BLASTN 2.11.0+ Reference: Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000), "A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000; 7(1-2):203-14. Database: Dcitr_OGSv2.0_rna.fa 25,292 sequences; 49,157,538 total letters Query= Untitled_sequence Length=606 Score E Sequences producing significant alignments: (Bits) Value DcitrM015935.1.1Unknown protein. Similar to MCOT03938.0.CC XP_008... 1109 0.0 DcitrM015870.1.1Unknown protein. Similar to MCOT03938.0.CC XP_017... 1103 0.0 DcitrM015930.1.1PHD finger-like domain-containing protein 5A (AHR... 617 3e-176 >DcitrM015935.1.1 Unknown protein. Similar to MCOT03938.0.CC XP_008477989.1. AED 0.00 Length=957 Score = 1109 bits (600), Expect = 0.0 Identities = 604/606 (99%), Gaps = 0/606 (0%) Strand=Plus/Plus Query 1 ATGAACAGTGCTTTACTTTTGCTGGGAGTTACAATATGCTTGAGAACAATACATGTGTTG 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 220 ATGAACAGTGCTTTACTTTTGCTGGGAGTTACAATATGCTTGAGAACAATACATGTGTTG 279 Query 61 GGCAGAAACAGGACAGCTTTGGAGAATATAGTACACATGAGTTATCTCAGGTTGAAGTGT 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 280 GGCAGAAACAGGACAGCTTTGGAGAATATAGTACACATGAGTTATCTCAGGTTGAAGTGT 339 Query 121 GCACCTAGCATACTATGGCATCAGATGCAAGCTAGAGCTCAAATACACAATGAGACCCAT 180 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct 340 GCACCTAGCATACTATGGCATCAGATGCAAGCTAAAGCTCAAATACACAATGAGACCCAT 399 Query 181 GATGCATTGGAAAGGGAAGAAATGAATAAATATGCCCATGAGTTTGATGTACATTATTCT 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct 400 GATGCATTGGAAAGGGAAGAAATGAATAAATATGCCCATGAGTTTGATGTGCATTATTCT 459 Query 241 GTGATAGATTCATTCTTCAAAGCTCAACAAGAAGCCAACTTGCTTGTACGATATTCACTA 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 460 GTGATAGATTCATTCTTCAAAGCTCAACAAGAAGCCAACTTGCTTGTACGATATTCACTA 519 Query 301 TTGGGGTCCAACATTACAACAAGAGCAACAAAAACCATTATCAAGGATCCAAAGGACTTG 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 520 TTGGGGTCCAACATTACAACAAGAGCAACAAAAACCATTATCAAGGATCCAAAGGACTTG 579 Query 361 GACTTAAAGTTAACCACCATCACCAAAGTGATATTGGAAAACATGAATGTGGCCAGGGAT 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 580 GACTTAAAGTTAACCACCATCACCAAAGTGATATTGGAAAACATGAATGTGGCCAGGGAT 639 Query 421 AACCTCATCTCAGGAGACTGCAGGAGTGATTTGAGTTCAGCCATCAATGCAGAAGTTGAG 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 640 AACCTCATCTCAGGAGACTGCAGGAGTGATTTGAGTTCAGCCATCAATGCAGAAGTTGAG 699 Query 481 GAATGGAAACTTGATGATTTACATGAGACTGCTCTGACAAGAGCACTAGGCTATTTGATT 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 700 GAATGGAAACTTGATGATTTACATGAGACTGCTCTGACAAGAGCACTAGGCTATTTGATT 759 Query 541 GATATTTGTCAGCTCCATTTTAGTTGGATTCAAGGAAGCCCAGAGTACAGAAAAATTGTA 600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 760 GATATTTGTCAGCTCCATTTTAGTTGGATTCAAGGAAGCCCAGAGTACAGAAAAATTGTA 819 Query 601 CTTTAG 606 |||||| Sbjct 820 CTTTAG 825 >DcitrM015870.1.1 Unknown protein. Similar to MCOT03938.0.CC XP_017301877.1. AED 0.03 Length=1081 Score = 1103 bits (597), Expect = 0.0 Identities = 603/606 (99%), Gaps = 0/606 (0%) Strand=Plus/Plus Query 1 ATGAACAGTGCTTTACTTTTGCTGGGAGTTACAATATGCTTGAGAACAATACATGTGTTG 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 169 ATGAACAGTGCTTTACTTTTGCTGGGAGTTACAATATGCTTGAGAACAATACATGTGTTG 228 Query 61 GGCAGAAACAGGACAGCTTTGGAGAATATAGTACACATGAGTTATCTCAGGTTGAAGTGT 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 229 GGCAGAAACAGGACAGCTTTGGAGAATATAGTACACATGAGTTATCTCAGGTTGAAGTGT 288 