BLASTN 2.11.0+ Reference: Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000), "A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000; 7(1-2):203-14. Database: Dcitri_transcriptome.fasta 60,261 sequences; 104,618,276 total letters Query= Dcitr03g19820.1.1 Length=1742 Score E Sequences producing significant alignments: (Bits) Value DcDTr00931.31Unknown protein 3127 0.0 DcDTi17567.1| Nucleoporin autopeptidase Chr1:3407265-3412045 REVE... 337 5e-91 DcDTi10148.1Unknown protein 337 5e-91 >DcDTr00931.31 Unknown protein Length=7367 Score = 3127 bits (1693), Expect = 0.0 Identities = 1702/1706 (99%), Gaps = 1/1706 (0%) Strand=Plus/Minus Query 37 TTACACTATGCTCAAGCATCCAGGCCCGAATCCAACTAGAGAATATCACCCAGAACGTCG 96 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2176 TTACA-GATGCTCAAGCATCCAGGCCCGAATCCAACTAGAGAATATCACCCAGAACGTCG 2118 Query 97 GCATTCTCCCAATCAACCTCGGACAAGCCGTGATTCAGGACTCATATTTTACAAATGTAC 156 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct 2117 GCATTCTCCCAATCAACCTCGGACAAGCCGTGATTCAGGACTCATACTTTACAAATGTAC 2058 Query 157 ATACCTATAATTATTCTAAATTCCCTTCTCAGTTTGAATCATTAACTAATTTAACTAATA 216 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2057 ATACCTATAATTATTCTAAATTCCCTTCTCAGTTTGAATCATTAACTAATTTAACTAATA 1998 Query 217 AACTTATTAGTGGTATAGATGGAAATACTCATGTAAATAATATAGCCATCTTAACAGAAC 276 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1997 AACTTATTAGTGGTATAGATGGAAATACTCATGTAAATAATATAGCCATCTTAACAGAAC 1938 Query 277 TTCGTTCCGAAATTAATAACAAAATATTACTCCTAGATTTTCACTCAAGACGTAATAAAC 336 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1937 TTCGTTCCGAAATTAATAACAAAATATTACTCCTAGATTTTCACTCAAGACGTAATAAAC 1878 Query 337 GTTCACTTCTACCCATCCTAGGTAAAGGAATAAAATTTATAACAGGAAATCTTGACAGTG 396 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1877 GTTCACTTCTACCCATCCTAGGTAAAGGAATAAAATTTATAACAGGAAATCTTGACAGTG 1818 Query 397 ACGATGCTGAAAAATTCAACGAAATTATTAAAGATGCCCGTAAAGATCAGGATAGACTTC 456 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1817 ACGATGCTGAAAAATTCAACGAAATTATTAAAGATGCCCGTAAAGATCAGGATAGACTTC 1758 Query 457 AGAAGCAGTCTGAATTACAGTATTCCTTTAGCAAGATAACCTCTGAAAAGTATGATAATC 516 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1757 AGAAGCAGTCTGAATTACAGTATTCCTTTAGCAAGATAACCTCTGAAAAGTATGATAATC 1698 Query 517 TTACCCAACAGCTTATCAGTAATGAACAAGCTCTGGCGAAAAAGATAAATCAAATCATAA 576 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1697 TTACCCAACAGCTTATCAGTAATGAACAAGCTCTGGCGAAAAAGATAAATCAAATCATAA 1638 Query 577 TCTCCAAAAACGATAACTACAACACCGTGATAGAAATAGAACTCGGACAGTTGATATTAT 636 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1637 TCTCCAAAAACGATAACTACAACACCGTGATAGAAATAGAACTCGGACAGTTGATATTAT 1578 Query 637 