BLASTN 2.11.0+ Reference: Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000), "A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000; 7(1-2):203-14. Database: Dcitr_OGSv2.0_rna.fa 25,292 sequences; 49,157,538 total letters Query= Untitled_sequence Length=3069 Score E Sequences producing significant alignments: (Bits) Value DcitrM023860.1.1SFRICE_021358 (AHRD V3.11 *** tr|A0A2H1W6L6|A0A2H... 3079 0.0 >DcitrM023860.1.1 SFRICE_021358 (AHRD V3.11 *** tr|A0A2H1W6L6|A0A2H1W6L6_SPOFR). AED 0.18 Length=3105 Score = 3079 bits (1667), Expect = 0.0 Identities = 1695/1709 (99%), Gaps = 0/1709 (0%) Strand=Plus/Plus Query 663 AGCAAACAGTGACAAGATCAAATTTCCTGACCCGAAGGATTTTCGAATAGCGATCGTCGA 722 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 765 AGCAAACAGTGACAAGATCAAATTTCCTGACCCGAAGGATTTTCGAATAGCGATCGTCGA 824 Query 723 GTCGACTAACTGTATTCATTTGAGAATTGGCTTTCTTCCAAACTATGAAATATTACCCGA 782 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct 825 GTCGACTAACTGTATTCATTTGAGAATTGGCTTTCTTCCAAACTATGAAATATTGCCCGA 884 Query 783 GACTGTGGATGCTGAGGTGGATGTGACCTTGATTTTGGCTATCGAATTCCAAGGATGGCC 842 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 885 GACTGTGGATGCCGAGGTGGATGTGACCTTGATTTTGGCTATCGAATTCCAAGGATGGCC 944 Query 843 GCGGACCACGGATTTTCCATCGCGAATTCCACTGTCCCACATTGACGCCTTGTTTTTCCA 902 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 945 GCGGACCACGGATTTTCCATCGCGAATTCCACTGTCCCACATTGACGCCTTGTTTTTCCA 1004 Query 903 GAACATGGCTACTACGGGGTTTTACATGATGCCCGCCGTTCCTCATCCCACAGTCCGTTG 962 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1005 GAACATGGCTACTACGGGGTTTTACATGATGCCCGCCGTTCCTCATCCCACAGTCCGTTG 1064 Query 963 TGACGATCGCAAGCTGTGTTGGCAGTTTCGCTTCCCTATTGCTGAATCCATGATGATGAC 1022 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct 1065 TGACGATCGCAAGCTGTGTTGGCAGTTTCGCTTCCCTGTTGCTGAATCCATGATGATGAC 1124 Query 1023 CAACTATTCCAGTAACAGCCTTATCAACAAGGTCTATCGTATTCTAATCACCATTTTGGA 1082 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1125 CAACTATTCCAATAACAGCCTTATCAACAAGGTCTATCGTATTCTAATCACCATTTTGGA 1184 Query 1083 AGACATCAGACGGTCTAGCACTGCAGGTCGAGTCACCAGTCGTTATATGATCAAAACAAT 1142 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct 1185 AGACATCAGACGGTCTAGCACTGCAGGTCGAGTCACTAGTCGTTATATGATCAAAACAAT 1244 Query 1143 CCTGTGGTACAGGTTAGAGAGAACGGGGGAATGCTGCCTGAATACACTGAACAAATGGAA 1202 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1245 CCTGTGGTACAGGTTAGAGAGAACGGGGGAATGCTGCCTGAATACACTGAACAAATGGAA 1304 Query 1203 TGAAAGCTCGCTGTCTTTGCATGTTCTGCAACTAATGGACAACTTGGCAGCTGCTTTGAA 1262 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1305 TGAAAGCTCGCTGTCTTTGCATGTTCTGCAACTGATGGACAACTTGGCAGCTGCTTTGAA 1364 Query 1263 GACACAGAAATATCCATCCTACTTTTTTCCGGCGTATAATCTAATAATCAACTCACCGGG 1322 ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1365 GACACGGAAATTTCCATCCTACTTTTTTCCGGCGTATAATCTAATAATCAACTCACCGGG 1424 