BLASTN 2.11.0+ Reference: Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000), "A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000; 7(1-2):203-14. Database: SS_all_quivered_hq.fasta 42,166 sequences; 76,657,983 total letters Query= Untitled_sequence Length=1098 Score E Sequences producing significant alignments: (Bits) Value c180821/f2p10/2521isoform=c180821;full_length_coverage=2;non_full... 1989 0.0 c225953/f4p10/2026isoform=c225953;full_length_coverage=4;non_full... 1980 0.0 >c180821/f2p10/2521 isoform=c180821;full_length_coverage=2;non_full_length_coverage=10;isoform_length=2521 Length=2521 Score = 1989 bits (1077), Expect = 0.0 Identities = 1091/1098 (99%), Gaps = 0/1098 (0%) Strand=Plus/Plus Query 1 ATGTTGGTGCCATCGGACATGATGGCTGCTCAGTCCAAGATTTTGTATCAACTCAACAAG 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 292 ATGTTGGTGCCATCGGACATGATGGCTGCTCAGTCCAAGATTTTGTATCAACTCAACAAG 351 Query 61 TATTATGGAGAACGAGTACAAACAAGGAAAGCTAGTATTGCTAAGACAATCCGTGAAGTA 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 352 TATTATGGAGAACGAGTACAAACAAGGAAAGCTAGTATTGCTAAGACAATCCGTGAAGTA 411 Query 121 TGTAAAGTTGTGCAGGATGTGTTACGAGAAGTGGAGGTGCAGGAACCAAGGTTCATCTCT 180 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 412 TGTAAAGTTGTGCAGGATGTGTTACGAGAAGTGGAGGTGCAGGAACCAAGGTTCATCTCT 471 Query 181 TCCCTTACAGAGTGTAACGGTAGATTTGAAGGATTGGATGTTATAACACCTACAGAGTTT 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 472 TCCCTTACAGAGTGTAACGGTAGATTTGAAGGATTGGATGTTATAACACCTACAGAGTTT 531 Query 241 GAAGTAGTGCTTTACCTCAATCAGATGGGAGAGTTGAACTTTGTGGATGATGGCTCACTG 300 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct 532 GAAGTAGTGCTTTACCTCAATCAGATGGGAGAGTTAAACTTTGTGGATGATGGCTCACTG 591 Query 301 CCTGGATGTGCTGTTCTGAAACTAAGTGATGGTAGGAAGAGGAGTATGTCCCTCTGGGTG 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 592 CCTGGATGTGCTGTTCTGAAACTAAGTGATGGTAGGAAGAGGAGTATGTCCCTCTGGGTG 651 Query 361 GAGTTCATAACAGCTAGTGGCTATCTATCCGCCAGGAAGATGAGATCCAGATTCCAAACT 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 652 GAGTTCATAACAGCTAGTGGCTATCTATCCGCCAGGAAGATGAGATCCAGATTCCAAACT 711 Query 421 CTAGTCGCTCAGGCCTGTGATAAATGTGCTTACAGAGATAGCGTCAAGATGATTGCTGAC 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 712 CTAGTCGCTCAGGCCTGTGATAAATGTGCTTACAGAGATAGCGTCAAGATGATTGCTGAC 771 Query 481 ACGACAGAGGTGAAGCTTAGGATAAGAGAGCGATACATTGTACAGATAACACCATCATTC 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 772 ACGACAGAGGTGAAGCTTAGGATAAGAGAGCGATACATTGTACAGATAACACCATCATTC 831 Query 541 AAATGTGGTGGGATCTGGCCTCGGTCTGCAGGTCACTGGCCTCTTCCTCAAATCCCATGG 600 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| Sbjct 832 AAATGTGGTGGGATCTGGCCTCGGTCTGCAGGTCATTGGCCTCTTCCTCAGATCCCATGG 891 Query 601 CCTCATCCCAACCTGGTGGTAGAAACAAAGACTGAAGGATGTGACCTATTGTCCAAGGAA 660 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct 892 CCTCATCCCAACCTGGTGGTAGAAACAAAGACTGAAGGGTGTGACCTATTGTCCAAGGAA 