BLASTN 2.11.0+ Reference: Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000), "A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000; 7(1-2):203-14. Database: Dcitr_OGSv2.0_rna.fa 25,292 sequences; 49,157,538 total letters Query= Untitled_sequence Length=1581 Score E Sequences producing significant alignments: (Bits) Value DcitrM004680.1.1basement membrane-specific heparan sulfate proteo... 2916 0.0 DcitrM068925.1.1basement membrane-specific heparan sulfate proteo... 1906 0.0 >DcitrM004680.1.1 basement membrane-specific heparan sulfate proteoglycan core protein (AHRD V3.11 *-* tr|A0A1W4XE68|A0A1W4XE68_AGRPL). Similar to MCOT02135.0.CO XP_008479303.1. AED 0.01 Length=3465 Score = 2916 bits (1579), Expect = 0.0 Identities = 1581/1581 (100%), Gaps = 0/1581 (0%) Strand=Plus/Plus Query 1 ATGAATTTGTTAGCATTTGTGTGGGTACTTTTAGTCGGTACAAGTAAACTGATCAATGCA 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 290 ATGAATTTGTTAGCATTTGTGTGGGTACTTTTAGTCGGTACAAGTAAACTGATCAATGCA 349 Query 61 CATGTGGTATCCTGTGGAGAATTAAAGCTGCCAGGAATTTCTGGCATCATTACAAGCCCT 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 350 CATGTGGTATCCTGTGGAGAATTAAAGCTGCCAGGAATTTCTGGCATCATTACAAGCCCT 409 Query 121 GGATATCCCATGCACTACAAGAGTGGACTTAGTTGTCATTGGATCATACCTACCCCTCCC 180 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 410 GGATATCCCATGCACTACAAGAGTGGACTTAGTTGTCATTGGATCATACCTACCCCTCCC 469 Query 181 AATACAACATTGCAATTGAAGTTCCATGATCTTAACCTTGATCTGGACAGTGACTGTTCA 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 470 AATACAACATTGCAATTGAAGTTCCATGATCTTAACCTTGATCTGGACAGTGACTGTTCA 529 Query 241 AACAAGGCTCCCCACTCCTCTTGCTGTAAAAAGAATTACGTCTCCGTTCCTGCTCCAGGG 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 530 AACAAGGCTCCCCACTCCTCTTGCTGTAAAAAGAATTACGTCTCCGTTCCTGCTCCAGGG 589 Query 301 GGTGTTGGCACACGACACTACTGTGGCGATGCAGTCAATCTGATAAAGTATGACTTCTAT 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 590 GGTGTTGGCACACGACACTACTGTGGCGATGCAGTCAATCTGATAAAGTATGACTTCTAT 649 Query 361 TCTGTGGCACCACATGCAAGGGAAACAACAATCAAGTTCAAAACTTCATTCTCCAGCCTG 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 650 TCTGTGGCACCACATGCAAGGGAAACAACAATCAAGTTCAAAACTTCATTCTCCAGCCTG 709 Query 421 AAACGAGGCTTTCGACTTGAATACAGGTTGGTGAATAGCTCCAGTTGTGATCCATCTCAG 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 710 AAACGAGGCTTTCGACTTGAATACAGGTTGGTGAATAGCTCCAGTTGTGATCCATCTCAG 769 Query 481 TTTCAATGCGGTAATGGTGCTTGTCTGGAGAACAAGTTTAGATGTGATAACAAAGCAGAT 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 770 TTTCAATGCGGTAATGGTGCTTGTCTGGAGAACAAGTTTAGATGTGATAACAAAGCAGAT 829 Query 541 TGTGCGGACAAGTCAGATGAGCACAACTGTTATGAATGGTGTCAGTCCCAAGGCAAAGTC 