101171/f2p4/1482isoform=c101171;full_length_coverage=2;non_full_... 1652 0.0 c311057/f3p3/1951isoform=c311057;full_length_coverage=3;non_full_... 1646 0.0 c68424/f4p5/1477isoform=c68424;full_length_coverage=4;non_full_le... 1644 0.0 >c101171/f2p4/1482 isoform=c101171;full_length_coverage=2;non_full_length_coverage=4;isoform_length=1482 Length=1482 Score = 1652 bits (894), Expect = 0.0 Identities = 902/906 (99%), Gaps = 0/906 (0%) Strand=Plus/Plus Query 1 ATGTTCTCTACGTTGACTTTGTTCGGTGTTTTGACCGTAACGTTTGCCGTCACGAATGTT 60 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || Sbjct 40 ATGTTCTCTACGTTGACTTTGTTCGGTGTTTTGACTGTAACGTTTGCCGTCACGAATCTT 99 Query 61 CGAGGAGAATGCCCTTCCGACACTGGTATCCTTCGTCTCTACAAGGAGCTGGGATGTAAA 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 100 CGAGGAGAATGCCCTTCCGACACTGGTATCCTTCGTCTCTACAAGGAGCTGGGATGTAAA 159 Query 121 CCTGTCAAATCAGATGCTGAGAAATGCGCCACTGCTTTCTCCTGTCCATCTCAAATCCAA 180 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct 160 CCTGTCAAATCAGATGCTGAGAAATGCGCCACTGCTTTCTCTTGTCCATCTCAAATCCAA 219 Query 181 ACCGCCTCCAAGACATGTTCGGTGAAAGGGAAAACCTACAAAAGCGGAGAGAAGATCCCC 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 220 ACCGCCTCCAAGACATGTTCGGTGAAAGGGAAAACCTACAAAAGCGGAGAGAAGATCCCC 279 Query 241 GCCAGCAAAGGATCCTGTGTCGCCGAATGTCGTTGTACGGAAGCTTGGCCTAATATGGAT 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 280 GCCAGCAAAGGATCCTGTGTCGCCGAATGTCGTTGTACGGAAGCTTGGCCTAATATGGAT 339 Query 301 AGATCCAGTATTGTATGCGCCCACATCGACTGTCCTGAATTCCTAGGAGAACCCATCATG 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 340 AGATCCAGTATTGTATGCGCCCACATCGACTGTCCTGAATTCCTAGGAGAACCCATCATG 399 Query 361 GACGGCTGTGTTCGTCAATACTCCTTGGATGAATGCTGTTCTGTTGGAGTCAAATGTCCC 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 400 GACGGCTGTGTTCGTCAATACTCCTTGGATGAATGCTGTTCTGTTGGAGTCAAATGTCCC 459 Query 421 GCTCTTGAAGAGGCCAAATCTCAAAACAAGACTACCGCGGGCAACACTCCCGCTTCGACT 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 460 GCTCTTGAAGAGGCCAAATCTCAAAACAAGACTACCGCGGGCAACACTCCCGCTTCGACT 519 Query 481 TCCGTTGTGGCCAAATCTTCCGGTTTCATGTGCAACGTGAGTGGCGTGCAGTATCCTGAA 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 520 TCCGTTGTGGCCAAATCTTCCGGTTTCATGTGCAACGTGAGTGGCGTGCAGTATCCTGAA 579 Query 541 GGCGCTGTCTTCTATCCGGACACACCCGCCTGCACACATTGTATCTGTACCAAGGATTAT 600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 580 GGCGCTGTCTTCTATCCGGACACACCCGCCTGCACACATTGTATCTGTACCAAGGATTAT 639 Query 601 ACCGGATCCAACACCGGTCCTTACTGCAGAGAGATCTCCTGTGATATTGAACTTCACTAT 660 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 640 ACCGGATCCAACACCGGTCCTTACTGCAGAGAGATCTCCTGTGATATTGAACTTCACTAT 699 Query 661 GGAAGTGATTTGCAGGAGGGTTGTACCCCTGTCTACTTTGGAGACGACGGCTGTTGTCCC 720 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 700 GGAAGTGATTTGCAGGAGGGTTGTACCCCTGTCTACTTTGGAGACGACGGCTGTTGTCCC 759 Query 721 ATTCAGTTCAGATGCCCCTCTATTGAAGACACAGTTTTGAAATCAGCAAAGGAATCGGGA 780 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct 760 ATTCAGTTCAGATGCCCCTCTATTGAAGACACAGTTTTGAAATCAGCAAAGGAATCGGAA 819 Query 781 AAAAAAATTGAAGGCAAAGAGGGCCAGTGTACATTCGGCAACCTCACGTTGAGCATTGGA 840 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 820 