951 Query 661 TGTGCTGCTATGCAAGGCAAACAGTCAGCCATGGAAGGCGATGCTTGGGTGATGTCATTC 720 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct 952 TGTGCTGCTATGCAAGGCAAACAGTCAGCCATGGAAGGAGATGCTTGGGTGATGTCATTC 1011 Query 721 ACAGATGTCGAGAGTAAACTGCTGATTGGTGGTTGCAGGAAGAAGTGTCTCAGTATTCTG 780 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1012 ACAGATGTCGAGAGCAAACTGCTGATTGGTGGTTGCAGGAAGAAGTGTCTCAGTATTCTG 1071 Query 781 AAAACATTGCGGGATCGTCATCTAGAACTACCAGGAAATCCTGTAACCAACTATCACATG 840 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1072 AAAACATTGCGGGATCGTCATCTAGAACTACCAGGAAATCCTGTAACCAACTATCACATG 1131 Query 841 AAAACACTTCTGCTTTATGAGTGTGAAAAACATCCCAATGAATTGGAATGGGATGAATCT 900 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1132 AAAACACTTCTGCTTTATGAGTGCGAAAAACATCCCAATGAATTGGAATGGGATGAATCT 1191 Query 901 TGCCTAGGAGATAGAATCAATGGCATTCTCTTACAACTCATATCTTGTCTTCAATGCAGG 960 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1192 TGCCTAGGAGATAGAATCAATGGCATTCTCTTACAACTCATATCTTGTCTTCAATGCAGG 1251 Query 961 CGGTGTCCCCATTACTTCCTGCCTCATCTAGATCTATTCAAAGGAAAATCACCAAGTGCT 1020 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1252 CGGTGTCCCCATTACTTCCTGCCTCATCTAGATCTATTCAAAGGAAAATCACCAAGTGCT 1311 Query 1021 TTAGAAAATGCTGCAAAGCAAGTGTGGCGATTAACCCGGGAATTGCTAACAAATTCAAGA 1080 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1312 TTAGAAAATGCTGCAAAGCAAGTGTGGCGATTAACCCGGGAATTGCTAACAAATTCAAGA 1371 Query 1081 GCTCTGGATAAGCTCTAG 1098 |||||||||||||||||| Sbjct 1372 GCTCTGGATAAGCTCTAG 1389 >c225953/f4p10/2026 isoform=c225953;full_length_coverage=4;non_full_length_coverage=10;isoform_length=2026 Length=2026 Score = 1980 bits (1072), Expect = 0.0 Identities = 1090/1098 (99%), Gaps = 4/1098 (0%) Strand=Plus/Plus Query 1 ATGTTGGTGCCATCGGACATGATGGCTGCTCAGTCCAAGATTTTGTATCAACTCAACAAG 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 446 ATGTTGGTGCCATCGGACATGATGGCTGCTCAGTCCAAGATTTTGTATCAACTCAACAAG 505 Query 61 TATTATGGAGAACGAGTACAAACAAGGAAAGCTAGTATTGCTAAGACAATCCGTGAAGTA 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 506 TATTATGGAGAACGAGTACAAACAAGGAAAGCTAGTATTGCTAAGACAATCCGTGAAGTA 565 Query 121 TGTAAAGTTGTGCAGGATGTGTTACGAGAAGTGGAGGTGCAGGAACCAAGGTTCATCTCT 180 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 566 TGTAAAGTTGTGCAGGATGTGTTACGAGAAGTGGAGGTGCAGGAACCAAGGTTCATCTCT 625 Query 181 TCCCTTACAGAGTGTAACGGTAGATTTGAAGGATTGGATGTTATAACACCTACAGAGTTT 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 626 TCCCTTACAGAGTGTAACGGTAGATTTGAAGGATTGGATGTTATAACACCTACAGAGTTT 685 Query 241 GAAGTAGTGCTTTACCTCAATCAGATGGGAGAGTTGAACTTTGTGGATGATGGCTCACTG 300 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct 686 GAAGTAGTGCTTTACCTCAATCAGATGGGAGAGTTAAACTTTGTGGATGATGGCTCACTG 745 Query 301 CCTGGATGTGCTGTTCTGAAACTAAGTGATGGTAGGAAGAGGAGTATGTCCCTCTGGGTG 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 746 