600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 830 TGTGCGGACAAGTCAGATGAGCACAACTGTTATGAATGGTGTCAGTCCCAAGGCAAAGTC 889 Query 601 ATGTGTGGGATCTACCCTGATGTTCAGTGCTATGATAATCGAACCCAGGCCTGTGACTCA 660 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 890 ATGTGTGGGATCTACCCTGATGTTCAGTGCTATGATAATCGAACCCAGGCCTGTGACTCA 949 Query 661 GTAGCCGACTGTGATAACATGAAAGATGAGAAACATTGTCACACCGGTACCCTCCCCGTA 720 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 950 GTAGCCGACTGTGATAACATGAAAGATGAGAAACATTGTCACACCGGTACCCTCCCCGTA 1009 Query 721 GTGCTGTCCCTGCAGTGTGGGTCGGGGGAGACCTATACCAAGGAACAACATTGTAATGGC 780 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1010 GTGCTGTCCCTGCAGTGTGGGTCGGGGGAGACCTATACCAAGGAACAACATTGTAATGGC 1069 Query 781 GTGCTTGATTGTAAAGATGGTTCCGATGAGATGCATTGTTCCATCTGCAAGTCCATCAAG 840 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1070 GTGCTTGATTGTAAAGATGGTTCCGATGAGATGCATTGTTCCATCTGCAAGTCCATCAAG 1129 Query 841 GGCGAGCCCATAGGTCTAGACAAGCGATGTGACGATCACATCGACTGTGTGGATGGTTTA 900 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1130 GGCGAGCCCATAGGTCTAGACAAGCGATGTGACGATCACATCGACTGTGTGGATGGTTTA 1189 Query 901 GACGAGCTCGGGTGTCATCGGGAGTGTTCGGCGTCCATCCGATGTATCACGAAACGGAAC 960 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1190 GACGAGCTCGGGTGTCATCGGGAGTGTTCGGCGTCCATCCGATGTATCACGAAACGGAAC 1249 Query 961 GAATGCTTCCTCGTGTCGCAACGATGTGACGGGAGCTTTGATTGTGAAGATGGTAGTGAT 1020 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1250 GAATGCTTCCTCGTGTCGCAACGATGTGACGGGAGCTTTGATTGTGAAGATGGTAGTGAT 1309 Query 1021 GAGTGGATGTGTCCGGATAGTATGCTTGAGAGTTTGTCCCAAGCATGTCCTCGGTCGAGT 1080 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1310 GAGTGGATGTGTCCGGATAGTATGCTTGAGAGTTTGTCCCAAGCATGTCCTCGGTCGAGT 1369 Query 1081 GATAAGCGTTGCAGTAACTCCCAGTGTATTCCTAACGATATGTGGTGTAATGGGAGGTTA 1140 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1370 GATAAGCGTTGCAGTAACTCCCAGTGTATTCCTAACGATATGTGGTGTAATGGGAGGTTA 1429 Query 1141 GATTGTGCTGACGGGTCGGATGAAGAGAACTGTGACCTGATATCTGCCCATACCGAGTGT 1200 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1430 GATTGTGCTGACGGGTCGGATGAAGAGAACTGTGACCTGATATCTGCCCATACCGAGTGT 1489 Query 1201 CCTCGTGAAGAAGACAGAAGATGTAACAATCTAGCCTGTATCCCGCGCTCCTGCTGGTGT 1260 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1490 CCTCGTGAAGAAGACAGAAGATGTAACAATCTAGCCTGTATCCCGCGCTCCTGCTGGTGT 1549 Query 1261 AATGGTATCGATGAATGTGGTGATGCATCAGATGAAGAGGATTGTCTGCGTAATTCCATC 1320 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1550 AATGGTATCGATGAATGTGGTGATGCATCAGATGAAGAGGATTGTCTGCGTAATTCCATC 1609 Query 1321 