AAAAAAATTGAAGGCAAAGAGGGCCAGTGTACATTCGGCAACCTCACGTTGAGCATTGGA 879 Query 841 GACAAATTGTCCCCTGCTGAGTATGAAGAGTGTGTGGATTGCACCTGTGAGATCCCTCCT 900 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 880 GACAAATTGTCCCCTGCTGAGTATGAAGAGTGTGTGGATTGCACCTGTGAGATCCCTCCT 939 Query 901 TATGTG 906 |||||| Sbjct 940 TATGTG 945 Score = 364 bits (197), Expect = 1e-99 Identities = 197/197 (100%), Gaps = 0/197 (0%) Strand=Plus/Plus Query 995 CCTCTATTGAAGACACAGTTTTGAAATCAGCAAAGGAATCGGAAAAAAAAATTGAAGGCA 1054 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 776 CCTCTATTGAAGACACAGTTTTGAAATCAGCAAAGGAATCGGAAAAAAAAATTGAAGGCA 835 Query 1055 AAGAGGGCCAGTGTACATTCGGCAACCTCACGTTGAGCATTGGAGACAAATTGTCCCCTG 1114 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 836 AAGAGGGCCAGTGTACATTCGGCAACCTCACGTTGAGCATTGGAGACAAATTGTCCCCTG 895 Query 1115 CTGAGTATGAAGAGTGTGTGGATTGCACCTGTGAGATCCCTCCTTATGTGTCCTGCACCA 1174 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 896 CTGAGTATGAAGAGTGTGTGGATTGCACCTGTGAGATCCCTCCTTATGTGTCCTGCACCA 955 Query 1175 AACTCCCCAACTGTTAA 1191 ||||||||||||||||| Sbjct 956 AACTCCCCAACTGTTAA 972 >c311057/f3p3/1951 isoform=c311057;full_length_coverage=3;non_full_length_coverage=3;isoform_length=1951 Length=1951 Score = 1646 bits (891), Expect = 0.0 Identities = 901/906 (99%), Gaps = 0/906 (0%) Strand=Plus/Plus Query 1 ATGTTCTCTACGTTGACTTTGTTCGGTGTTTTGACCGTAACGTTTGCCGTCACGAATGTT 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 63 ATGTTCTCTACGTTGACTTTGTTCGGTGTTTTGACCGTAACGTTTGCCGTCACGAATGTT 122 Query 61 CGAGGAGAATGCCCTTCCGACACTGGTATCCTTCGTCTCTACAAGGAGCTGGGATGTAAA 120 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 123 CGAGGAGAATGCCCCTCCGACACTGGTATCCTTCGTCTCTACAAGGAGCTGGGATGTAAA 182 Query 121 CCTGTCAAATCAGATGCTGAGAAATGCGCCACTGCTTTCTCCTGTCCATCTCAAATCCAA 180 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 183 CCTGTCAAATCAGATGCTGAGAAATGCGCCACTGCTTTCTCCTGTCCATCTCAAATCCAA 242 Query 181 ACCGCCTCCAAGACATGTTCGGTGAAAGGGAAAACCTACAAAAGCGGAGAGAAGATCCCC 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 243 ACCGCCTCCAAGACATGTTCGGTGAAAGGGAAAACCTACAAAAGCGGAGAGAAGATCCCC 302 Query 241 GCCAGCAAAGGATCCTGTGTCGCCGAATGTCGTTGTACGGAAGCTTGGCCTAATATGGAT 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 303 GCCAGCAAAGGATCCTGTGTCGCCGAATGTCGTTGTACGGAAGCTTGGCCTAATATGGAT 362 Query 301 AGATCCAGTATTGTATGCGCCCACATCGACTGTCCTGAATTCCTAGGAGAACCCATCATG 360 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 363 AGATCCAGTATTGTATGCGCCCACATTGACTGTCCTGAATTCCTAGGAGAACCCATCATG 422 Query 361 GACGGCTGTGTTCGTCAATACTCCTTGGATGAATGCTGTTCTGTTGGAGTCAAATGTCCC 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct 423 GACGGCTGTGTTCGTCAATACTCCTTGGATGAATGCTGTTCTGTTGGAGTCAAATGCCCC 482 Query 421 GCTCTTGAAGAGGCCAAATCTCAAAACAAGACTACCGCGGGCAACACTCCCGCTTCGACT 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 483 GCTCTTGAAGAGGCCAAATCTCAAAACAAGACTACCGCGGGCAACACTCCCGCTTCGACT 542 Query 481 TCCGTTGTGGCCAAATCTTCCGGTTTCATGTGCAACGTGAGTGGCGTGCAGTATCCTGAA 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 543 CCCGTTGTGGCCAAATCTTCCGGTTTCATGTGCAACGTGAGTGGCGTGCAGTATCCTGAA 602 Query 541 GGCGCTGTCTTCTATCCGGACACACCCGCCTGCACACATTGTATCTGTACCAAGGATTAT 