BLASTN 2.11.0+ Reference: Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000), "A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000; 7(1-2):203-14. Database: Cclementina_182_v1.0.cds_primaryTranscriptOnly_annot.fasta 24,533 sequences; 30,654,468 total letters Query= Cs1g01030.1 Length=2380 Score E Sequences producing significant alignments: (Bits) Value Ciclev10026951msimilar to AT5G23490.1 3535 0.0 >Ciclev10026951m similar to AT5G23490.1 Length=1914 Score = 3535 bits (1914), Expect = 0.0 Identities = 1914/1914 (100%), Gaps = 0/1914 (0%) Strand=Plus/Plus Query 362 ATGGAGAACGGTCACGGTGGCAATTTAGCTGATAAGTTTTCGGGATTAGCGCTAAATGAT 421 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1 ATGGAGAACGGTCACGGTGGCAATTTAGCTGATAAGTTTTCGGGATTAGCGCTAAATGAT 60 Query 422 AAAGGTAATGATTCTAATAATAACTCTAACAGCAACAACAACAACAACGACAGCTTGTTT 481 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 61 AAAGGTAATGATTCTAATAATAACTCTAACAGCAACAACAACAACAACGACAGCTTGTTT 120 Query 482 CAGGTTATGAAAGCTGTCGAAGCCGCTGAGGCCACCATCAAACAACAGATAGAAGAGAAC 541 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 121 CAGGTTATGAAAGCTGTCGAAGCCGCTGAGGCCACCATCAAACAACAGATAGAAGAGAAC 180 Query 542 AATTTACTGAGGACTGAGCTTCACAAAAAAATTCAGGAACTCGAGAAATATAAATTAGAG 601 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 181 AATTTACTGAGGACTGAGCTTCACAAAAAAATTCAGGAACTCGAGAAATATAAATTAGAG 240 Query 602 GAATCAATTGGTCGAAGACATAATATTGATACTTGGAAAGAGAGTTTCCGTGGACCTTAT 661 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 241 GAATCAATTGGTCGAAGACATAATATTGATACTTGGAAAGAGAGTTTCCGTGGACCTTAT 300 Query 662 GAAGTTCATCAGTCACTTCCCTCTGTCAATAACCTAGAAGATAGAATCAAAAGCATGGGC 721 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 301 GAAGTTCATCAGTCACTTCCCTCTGTCAATAACCTAGAAGATAGAATCAAAAGCATGGGC 360 Query 722 TACGCTTCTGCAGATGATCCATCCAGTTCACTGGTTCTCCATCAAGATTTGAAACCAACT 781 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 361 TACGCTTCTGCAGATGATCCATCCAGTTCACTGGTTCTCCATCAAGATTTGAAACCAACT 420 Query 782 GATGAAAATGCTGCATTGCAAAGCCGTTCTGACGTTCACACTGAGAGCAACAAGAACAAT 841 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 421 GATGAAAATGCTGCATTGCAAAGCCGTTCTGACGTTCACACTGAGAGCAACAAGAACAAT 480 Query 842 GGAACATTGAAGGTACTTTCTGGTGGGCAAGCACATGCAGATACTCCGGGCCCCTCTCAG 901 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 481 GGAACATTGAAGGTACTTTCTGGTGGGCAAGCACATGCAGATACTCCGGGCCCCTCTCAG 540 Query 902 TTATCTTCACCGTCTACAACATCGTTTTCGCCTAGCAGGTACCAAATGGATGGGGATTAT 961 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 541 TTATCTTCACCGTCTACAACATCGTTTTCGCCTAGCAGGTACCAAATGGATGGGGATTAT 600 Query 962 GATCCACGGTTTAATTTGTCTGGACAAGGCCTGATGCCAATGGCTGAAGTAAATAATCCT 1021 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 601 GATCCACGGTTTAATTTGTCTGGACAAGGCCTGATGCCAATGGCTGAAGTAAATAATCCT 660 Query 1022 AGAAGCCTGTGGAAGCAGGACCTTATTCTTAAGATTCGGGAGCATGAAGAAGAGATTATG 1081 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 661 AGAAGCCTGTGGAAGCAGGACCTTATTCTTAAGATTCGGGAGCATGAAGAAGAGATTATG 720 Query 1082 CAGTTACGTAAACATCTTTCTGAATATTCTATCAAGGAAGCACAAATACGCAATGAAAAA 1141 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 721 CAGTTACGTAAACATCTTTCTGAATATTCTATCAAGGAAGCACAAATACGCAATGAAAAA 780 Query 1142 TATGTTCTTGAAAAGCGCATTGCTTACATGCGTCTGGCCTTTGATCAACAACAGCAAGAC 1201 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 781 TATGTTCTTGAAAAGCGCATTGCTTACATGCGTCTGGCCTTTGATCAACAACAGCAAGAC 840 Query 1202 CTTGTTGATGCTGCATCAAAAGCTCTTTCATATAGACAAGATATAATTGAAGAGAATATC 1261 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 841 CTTGTTGATGCTGCATCAAAAGCTCTTTCATATAGACAAGATATAATTGAAGAGAATATC 900 Query 1262 CACCTCACATACCAACTACAGGCTGCACAACAAGAAAGAACAACATTTGTGCAGTCTCTG 1321 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 