ATTGCGGCTGCTATCATGGCTGCGCTACTGTGCGCACTGCTCGTTGTGATTGCGGTGGGG 1380 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1610 ATTGCGGCTGCTATCATGGCTGCGCTACTGTGCGCACTGCTCGTTGTGATTGCGGTGGGG 1669 Query 1381 TGTACGTGTCGTCTGTATAATCTGCGCATGATGTATGCGCATGGCTTTGTACATCCGCCT 1440 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1670 TGTACGTGTCGTCTGTATAATCTGCGCATGATGTATGCGCATGGCTTTGTACATCCGCCT 1729 Query 1441 CCTCTCTCGTTGAGACACAGGTTGGCACAGAATTCCCTCACCCTTCCCTCGATGCTGGAT 1500 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1730 CCTCTCTCGTTGAGACACAGGTTGGCACAGAATTCCCTCACCCTTCCCTCGATGCTGGAT 1789 Query 1501 GACNCCCGAACCTCCCCCCGCCTATTCTGTAGCGGTGGGCGAGTGTCCACCTCCTCCCAC 1560 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1790 GACNCCCGAACCTCCCCCCGCCTATTCTGTAGCGGTGGGCGAGTGTCCACCTCCTCCCAC 1849 Query 1561 ATCCATAGCGTCTCATCCTAG 1581 ||||||||||||||||||||| Sbjct 1850 ATCCATAGCGTCTCATCCTAG 1870 >DcitrM068925.1.1 basement membrane-specific heparan sulfate proteoglycan core protein (AHRD V3.11 *-* tr|A0A1W4XE68|A0A1W4XE68_AGRPL). AED 0.00 Length=2841 Score = 1906 bits (1032), Expect = 0.0 Identities = 1037/1039 (99%), Gaps = 1/1039 (0%) Strand=Plus/Plus Query 1 ATGAATTTGTTAGCATTTGTGTGGGTACTTTTAGTCGGTACAAGTAAACTGATCAATGCA 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 414 ATGAATTTGTTAGCATTTGTGTGGGTACTTTTAGTCGGTACAAGTAAACTGATCAATGCA 473 Query 61 CATGTGGTATCCTGTGGAGAATTAAAGCTGCCAGGAATTTCTGGCATCATTACAAGCCCT 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 474 CATGTGGTATCCTGTGGAGAATTAAAGCTGCCAGGAATTTCTGGCATCATTACAAGCCCT 533 Query 121 GGATATCCCATGCACTACAAGAGTGGACTTAGTTGTCATTGGATCATACCTACCCCTCCC 180 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 534 GGATAT-CCATGCACTACAAGAGTGGACTTAGTTGTCATTGGATCATACCTACCCCTCCC 592 Query 181 AATACAACATTGCAATTGAAGTTCCATGATCTTAACCTTGATCTGGACAGTGACTGTTCA 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 593 AATACAACATTGCAATTGAAGTTCCATGATCTTAACCTTGATCTGGACAGTGACTGTTCA 652 Query 241 AACAAGGCTCCCCACTCCTCTTGCTGTAAAAAGAATTACGTCTCCGTTCCTGCTCCAGGG 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 653 AACAAGGCTCCCCACTCCTCTTGCTGTAAAAAGAATTACGTCTCCGTTCCTGCTCCAGGG 712 Query 301 GGTGTTGGCACACGACACTACTGTGGCGATGCAGTCAATCTGATAAAGTATGACTTCTAT 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 713 GGTGTTGGCACACGACACTACTGTGGCGATGCAGTCAATCTGATAAAGTATGACTTCTAT 772 Query 361 TCTGTGGCACCACATGCAAGGGAAACAACAATCAAGTTCAAAACTTCATTCTCCAGCCTG 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 773 TCTGTGGCACCACATGCAAGGGAAACAACAATCAAGTTCAAAACTTCATTCTCCAGCCTG 832 Query 421 AAACGAGGCTTTCGACTTGAATACAGGTTGGTGAATAGCTCCAGTTGTGATCCATCTCAG 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 