Query 121 GCACCTAGCATACTATGGCATCAGATGCAAGCTAGAGCTCAAATACACAATGAGACCCAT 180 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 289 GCACCTAGCATACTATGGCATCAGATGCAAGCTAGAGCTCAAATACACAATGAGACCCAT 348 Query 181 GATGCATTGGAAAGGGAAGAAATGAATAAATATGCCCATGAGTTTGATGTACATTATTCT 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct 349 GATGCATTGGAAAGGGAAGAAATGAATAAATATGCCCATGAGTTTGATGTGCATTATTCT 408 Query 241 GTGATAGATTCATTCTTCAAAGCTCAACAAGAAGCCAACTTGCTTGTACGATATTCACTA 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 409 GTGATAGATTCATTCTTCAAAGCTCAACAAGAAGCCAACTTGCTTGTACGATATTCACTA 468 Query 301 TTGGGGTCCAACATTACAACAAGAGCAACAAAAACCATTATCAAGGATCCAAAGGACTTG 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 469 TTGGGGTCCAACATTACAACAAGAGCAACAAAAACCATTATCAAGGATCCAAAGGACTTG 528 Query 361 GACTTAAAGTTAACCACCATCACCAAAGTGATATTGGAAAACATGAATGTGGCCAGGGAT 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 529 GACTTAAAGTTAACCACCATCACCAAAGTGATATTGGAAAACATGAATGTGGCCAGGGAT 588 Query 421 AACCTCATCTCAGGAGACTGCAGGAGTGATTTGAGTTCAGCCATCAATGCAGAAGTTGAG 480 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 589 AACCTCATCTCAGGAAACTGCAGGAGTGATTTGAGTTCAGCCATCAATGCAGAAGTTGAG 648 Query 481 GAATGGAAACTTGATGATTTACATGAGACTGCTCTGACAAGAGCACTAGGCTATTTGATT 540 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 649 GAATGGAAAATTGATGATTTACATGAGACTGCTCTGACAAGAGCACTAGGCTATTTGATT 708 Query 541 GATATTTGTCAGCTCCATTTTAGTTGGATTCAAGGAAGCCCAGAGTACAGAAAAATTGTA 600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 709 GATATTTGTCAGCTCCATTTTAGTTGGATTCAAGGAAGCCCAGAGTACAGAAAAATTGTA 768 Query 601 CTTTAG 606 |||||| Sbjct 769 CTTTAG 774 >DcitrM015930.1.1 PHD finger-like domain-containing protein 5A (AHRD V3.11 *** tr|E2B2Y8|E2B2Y8_HARSA). AED 0.00| InterPro:IPR005345,Pfam:PF03660 Length=975 Score = 617 bits (334), Expect = 3e-176 Identities = 334/334 (100%), Gaps = 0/334 (0%) Strand=Plus/Minus Query 273 AGCCAACTTGCTTGTACGATATTCACTATTGGGGTCCAACATTACAACAAGAGCAACAAA 332 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 943 AGCCAACTTGCTTGTACGATATTCACTATTGGGGTCCAACATTACAACAAGAGCAACAAA 884 Query 333 AACCATTATCAAGGATCCAAAGGACTTGGACTTAAAGTTAACCACCATCACCAAAGTGAT 392 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 883 AACCATTATCAAGGATCCAAAGGACTTGGACTTAAAGTTAACCACCATCACCAAAGTGAT 824 Query 393 ATTGGAAAACATGAATGTGGCCAGGGATAACCTCATCTCAGGAGACTGCAGGAGTGATTT 452 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 823 ATTGGAAAACATGAATGTGGCCAGGGATAACCTCATCTCAGGAGACTGCAGGAGTGATTT 764 Query 453 GAGTTCAGCCATCAATGCAGAAGTTGAGGAATGGAAACTTGATGATTTACATGAGACTGC 512 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 763 GAGTTCAGCCATCAATGCAGAAGTTGAGGAATGGAAACTTGATGATTTACATGAGACTGC 704 Query 513 TCTGACAAGAGCACTAGGCTATTTGATTGATATTTGTCAGCTCCATTTTAGTTGGATTCA 572 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 703 TCTGACAAGAGCACTAGGCTATTTGATTGATATTTGTCAGCTCCATTTTAGTTGGATTCA 644 Query 573 AGGAAGCCCAGAGTACAGAAAAATTGTACTTTAG 606 |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 643 AGGAAGCCCAGAGTACAGAAAAATTGTACTTTAG 610 Lambda K H 1.33 0.621 1.12 Gapped Lambda K H 1.28 0.460 0.850 Effective search space used: 28193163278 Database: Dcitr_OGSv2.0_rna.fa Posted date: Mar 4, 2018 10:37 PM Number of letters in database: 49,157,538 Number of sequences in database: 25,292 Matrix: blastn matrix 1 -2 Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5