901 CACCTCACATACCAACTACAGGCTGCACAACAAGAAAGAACAACATTTGTGCAGTCTCTG 960 Query 1322 TTGCCTCTCCTTGCAGAATACTCTCTGCAGCCACCAGTTGTTGATGCTTATTCCATTGTC 1381 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 961 TTGCCTCTCCTTGCAGAATACTCTCTGCAGCCACCAGTTGTTGATGCTTATTCCATTGTC 1020 Query 1382 AGCAATGTCAAGGTTCTGTTTAAGCATTTGCAGGAGAAGCTTTTACTTACTGAGTCAAAA 1441 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1021 AGCAATGTCAAGGTTCTGTTTAAGCATTTGCAGGAGAAGCTTTTACTTACTGAGTCAAAA 1080 Query 1442 CTTAAGGAGTCACAGTATCAATTAGCACCGTGGCGTTCAGATATGAACCATTCTAATGCT 1501 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1081 CTTAAGGAGTCACAGTATCAATTAGCACCGTGGCGTTCAGATATGAACCATTCTAATGCT 1140 Query 1502 GCTCCACAGTCCCCATCTCATTCTACCACTGCAGCCATGGATACTTCAAACAAAATGGGG 1561 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1141 GCTCCACAGTCCCCATCTCATTCTACCACTGCAGCCATGGATACTTCAAACAAAATGGGG 1200 Query 1562 CTTGAATTGGTAGCGCAGCCAACATATTCCCATGGAAAGATACCAGCAAACTCTGAGACT 1621 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1201 CTTGAATTGGTAGCGCAGCCAACATATTCCCATGGAAAGATACCAGCAAACTCTGAGACT 1260 Query 1622 CAAGCAACCACAGATTGGGATTTGTTGGGTCACCACCAGGGTGAGTTGGGTGGTATCGGG 1681 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1261 CAAGCAACCACAGATTGGGATTTGTTGGGTCACCACCAGGGTGAGTTGGGTGGTATCGGG 1320 Query 1682 AAAACTCTGGTTGATGACATGAGAAGGCATTCACCTCTTGCAAGCAGGGATTCTGCTACC 1741 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1321 AAAACTCTGGTTGATGACATGAGAAGGCATTCACCTCTTGCAAGCAGGGATTCTGCTACC 1380 Query 1742 CAAGATATACCTGCGCAGCTTATTGGTACTCGTGATGATGTACATGCTTCTGAGTACGGT 1801 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1381 CAAGATATACCTGCGCAGCTTATTGGTACTCGTGATGATGTACATGCTTCTGAGTACGGT 1440 Query 1802 GAAGAAACTGCCAATAAGCAAGTTAAATTTCGTGTTCCTGTCAGCAACAGTGAGATGGAT 1861 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1441 GAAGAAACTGCCAATAAGCAAGTTAAATTTCGTGTTCCTGTCAGCAACAGTGAGATGGAT 1500 Query 1862 GAACCTGATGCTGTGGAGAACCAGAATGAGAGAGATCATTCATCCAATTGGGCTTCAGGA 1921 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1501 GAACCTGATGCTGTGGAGAACCAGAATGAGAGAGATCATTCATCCAATTGGGCTTCAGGA 1560 Query 1922 AATTCTGCTTACACAACCACACTTGATGATCCCAATTCCTCTTATTCTCCTTACCTGCCA 1981 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1561 AATTCTGCTTACACAACCACACTTGATGATCCCAATTCCTCTTATTCTCCTTACCTGCCA 1620 Query 1982 CCTGTTCTTGAAGAACCCTCTTCCTCATTTTCTGAGGCCGCAGATGATGATCCGTTGCCA 2041 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1621 CCTGTTCTTGAAGAACCCTCTTCCTCATTTTCTGAGGCCGCAGATGATGATCCGTTGCCA 1680 Query 2042 GCTATAGAGGGCCTTCAAATTTCGGGAGAAGCTTTTCCAGGACGACAACTCCAGGCATGC 2101 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1681 GCTATAGAGGGCCTTCAAATTTCGGGAGAAGCTTTTCCAGGACGACAACTCCAGGCATGC 1740 Query 2102 GGATACTCTATTAATGGAACTACTAGTTGTAATTTTGAGTGGGTACGACATCTGGAAGAT 2161 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1741 GGATACTCTATTAATGGAACTACTAGTTGTAATTTTGAGTGGGTACGACATCTGGAAGAT 1800 Query 2162 GGATCTGTTAATTACATAGAGGGAGCAAAGCAGCCAAACTATCTTATTACTGCTGATGAT 2221 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1801 GGATCTGTTAATTACATAGAGGGAGCAAAGCAGCCAAACTATCTTATTACTGCTGATGAT 1860 Query 2222 GTTGATACATATCTTGCTATAGAAGTGCAGCCTTTGGATGATCGGAAGCGTAAG 2275 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1861 GTTGATACATATCTTGCTATAGAAGTGCAGCCTTTGGATGATCGGAAGCGTAAG 1914 Lambda K H 1.33 0.621 1.12 Gapped Lambda K H 1.28 0.460 0.850 Effective search space used: 70659099940 Database: Cclementina_182_v1.0.cds_primaryTranscriptOnly_annot.fasta Posted date: Jul 14, 2015 1:42 PM Number of letters in database: 30,654,468 Number of sequences in database: 24,533 Matrix: blastn matrix 1 -2 Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5