Query 1323 TGGAGGGGTGATGCATTACACTGAAGAAGATTACATCTATGACGCGGAAATTATTTCCAA 1382 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1425 TGGAGGGGTGATGCATTACACTGAAGAAGATTACATCTATGACGCGGAAATTATTTCCAA 1484 Query 1383 TTTGGTAGCCAGGTTTTTCGAGATTTCCCTCATACCCTCCCTCATTATTAACCCCAAGGA 1442 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1485 TTTGGTAGCCAGGTTTTTCGAGATTTCCCTCATACCCTCCCTCATTATTAACCCCAAGGA 1544 Query 1443 TGACTCCTATTGGTGTCGCCTGGAAGATGCCCTCCTCATCAAATGGGGTCATGTGCTGGA 1502 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1545 TGACTCCTATTGGTGTCGCCTGGAAGATGCCCTCCTCATCAAATGGGGTCATGTGCTGGA 1604 Query 1503 AGAATTACTTCCATTGAGGGATGCTAGACTCATTGGCATGCGACATTATTCTCTCAGACA 1562 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1605 AGAATTACTTCCATTGAGGGATGCTAGACTCATTGGCATGCGACATTATTCTCTCAGACA 1664 Query 1563 GGTCGATTACATTGGGGTTCTACTTCGTGGAATCCTGTCTGTGAAGTCAATGGTTTTGAA 1622 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1665 GGTCGATTACATTGGGGTTCTACTTCGTGGAATCCTGTCTGTGAAGTCAATGGTTTTGAA 1724 Query 1623 CGATTCAGCCGCCGGGGGTTGGTACGATAAAGAAATCAACAAAATCTTCATGAACAAAGA 1682 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1725 CGATTCAGCCGCCGGGGGTTGGTACGATAAAGAAATCAACAAAATCTTCATGAACAAAGA 1784 Query 1683 TGACAAGGATAGCATCACTCAGGATATTGTCTATCTTCTCAACGTCCTGTCTGAACAAGC 1742 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1785 TGACAAGGATAGCATCACTCAGGATATTGTCTATCTTCTCAACGTCCTGTCTGAACAAGC 1844 Query 1743 CAAGCACAGTTACTCGCTCCGGAAACAGACTATGACGAAGGATAAGAAAACCGTGCGTTT 1802 |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1845 CAAGCAAAGTTACACGCTCCGGAAACAGACTATGACGAAGGATAAGAAAACCGTGCGTTT 1904 Query 1803 GAAATCATTTGACCTGTCGTTCGCTACACTGCTCGATGACGTGAAGGCAGACTTGAAAAA 1862 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct 1905 GAAATCATTTGACCTGTCATTCGCTACACTGCTCGATGACGTGAAGGCAGATTTGAAAAA 1964 Query 1863 GGTCCACTTTGATTTTACGAATGACCAGATTTTGGTGTACTATATTTTAAAATGGCTTTA 1922 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1965 GGTCCACTTTGATTTTACGAATGACCAGATTTTGGTGTACTATATTTTAAAATGGCTTTA 2024 Query 1923 TCGAGGTTCTGAGCGTGATGGGAAATTTCTGGAGCCCGTACTGAAACCTTATCTAATCAA 1982 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2025 TCGAGGTTCTGAGCGTGATGGGAAATTTCTGGAGCCCGTACTGAAACCTTATCTAATCAA 2084 Query 1983 GTTATACATCGCTAGTCATGAGTGCAACTGGTTTTTGGAAGAATGGAAAGCCAGGATGAA 2042 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2085 GTTATACATCGCTAGTCATGAGTGCAACTGGTTTTTGGAAGAATGGAAAGCCAGGATGAA 2144 Query 2043 CAAGGACGAAATGTATGCCTTGAGGAAATACTGTCATCTGGTTGTCAAAGAACAAGTGAA 2102 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2145 CAAGGACGAAATGTATGCCTTGAGGAAGTACTGTCATCTGGTTGTCAAAGAACAAGTGAA 2204 Query 2103 CACTTCGGATGGACTATTGGACTGTGTGAATAAAGGCTGGGAGTGGGCAGGAACGATGTT 2162 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2205 CACTTCGGATGGACTATTGGACTGTGTGAATAAAGGCTGGGAGTGGGCAGGAACGATGTT 2264 Query 