833 AAACGAGGCTTTCGACTTGAATACAGGTTGGTGAATAGCTCCAGTTGTGATCCATCTCAG 892 Query 481 TTTCAATGCGGTAATGGTGCTTGTCTGGAGAACAAGTTTAGATGTGATAACAAAGCAGAT 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 893 TTTCAATGCGGTAATGGTGCTTGTCTGGAGAACAAGTTTAGATGTGATAACAAAGCAGAT 952 Query 541 TGTGCGGACAAGTCAGATGAGCACAACTGTTATGAATGGTGTCAGTCCCAAGGCAAAGTC 600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 953 TGTGCGGACAAGTCAGATGAGCACAACTGTTATGAATGGTGTCAGTCCCAAGGCAAAGTC 1012 Query 601 ATGTGTGGGATCTACCCTGATGTTCAGTGCTATGATAATCGAACCCAGGCCTGTGACTCA 660 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1013 ATGTGTGGGATCTACCCTGATGTTCAGTGCTATGATAATCGAACCCAGGCCTGTGACTCA 1072 Query 661 GTAGCCGACTGTGATAACATGAAAGATGAGAAACATTGTCACACCGGTACCCTCCCCGTA 720 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1073 GTAGCCGACTGTGATAACATGAAAGATGAGAAACATTGTCACACCGGTACCCTCCCCGTA 1132 Query 721 GTGCTGTCCCTGCAGTGTGGGTCGGGGGAGACCTATACCAAGGAACAACATTGTAATGGC 780 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1133 GTGCTGTCCCTGCAGTGTGGGTCGGGGGAGACCTATACCAAGGAACAACATTGTAATGGC 1192 Query 781 GTGCTTGATTGTAAAGATGGTTCCGATGAGATGCATTGTTCCATCTGCAAGTCCATCAAG 840 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1193 GTGCTTGATTGTAAAGATGGTTCCGATGAGATGCATTGTTCCATCTGCAAGTCCATCAAG 1252 Query 841 GGCGAGCCCATAGGTCTAGACAAGCGATGTGACGATCACATCGACTGTGTGGATGGTTTA 900 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1253 GGCGAGCCCATAGGTCTAGACAAGCGATGTGACGATCACATCGACTGTGTGGATGGTTTA 1312 Query 901 GACGAGCTCGGGTGTCATCGGGAGTGTTCGGCGTCCATCCGATGTATCACGAAACGGAAC 960 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1313 GACGAGCTCGGGTGTCATCGGGAGTGTTCGGCGTCCATCCGATGTATCACGAAACGGAAC 1372 Query 961 GAATGCTTCCTCGTGTCGCAACGATGTGACGGGAGCTTTGATTGTGAAGATGGTAGTGAT 1020 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct 1373 GAATGCTTCCTCGTGTCGCAACGATGTGACGGGAGATTTGATTGTGAAGATGGTAGTGAT 1432 Query 1021 GAGTGGATGTGTCCGGATA 1039 ||||||||||||||||||| Sbjct 1433 GAGTGGATGTGTCCGGATA 1451 Score = 1323 bits (716), Expect = 0.0 Identities = 785/815 (96%), Gaps = 19/815 (2%) Strand=Plus/Plus Query 785 TTGATTGTAAAGATGGTTCCGATGAGATGCAT-TGT-----T-CCATCTGCAAGTCCATC 837 |||||||| |||||||| |||||| || || ||| | ||||||||||||||||| Sbjct 1410 TTGATTGTGAAGATGGTAGTGATGAG-TGGATGTGTCCGGATACCATCTGCAAGTCCATC 1468 Query 838 AAGGGCGAGCCCATAGGTCTAGACAAGCGATGTGACGATCACATCGACTGTGTGGATGGT 897 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1469 AAGGGCGAGCCCATAGGTCTAGACAAGCGATGTGACGATCACATCGACTGTGTGGATGGT 1528 Query 898 TTAGACGAGCTCGGGTGTCATCGGGAGTGTTCGGCGTCCATCCGATGTATCACGAAACGG 957 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1529 