TGCATGAACATGTATTCCGAGCCCTCGAAAAACTCGAAACCATGGTTGCTTATTGTGCAA 696 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1577 TGCATGAACATGTATTCCGAGCCCTCGAAAAACTCGAAACCATGGTTGCTTATTGTGCAA 1518 Query 697 TGGGTAAACACCATCCTTCAATCCTTTCTTATCAGGAGCTATCCCATACCTATTCCTTTA 756 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1517 TGGGTAAATACCATCCTTCAATCCTTTCTTATCAGGAGCTATCCCATACCTATTCCTTTA 1458 Query 757 TTCAAACCACCTATCCACATAAGTTTCAATTTTCCCCAACAAATATGATTGATATGGAGA 816 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1457 TTCAAACCACCTATCCACATAAGTTTCAATTTTCCCCAACAAATATGATTGATATGGAGA 1398 Query 817 AAACTATTAAGACGTCTTGTACCAGTATTGATCATGCCATTTATTTTTTTGTATCTATAC 876 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1397 AAACTATTAAGACGTCTTGTACCAGTATTGATCATGCCATTTATTTTTTTGTATCTATAC 1338 Query 877 CTATGTTCACGGAAGAATTATTCGAATATTATTATCTTTTACCAATACCTTTTAAACGTA 936 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1337 CTATGTTCACGGAAGAATTATTCGAATATTATTATCTTTTACCAATACCTTTTAAACGTA 1278 Query 937 ATGATCAGATTTTGTCCATGGTTCCTGAGCATAGAATTGTACTAAAGGGAGCCAACAGAA 996 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1277 ATGATCAGATTTTGTCCATGGTTCCTGAGCATAGAATTGTACTAAAGGGAGCCAACAGAA 1218 Query 997 CTTACTCGACTAATAAAGATTGTATTTTTGGTAATCAATACCAGTGCTACCAAAAAAATT 1056 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1217 CTTACTCGACTAATAAAGATTGTATTTTTGGTAATCAATACCAGTGCTACCAAAAAAATT 1158 Query 1057 TAGAACTAGGCAGCTCTTGTGAAAATCAAATATTGTCTTTAAATTTAGAACATTGTATAT 1116 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1157 TAGAACTAGGCAGCTCTTGTGAAAATCAAATATTGTCTTTAAATTTAGAACATTGTATAT 1098 Query 1117 TCACCGAATTACATATAACAAATCAAGTAGAATTTGTACCCATGTTAAACTCTTACTTGC 1176 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1097 TCACCGAATTACATATAACAAATCAAGTAGAATTTGTACCCATGTTAAACTCTTACTTGC 1038 Query 1177 TTTCCTTGTTCAAGCCTACAGTACTCCACATTCAAGGATCACAAGGAGAAATATTGGATT 1236 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1037 TTTCCTTGTTCAAGCCTACAGTACTCCACATTCAAGGATCACAAGGAGAAATATTGGATT 978 Query 1237 ATCTTTCAGGAATATTACTTCTGAATGCTACCGATATTACTCTTAAGATTTTCAATAATA 1296 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 977 ATCTTTCAGGAATATTACTTCTGAATGCTACCGATATTACTCTTAAGATTTTCAATAATA 918 Query 1297 CGTACAGAAATTCAATATCCTCTAATGGGAAGATGTTAACGATCCCCAGCCCCAAAAACT 1356 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 917 CGTACAGAAATTCAATATCCTCTAATGGGAAGATGTTAACGATCCCCAGCCCCAAAAACT 858 Query 1357 TTACAATTTTACCTAATCAGATATCTCCCATTGTCATAGATACAGGATTTTCAACATTTC 1416 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 857 TTACAATTTTACCTAATCAGATATCTCCCATTGTCATAGATACAGGATTTTCAACATTTC 798 Query 1417 AGAACCTGGATTTAAATAAATTGATCCCCTCTACCCTGAACCATCGATTATTTTTTGAAG 