2163 GAATATTGTGGGAGAGACGAGTGACGGCCTGGACCTCATTTTCACCCCGTGCCCTCACCA 2222 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct 2265 GAATATTGTGGGAGAGACGAGTGACGGCCTGGACCTCATTTTCACCCCCTGCCCTCACCA 2324 Query 2223 GGCGTTGCGTCACCGGATGCGTATGTCACCGGACTCAGGCGGAGGCTTCATGACGCGTAG 2282 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2325 GGCGTTGCGTCACCGGATGCGTATGTCACCGGACTCAGGCGGAGGCTTCATGACGCGTAG 2384 Query 2283 CTTAGGCCGGACGCAACCGCAAAGGAAGAGCGACATGCATGCACTGACAACCTTCACCTT 2342 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2385 CTTAGGCCGGACGCAACCGCAAAGGAAGAGCGACATGCATGCACTGACAACCTTCACCTT 2444 Query 2343 GCCACGATTGAGTCGAAACTTGGAATCAA 2371 ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2445 GCCACGATTGAGTCGAAACTTGGAATCAA 2473 Score = 1181 bits (639), Expect = 0.0 Identities = 657/665 (99%), Gaps = 3/665 (0%) Strand=Plus/Plus Query 1 ATGGGCTGTACCTACAGTAATGAAATGGGCCCGGATAAGGGGGTTCTATTGGAATCTTGT 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 43 ATGGGCTGTACCTACAGTAATGAAATGGGCCCGGATAAGGGGGTTCTATTGGAATCTTGT 102 Query 61 GACATCCGATTTTCCGAACTCCAGTTGGAGACTATCAACAAACATTTGCACGATGTCTAT 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 103 GACATCCGATTTTCCGAACTCCAGTTGGAGACTATCAACAAACATTTGCACGATGTCTAT 162 Query 121 CTGAAGAAGTGTGATGCCAATTCCAGCAATCAATATGAGGTGGAGGTTATCATTGAACGA 180 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 163 CTGAAAAAGTGTGATGCCAATTCCAGCAATCAATATGAGGTGGAGGTTATCATTGAACGA 222 Query 181 CTTATTCAAAAGCTGATCAGCACAATTGGAAAAATTGACCCCCGATTTTCTTGTTCATTT 240 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 223 CTCATTCAAAAGCTGATCAGCACAATTGGAAAAATTGACCCCCGATTTTCTTGTTCATTT 282 Query 241 CTGATTACTTCAGAACCGCAGTTTTTGAATCAGATGACCACTACAAATGACTTCTCCTAC 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct 283 CTGATTACTTCAGAACCGCAGTTTTTGAATCAGATGGCCACTACAAATGACTTCTCCTAC 342 Query 301 ATTATCCGACTGGACCAGTTGTCCACTCCGACAATATATGAAGACGATAACTTGCCGCAG 360 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct 343 ATTATCCGACTGGACCAGTTGTCCACTCCGACAATATATGAAGACGATACCTTGCCGCAG 402 Query 361 ACATATTGTCACGTGGTGGAGCAAGATGGATCACCTCAGGGGTACGGGAAGATCCGTGTT 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 403 ACATATTGTCACGTGGTGGAGCAAGATGGATCACCTCAGGGGTACGGGAAGATCCGTGTT 462 Query 421 CAGGGCGAGGGCATGGAATCCTGGGCGGAATTCTTGGGAAATAACGGGTGTTTGCGAAGA 480 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 463 CAGGGCGAGGGCATGGAATCCTGGGCGGAATTCATGGGAAATAACGGGTGTTTGCGAAGA 522 Query 481 GACAAAATCCAAGAAAAATTTGTAGAGCTCCTAGCCAAAGCATCAGCGCGGTCCGAACTG 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 523 GACAAAATCCAAGAAAAATTTGTAGAGCTCCTAGCCAAAGCATCAGCGCGGTCCGAACTG 582 Query 541 ATCAAAACTTTAAACGATGTGGACGAATCTTGCCAGTGTGGATC-TCCAGGCAAAGTAAT 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| Sbjct 583 ATCAAAACTTTAAACGATGTGGACGAATCTTGCCAGTGTGGATCCTCCA-GCAAAGTAAT 641 Query 600 