600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 603 GGCGCTGTCTTCTATCCGGACACACCCGCCTGCACACATTGTATCTGTACCAAGGATTAT 662 Query 601 ACCGGATCCAACACCGGTCCTTACTGCAGAGAGATCTCCTGTGATATTGAACTTCACTAT 660 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 663 ACCGGATCCAACACCGGTCCTTACTGCAGAGAGATCTCCTGTGATATTGAACTTCACTAT 722 Query 661 GGAAGTGATTTGCAGGAGGGTTGTACCCCTGTCTACTTTGGAGACGACGGCTGTTGTCCC 720 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 723 GGAAGTGATTTACAGGAGGGTTGTACCCCTGTCTACTTTGGAGACGACGGCTGTTGTCCC 782 Query 721 ATTCAGTTCAGATGCCCCTCTATTGAAGACACAGTTTTGAAATCAGCAAAGGAATCGGGA 780 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 783 ATTCAGTTCAGATGCCCCTCTATTGAAGACACAGTTTTGAAATCAGCAAAGGAATCGGGA 842 Query 781 AAAAAAATTGAAGGCAAAGAGGGCCAGTGTACATTCGGCAACCTCACGTTGAGCATTGGA 840 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 843 AAAAAAATTGAAGGCAAAGAGGGCCAGTGTACATTCGGCAACCTCACGTTGAGCATTGGA 902 Query 841 GACAAATTGTCCCCTGCTGAGTATGAAGAGTGTGTGGATTGCACCTGTGAGATCCCTCCT 900 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 903 GACAAATTGTCCCCTGCTGAGTATGAAGAGTGTGTGGATTGCACCTGTGAGATCCCTCCT 962 Query 901 TATGTG 906 |||||| Sbjct 963 TATGTG 968 Score = 355 bits (192), Expect = 8e-97 Identities = 194/195 (99%), Gaps = 0/195 (0%) Strand=Plus/Plus Query 995 CCTCTATTGAAGACACAGTTTTGAAATCAGCAAAGGAATCGGAAAAAAAAATTGAAGGCA 1054 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct 799 CCTCTATTGAAGACACAGTTTTGAAATCAGCAAAGGAATCGGGAAAAAAAATTGAAGGCA 858 Query 1055 AAGAGGGCCAGTGTACATTCGGCAACCTCACGTTGAGCATTGGAGACAAATTGTCCCCTG 1114 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 859 AAGAGGGCCAGTGTACATTCGGCAACCTCACGTTGAGCATTGGAGACAAATTGTCCCCTG 918 Query 1115 CTGAGTATGAAGAGTGTGTGGATTGCACCTGTGAGATCCCTCCTTATGTGTCCTGCACCA 1174 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 919 CTGAGTATGAAGAGTGTGTGGATTGCACCTGTGAGATCCCTCCTTATGTGTCCTGCACCA 978 Query 1175 AACTCCCCAACTGTT 1189 ||||||||||||||| Sbjct 979 AACTCCCCAACTGTT 993 >c68424/f4p5/1477 isoform=c68424;full_length_coverage=4;non_full_length_coverage=5;isoform_length=1477 Length=1477 Score = 1644 bits (890), Expect = 0.0 Identities = 901/906 (99%), Gaps = 1/906 (0%) Strand=Plus/Plus Query 1 ATGTTCTCTACGTTGACTTTGTTCGGTGTTTTGACCGTAACGTTTGCCGTCACGAATGTT 60 |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| || Sbjct 39 ATGTTCTCTACGTTGACTTTGTTCGGTG-TTTGACTGTAACGTTTGCCGTCACGAATCTT 97 Query 61 CGAGGAGAATGCCCTTCCGACACTGGTATCCTTCGTCTCTACAAGGAGCTGGGATGTAAA 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 98 CGAGGAGAATGCCCTTCCGACACTGGTATCCTTCGTCTCTACAAGGAGCTGGGATGTAAA 157 Query 121 CCTGTCAAATCAGATGCTGAGAAATGCGCCACTGCTTTCTCCTGTCCATCTCAAATCCAA 180 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct 158 CCTGTCAAATCAGATGCTGAGAAATGCGCCACTGCTTTCTCTTGTCCATCTCAAATCCAA 217 Query 181 ACCGCCTCCAAGACATGTTCGGTGAAAGGGAAAACCTACAAAAGCGGAGAGAAGATCCCC 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 218 ACCGCCTCCAAGACATGTTCGGTGAAAGGGAAAACCTACAAAAGCGGAGAGAAGATCCCC 277 Query 241 GCCAGCAAAGGATCCTGTGTCGCCGAATGTCGTTGTACGGAAGCTTGGCCTAATATGGAT 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 278 GCCAGCAAAGGATCCTGTGTCGCCGAATGTCGTTGTACGGAAGCTTGGCCTAATATGGAT 