TTAGACGAGCTCGGGTGTCATCGGGAGTGTTCGGCGTCCATCCGATGTATCACGAAACGG 1588 Query 958 AACGAATGCTTCCTCGTGTCGCAACGATGTGACGGGAGCTTTGATTGTGAAGATGGTAGT 1017 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct 1589 AACGAATGCTTCCTCGTGTCGCAACGATGTGACGGGAGATTTGATTGTGAAGATGGTAGT 1648 Query 1018 GATGAGTGGATGTGTCCGGATAGTATGCTTGAGAGTTTGTCCCAAGCATGTCCTCGGTCG 1077 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1649 GATGAGTGGATGTGTCCGGATAGTATGCTTGAGAGTTTGTCCCAAGCATGTCCTCGGTCG 1708 Query 1078 AGTGATAAGCGTTGCAGTAACTCCCAGTGTATTCCTAACGATATGTGGTGTAATGGGAGG 1137 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1709 AGTGATAAGCGTTGCAGTAACTCCCAGTGTATTCCTAACGATATGTGGTGTAATGGGAGG 1768 Query 1138 TTAGATTGTGCTGACGGGTCGGATGAAGAGAACTGTGACCTGATATCTGCCCATACCGAG 1197 || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct 1769 TTTGATTGTGCTGACGGGTCGGATGAAAAGAACTGTGACTTGATATCTGCCCATACCGAG 1828 Query 1198 TGTCCTCGTGAAGAAGACAGAAGATGTAACAATCTAGCCTGTATCCCGCGCTCCTGCTGG 1257 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1829 TGTCCTCGTGAAGAAGACAGAAGATGTAACAATCTAGCCTGTATCCCGCGCTCCTGCTGG 1888 Query 1258 TGTAATGGTATCGATGAATGTGGTGATGCATCAGATGAAGAGGATTGTCTGCGTAATTCC 1317 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1889 TGTAATGGTATCGATGAATGTGGTGATGCATCAGATGAAGAGGATTGTCTGCGTAATTCC 1948 Query 1318 ATCATTGCGGCTGCTATCATGGCTGCGCTACTGTGCGCACTGCTCGTTGTGATTGCGGTG 1377 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct 1949 ATCATTGCGGCTGCTATCATGGCTGCGCTACTGTGCGCACTACTCGTTGTGATTGCGGTG 2008 Query 1378 GGGTGTACGTGTCGTCTGTATAATCTGCGCATGATGTATGCGCATGGCTTTGTACATCCG 1437 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2009 GGGTGTACGTGTCGTCTGTATAATCTGCGCATGATGTATGCGCATGGCTTTGTACATCCG 2068 Query 1438 CCTCCTCTCTCGTTGAGACACAGGTTGGCACAGAATTCCCTCACCCTTCCCTCGATGCTG 1497 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2069 CCTCCTCTCTCGTTGAGACACAGGTTGGCACAGAATTCCCTCACCCTTCCCTCGATGCTG 2128 Query 1498 GATGACN-----------CCCGAACCTCCCCCCGCCTATTCTGTAGCGGTGGGCGAGTGT 1546 |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2129 GATGACGAGTTCTATCATCCCGAACCTCCCCCCGCCTATTCTGTAGCGGTGGGCGAGTGT 2188 Query 1547 CCACCTCCTCCCACATCCATAGCGTCTCATCCTAG 1581 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2189 CCACCTCCTCCCACATCCATAGCGTCTCATCCTAG 2223 Lambda K H 1.33 0.621 1.12 Gapped Lambda K H 1.28 0.460 0.850 Effective search space used: 75417416030 Database: Dcitr_OGSv2.0_rna.fa Posted date: Mar 4, 2018 10:37 PM Number of letters in database: 49,157,538 Number of sequences in database: 25,292 Matrix: blastn matrix 1 -2 Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5