GGACGCTGAAGTTCTGCACCATGTGCTTAAAGCTCCGGCCAATCAAAGAGTGTTCTACGG 659 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 642 GGACGCTGAAGTT-TGCACCATGTGCTTAAAGCTCCGGCCAATCAAAGAGTGTTCTACGG 700 Query 660 TCAAG 664 ||||| Sbjct 701 TCAAG 705 Score = 1129 bits (611), Expect = 0.0 Identities = 625/632 (99%), Gaps = 0/632 (0%) Strand=Plus/Plus Query 2438 ATTTCAGTCCTATGACGCTCCTAGTGGATTTTTCTCGCCGCTATGGGTCCCACAGGGGTT 2497 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2474 ATTTCAGTCCTATGACGCTTCTAGTGGATTTTTCTCGCCGCTATGGGTCCCACAGGGGTT 2533 Query 2498 TTGGGAATGTTGTGGCTGCACTTATCATGCTACAAAAGTTCACGATATTACAAGAAGTTT 2557 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2534 TTGGGAATGTTGTGGCCGCACTTATCATGCTACAAAAGTTCACGATATTACAAGAAGTTT 2593 Query 2558 CCCAACTGTTGCCAGACAACGAGCGAATTCAAATGCTCGAAGTGATTCATAAAATCAACA 2617 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2594 CCCAACTGTTGCCAGACAACGAGCGAATTCAAATGCTCGAAGTGATTCATAAAATCAACA 2653 Query 2618 AGGAACAGAGACGTGGAAGACGGCGTCAACCATTTGGTAACAGTGCCACGAAAAGTGCCA 2677 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2654 AGGAACAGAGACGTGGAAGACGGCGTCAACCATTTGGTAACAGTGCCACGAAAAGTGCCA 2713 Query 2678 TCCAGGTCCTCATCATGGAGAATAGCAAGAGGGAAAATTGCAAATACGAAACTTATAGAC 2737 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct 2714 TCCAGGTCCTCATCATGGAGAATAGCAAGAGGGAAAACTGCAAATACGAAACTTATAGAC 2773 Query 2738 CTTTGATTGACATGGCGCAGCTGAATGATAAAGACGAACGTCATTTGGAAAAGCCAGATC 2797 ||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2774 CTTTGATGGACATGGGGCAACTGAATGATAAAGACGAACGTCATTTGGAAAAGCCAGATC 2833 Query 2798 TTATTAGAAACAAAAGTACAAAGAGGACCAAAGATTCTCTTCTAGGAACCTGTAGGGTAG 2857 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2834 TTATTAGAAACAAAAGTACAAAGAGGACCAAAGATTCTCTTCTAGGAACCTGTAGGGTAG 2893 Query 2858 CGCGCAATCGACAACAGAATGCGTCCGGTGTGGTATACAATCCGGCTTTCTATGATGCCC 2917 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2894 CGCGCAATCGACAACAGAATGCGTCCGGTGTGGTATACAATCCGGCTTTCTATGATGCCC 2953 Query 2918 CGATAACCTACTTGAATCAGGATGCAACTAACCCTAGTTATCAACCTTACTTACAGCTGA 2977 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct 2954 CGATAACCTACTTGAATCAGGATGCAACTAACCCTAGCTATCAACCTTACTTACAGCTGA 3013 Query 2978 ATGCTGATAGACAGCTGGAACTGGTGGAGCTTACGCCATCCTCTATAGATTATCACACCA 3037 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3014 ATGCTGATAGACAGCTGGAACTGGTGGAGCTTACGCCATCCTCTATAGATTATCACACCA 3073 Query 3038 AGAAACGAAACGACACATTGACAAAGTTTTGA 3069 |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3074 AGAAACGAAACGACACATTGACAAAGTTTTGA 3105 Lambda K H 1.33 0.621 1.12 Gapped Lambda K H 1.28 0.460 0.850 Effective search space used: 147459897468 Database: Dcitr_OGSv2.0_rna.fa Posted date: Mar 4, 2018 10:37 PM Number of letters in database: 49,157,538 Number of sequences in database: 25,292 Matrix: blastn matrix 1 -2 Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5