CCTGGATGTGCTGTTCTGAAACTAAGTGATGGTAGGAAGAGGAGTATGTCCCTCTGGGTG 805 Query 361 GAGTTCATAACAGCTAGTGGCTATCTATCCGCCAGGAAGATGAGATCCAGATTCCAAACT 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 806 GAGTTCATAACAGCTAGTGGCTATCTATCCGCCAGGAAGATGAGATCCAGATTCCAAACT 865 Query 421 CTAGTCGCTCAGGCCTGTGATAAATGTGCTTACAGAGATAGCGTCAAGATGATTGCTGAC 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 866 CTAGTCGCTCAGGCCTGTGATAAATGTGCTTACAGAGATAGCGTCAAGATGATTGCTGAC 925 Query 481 ACGACAGAGGTGAAGCTTAGGATAAGAGAGCGATACATTGTACAGATAACACCATCATTC 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 926 ACGACAGAGGTGAAGCTTAGGATAAGAGAGCGATACATTGTACAGATAACACCATCATTC 985 Query 541 AAATGTGGTGGGATCTGGCCTCGGTCTGCAGGTCACTGGCCTCTTCCTCAAATCCCATGG 600 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| Sbjct 986 AAATGTGGTGGGATCTGGCCTCGGTCTGCAGGTCA-TGGCCTCTTCCTC-AATCCCATGG 1043 Query 601 CCTCATCCCAACCTGGTGGTAGAAACAAAGACTGAAGGATGTGACCTATTGTCCAAGGAA 660 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct 1044 CCTCATCCCAACCTGGTGGTAGAAACAAAGACTGAAGGGTGTGACCTATTGTCCAAGGAA 1103 Query 661 TGTGCTGCTATGCAAGGCAAACAGTCAGCCATGGAAGGCGATGCTTGGGTGATGTCATTC 720 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct 1104 TGTGCTGCTATGCAAGGCAAACAGTCAGCCATGGAAGGAGATGCTTGGGTGATGTCATTC 1163 Query 721 ACAGATGTCGAGAGTAAACTGCTGATTGGTGGTTGCAGGAAGAAGTGTCTCAGTATTCTG 780 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1164 ACAGATGTCGAGAG-AAACTGCTGATTGGTGGTTGCAGGAAGAAGTGTCTCAGTATTCTG 1222 Query 781 AAAACATTGCGGGATCGTCATCTAGAACTACCAGGAAATCCTGTAACCAACTATCACATG 840 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1223 AAAACATTGCGGGATCGTCATCTAGAACTACCAGGAAATCCTGTAACCAACTATCACATG 1282 Query 841 AAAACACTTCTGCTTTATGAGTGTGAAAAACATCCCAATGAATTGGAATGGGATGAATCT 900 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1283 AAAACACTTCTGCTTTATGAGTGCGAAAAACATCCCAATGAATTGGAATGGGATGAATCT 1342 Query 901 TGCCTAGGAGATAGAATCAATGGCATTCTCTTACAACTCATATCTTGTCTTCAATGCAGG 960 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1343 TGCCTAGGAGATAGAATCAATGGCATTCTCTTACAACTCATATCTTGTCTTCAATGCAGG 1402 Query 961 CGGTGTCCCCATTACTTCCTGCCTCATCTAGATCTATTCAAAGGAAAATCACCAAGTGCT 1020 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1403 CGGTGTCCCCATTACTT-CTGCCTCATCTAGATCTATTCAAAGGAAAATCACCAAGTGCT 1461 Query 1021 TTAGAAAATGCTGCAAAGCAAGTGTGGCGATTAACCCGGGAATTGCTAACAAATTCAAGA 1080 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1462 TTAGAAAATGCTGCAAAGCAAGTGTGGCGATTAACCCGGGAATTGCTAACAAATTCAAGA 1521 Query 1081 GCTCTGGATAAGCTCTAG 1098 |||||||||||||||||| Sbjct 1522 GCTCTGGATAAGCTCTAG 1539 Lambda K H 1.33 0.621 1.12 Gapped Lambda K H 1.28 0.460 0.850 Effective search space used: 81002107024 Database: SS_all_quivered_hq.fasta Posted date: Feb 25, 2019 4:32 PM Number of letters in database: 76,657,983 Number of sequences in database: 42,166 Matrix: blastn matrix 1 -2 Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5