337 Query 301 AGATCCAGTATTGTATGCGCCCACATCGACTGTCCTGAATTCCTAGGAGAACCCATCATG 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 338 AGATCCAGTATTGTATGCGCCCACATCGACTGTCCTGAATTCCTAGGAGAACCCATCATG 397 Query 361 GACGGCTGTGTTCGTCAATACTCCTTGGATGAATGCTGTTCTGTTGGAGTCAAATGTCCC 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 398 GACGGCTGTGTTCGTCAATACTCCTTGGATGAATGCTGTTCTGTTGGAGTCAAATGTCCC 457 Query 421 GCTCTTGAAGAGGCCAAATCTCAAAACAAGACTACCGCGGGCAACACTCCCGCTTCGACT 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 458 GCTCTTGAAGAGGCCAAATCTCAAAACAAGACTACCGCGGGCAACACTCCCGCTTCGACT 517 Query 481 TCCGTTGTGGCCAAATCTTCCGGTTTCATGTGCAACGTGAGTGGCGTGCAGTATCCTGAA 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 518 TCCGTTGTGGCCAAATCTTCCGGTTTCATGTGCAACGTGAGTGGCGTGCAGTATCCTGAA 577 Query 541 GGCGCTGTCTTCTATCCGGACACACCCGCCTGCACACATTGTATCTGTACCAAGGATTAT 600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 578 GGCGCTGTCTTCTATCCGGACACACCCGCCTGCACACATTGTATCTGTACCAAGGATTAT 637 Query 601 ACCGGATCCAACACCGGTCCTTACTGCAGAGAGATCTCCTGTGATATTGAACTTCACTAT 660 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 638 ACCGGATCCAACACCGGTCCTTACTGCAGAGAGATCTCCTGTGATATTGAACTTCACTAT 697 Query 661 GGAAGTGATTTGCAGGAGGGTTGTACCCCTGTCTACTTTGGAGACGACGGCTGTTGTCCC 720 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 698 GGAAGTGATTTGCAGGAGGGTTGTACCCCTGTCTACTTTGGAGACGACGGCTGTTGTCCC 757 Query 721 ATTCAGTTCAGATGCCCCTCTATTGAAGACACAGTTTTGAAATCAGCAAAGGAATCGGGA 780 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct 758 ATTCAGTTCAGATGCCCCTCTATTGAAGACACAGTTTTGAAATCAGCAAAGGAATCGGAA 817 Query 781 AAAAAAATTGAAGGCAAAGAGGGCCAGTGTACATTCGGCAACCTCACGTTGAGCATTGGA 840 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 818 AAAAAAATTGAAGGCAAAGAGGGCCAGTGTACATTCGGCAACCTCACGTTGAGCATTGGA 877 Query 841 GACAAATTGTCCCCTGCTGAGTATGAAGAGTGTGTGGATTGCACCTGTGAGATCCCTCCT 900 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 878 GACAAATTGTCCCCTGCTGAGTATGAAGAGTGTGTGGATTGCACCTGTGAGATCCCTCCT 937 Query 901 TATGTG 906 |||||| Sbjct 938 TATGTG 943 Score = 364 bits (197), Expect = 1e-99 Identities = 197/197 (100%), Gaps = 0/197 (0%) Strand=Plus/Plus Query 995 CCTCTATTGAAGACACAGTTTTGAAATCAGCAAAGGAATCGGAAAAAAAAATTGAAGGCA 1054 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 774 CCTCTATTGAAGACACAGTTTTGAAATCAGCAAAGGAATCGGAAAAAAAAATTGAAGGCA 833 Query 1055 AAGAGGGCCAGTGTACATTCGGCAACCTCACGTTGAGCATTGGAGACAAATTGTCCCCTG 1114 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 834 AAGAGGGCCAGTGTACATTCGGCAACCTCACGTTGAGCATTGGAGACAAATTGTCCCCTG 893 Query 1115 CTGAGTATGAAGAGTGTGTGGATTGCACCTGTGAGATCCCTCCTTATGTGTCCTGCACCA 1174 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 894 CTGAGTATGAAGAGTGTGTGGATTGCACCTGTGAGATCCCTCCTTATGTGTCCTGCACCA 953 Query 1175 AACTCCCCAACTGTTAA 1191 ||||||||||||||||| Sbjct 954 AACTCCCCAACTGTTAA 970 Lambda K H 1.33 0.621 1.12 Gapped Lambda K H 1.28 0.460 0.850 Effective search space used: 88029342055 Database: SS_all_quivered_hq.fasta Posted date: Feb 25, 2019 4:32 PM Number of letters in database: 76,657,983 Number of sequences in database: 42,166 Matrix: blastn matrix 1 -2 Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5