1476 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 797 AGAACCTGGATTTAAATAAATTGATCCCCTCTACCCTGAACCATCGATTATTTTTTGAAG 738 Query 1477 AAGAAAATTATTCGTGGAAATTAATTGTATTTGTAATATTAATATTAGTTGTTACTTATA 1536 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 737 AAGAAAATTATTCGTGGAAATTAATTGTATTTGTAATATTAATATTAGTTGTTACTTATA 678 Query 1537 TTTGTATTCACTATGTACTTAGATGTGTCAGGACCTTCCAAAAAGACAAATCTACCATTG 1596 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 677 TTTGTATTCACTATGTACTTAGATGTGTCAGGACCTTCCAAAAAGACAAATCTACCATTG 618 Query 1597 AGAAATTAATTCCCCAACCAGTACCAATGCAGGAACCTTTTGTTCGACCATATGTTTTCA 1656 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 617 AGAAATTAATTCCCCAACCAGTACCAATGCAGGAACCTTTTGTTCGACCATATGTTTTCA 558 Query 1657 AATTTAACCCTACCCCTGAACAGTTGTCCGCCAATAGACCAATGAACTACCCTCTTGGGC 1716 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 557 AATTTAACCCTACCCCTGAACAGTTGTCCGCCAATAGACCAATGAACTACCCTCTTGGGC 498 Query 1717 CCTATTATCCACCTGGTGGGAATTAA 1742 |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 497 CCTATTATCCACCTGGTGGGAATTAA 472 >DcDTi17567.1 | Nucleoporin autopeptidase Chr1:3407265-3412045 REVERSE LENGTH=1041 201606 Length=4415 Score = 337 bits (182), Expect = 5e-91 Identities = 384/483 (80%), Gaps = 8/483 (2%) Strand=Plus/Minus Query 53 CATCCAGGCCCGAATCCAACTAGAGAATATCACCCAGAACGTCGGCATTCTCCCAATCAA 112 |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| || || || || |||||||| Sbjct 2065 CATCCAATCCCGAATCCAACTAGAAAATATCACCCAGAATGTTGGAATCCTTCCAATCAA 2006 Query 113 CCTCGGACAAGCCGTGATTCAGGACTCATATTTTACAAATGTACATACCTATAATTATTC 172 ||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| || ||||| || Sbjct 2005 CCTCGGACAGGCCGTGATTCAGGATTCTTATTTTACAAATGTACATACTTAAAATTACTC 1946 Query 173 TAAATTCCCTTCTCAGTTTGAATCAT-TAACTAATTTAACTAATAAACTT-A-TTAGTGG 229 ||| || || | || || ||| | | | | ||||||||||| | | | | | || | Sbjct 1945 TAAGTTTTCTCCCCAATTCGAA-CGTCTTTCGAATTTAACTAAGAGATTAAACTCAGGTG 1887 Query 230 TATAGATGGAAATACTCATGTAAATAATATAGCCAT-CTTAACAGAACTTCGTTCCGAAA 288 | || || || | ||||||||||||| || | || ||| |||||| || |||| Sbjct 1886 T-TA-ATAAAACTGTTCATGTAAATAATTTATCGATTTTTAGAAGAACTGAACTCTGAAA 1829 Query 289 TTAATAACAAAATATTACTCCTAGATTTTCACTCAAGACGTAATAAACGTTCACTTCTAC 348 |||| ||||| |||| |||| ||||||| || || | |||||||| ||||| ||||| | Sbjct 1828 TTAAGAACAAGATATCACTCTTAGATTTCCATTCTCGGCGTAATAAGCGTTCGCTTCTCC 1769 Query 349 CCATCCTAGGTAAAGGAATAAAATTTATAACAGGAAATCTTGACAGTGACGATGCTGAAA 408 || ||||||||| ||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| | |||| Sbjct 1768 CCGCTTTAGGTAAAGCAATTAAATTTAAAACGGGAAATCTTGACAGTGACGATTCAGAAA 1709 Query 409 AATTCAACGAAATTATTAAAGATGCCCGTAAAGATCAGGATAGACTTCAGAAGCAGTCTG 468 ||||||| ||||| |||||||||| ||| |||||||| ||||| ||||| || || |||| Sbjct 1708 AATTCAAAGAAATCATTAAAGATGTCCGAAAAGATCAAGATAGGCTTCAAAAACAATCTG 1649 Query 469 AATTACAGTATTCCTTTAGCAAGA-TAACCTCTGAAAAGTATGATAATCTTACCCAACAG 527 ||||||| || || |||||||| | |||| |||||||| || |||||| | || || || Sbjct 1648 AATTACAATACTCTTTTAGCAAAAATAACTTCTGAAAAATACGATAATTTGACACAGCAA 1589 Query 528 CTT 530 ||| Sbjct 1588 CTT 1586 >DcDTi10148.1 Unknown protein Length=7432 Score = 337 bits (182), Expect = 5e-91 Identities = 384/483 (80%), Gaps = 8/483 (2%) Strand=Plus/Minus Query 53 CATCCAGGCCCGAATCCAACTAGAGAATATCACCCAGAACGTCGGCATTCTCCCAATCAA 112 |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| || || || || |||||||| Sbjct 5505 CATCCAATCCCGAATCCAACTAGAAAATATCACCCAGAATGTTGGAATCCTTCCAATCAA 5446 Query 113 CCTCGGACAAGCCGTGATTCAGGACTCATATTTTACAAATGTACATACCTATAATTATTC 172 ||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| || ||||| || Sbjct 5445 CCTCGGACAGGCCGTGATTCAGGATTCTTATTTTACAAATGTACATACTTAAAATTACTC 5386 Query 173 TAAATTCCCTTCTCAGTTTGAATCAT-TAACTAATTTAACTAATAAACTT-A-TTAGTGG 229 ||| || || | || || ||| | | | | ||||||||||| | | | | | || | Sbjct 5385 TAAGTTTTCTCCCCAATTCGAA-CGTCTTTCGAATTTAACTAAGAGATTAAACTCAGGTG 5327 Query 230 TATAGATGGAAATACTCATGTAAATAATATAGCCAT-CTTAACAGAACTTCGTTCCGAAA 288 | || || || | ||||||||||||| || | || ||| |||||| || |||| Sbjct 5326 T-TA-ATAAAACTGTTCATGTAAATAATTTATCGATTTTTAGAAGAACTGAACTCTGAAA 5269 Query 289 TTAATAACAAAATATTACTCCTAGATTTTCACTCAAGACGTAATAAACGTTCACTTCTAC 348 |||| ||||| |||| |||| ||||||| || || | |||||||| ||||| ||||| | Sbjct 5268 TTAAGAACAAGATATCACTCTTAGATTTCCATTCTCGGCGTAATAAGCGTTCGCTTCTCC 5209 Query 349 CCATCCTAGGTAAAGGAATAAAATTTATAACAGGAAATCTTGACAGTGACGATGCTGAAA 408 || ||||||||| ||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| | |||| Sbjct 5208 CCGCTTTAGGTAAAGCAATTAAATTTAAAACGGGAAATCTTGACAGTGACGATTCAGAAA 5149 Query 409 AATTCAACGAAATTATTAAAGATGCCCGTAAAGATCAGGATAGACTTCAGAAGCAGTCTG 468 ||||||| ||||| |||||||||| ||| |||||||| ||||| ||||| || || |||| Sbjct 5148 AATTCAAAGAAATCATTAAAGATGTCCGAAAAGATCAAGATAGGCTTCAAAAACAATCTG 5089 Query 469 AATTACAGTATTCCTTTAGCAAGA-TAACCTCTGAAAAGTATGATAATCTTACCCAACAG 527 ||||||| || || |||||||| | |||| |||||||| || |||||| | || || || Sbjct 5088 AATTACAATACTCTTTTAGCAAAAATAACTTCTGAAAAATACGATAATTTGACACAGCAA 5029 Query 528 CTT 530 ||| Sbjct 5028 CTT 5026 Lambda K H 1.33 0.622 1.13 Gapped Lambda K H 1.28 0.460 0.850 Effective search space used: 176629957735 Database: Dcitri_transcriptome.fasta Posted date: Apr 30, 2019 10:57 AM Number of letters in database: 104,618,276 Number of sequences in database: 60,261 Matrix: blastn matrix 1 -2 Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5