BLASTN 2.11.0+ Reference: Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000), "A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000; 7(1-2):203-14. Database: Dcitr_OGSv2.0_cds.fa 25,292 sequences; 34,155,564 total letters Query= 3546 Length=879 Score E Sequences producing significant alignments: (Bits) Value DcitrC020360.1.1Unknown protein. Similar to MCOT21942.0.CC XP_008... 1149 0.0 >DcitrC020360.1.1 Unknown protein. Similar to MCOT21942.0.CC XP_008476126.1. AED 0.00 Length=924 Score = 1149 bits (622), Expect = 0.0 Identities = 759/822 (92%), Gaps = 21/822 (3%) Strand=Plus/Plus Query 1 ATGGGAGGTAACTTTGGAACTCAGGTATCGCTCTTGCTGTTTTTAGCAGCAAGTAGCATT 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1 ATGGGAGGTAACTTTGGAACTCAGGTATCGCTCTTGCTGTTTTTAGCAGCAAGTAGCATT 60 Query 61 TATGGACAACCCATTGAGAATGCCAACAATCAAGTCGCGGTCATAGACGATGTAGTACGA 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 61 TATGGACAACCCATTGAGAATGCCAACAATCAAGTCGCGGTCATAGACGATGTAGTACGA 120 Query 121 GTGGCTAGGAGCCCCAACCCATTGTATTCGCCACCTCCAGTATATGATCCCCCTGTCTAT 180 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 121 GTGGCTAGGAGCCCCAACCCATTGTATTCGCCACCTCCAGTATATGATCCCCCTGTCTAT 180 Query 181 GCCCCACCACCGGCCCCACCTGTATATGACCCTCCAGTCTACGTTCCGGCTCCTGCACCA 240 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 181 GCCCCACCACCGCCCCCACCTGTATATGACCCTCCAGTCTACGTTCCGGCTCCTGCACCA 240 Query 241 CCCCCGGTCTACGCCCCACCACCACCACCTCTGAAGTATGACCCTCCAGTTTATGTCCCA 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 241 CCCCCGGTCTACGCCCCACCACCACCACCTCTGAAGTATGACCCTCCAGTTTATGTCCCA 300 Query 301 CCACCACCCCCTCCAAAATATGACCCCCCAGTCTACGCCCCACCACCGCCTCCTCCAAAA 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 301 CCACCACCCCCTCCAAAATATGACCCCCCAGTCTACGCCCCACCACCGCCTCCTCCAAAA 360 Query 361 TATGACCCTCCAGTCTACGTTCCTGCTCCTGCACCACCCCCGGTTTATGACCCTCCAGTC 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 361 TATGACCCTCCAGTCTACGTTCCTGCTCCTGCACCACCCCCGGTTTATGACCCTCCAGTC 420 Query 421 TATGTTCCACCACCTGCTGTAGATTATGAGCCTCCAGTGTATGCTGCTCCTATTGCACCA 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 421 TATGTTCCACCACCTGCTGTAGATTATGAGCCTCCAGTGTATGCTGCTCCTATTGCACCA 480 Query 481 ACATATCTACCACCCATCTACGACCCAGCACCGATACCCCCCACTTATGCTCCACTACCA 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 481 ACATATCTACCACCCATCTACGACCCAGCACCGATACCCCCCACTTATGCTCCACTACCA 540 Query 541 CCGCCCCCCAAGTATGACCCTCCAGTCTATGTTCCTCCTCCTCCAAAATATGACCCCCCA 600 ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||| || | | ||||| Sbjct 541 CCGCCCCCCAAGTATGACCCTCCAGTCTACGTCCCACCTCCTGCACCA---G---CCCCA 594 Query 601 GTTTATGTCCCACCAC-C--TGTACCAGCTCCAAAATATGACCCCCCAGTTTACGTCCCA 657 ||||||| || ||| | ||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct 595 GTTTATGAGCCTCCAGTCTATGTTCCTCCTCCAAAATATGACCCCCCAGTTTATGTCCCA 654 Query 658 CCACCACC-CC--CTCCAAAATATGACCCCCCAGTTTACGTTCCAGCACCTGCACCAGCT 714 ||||| | || |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| | || || Sbjct 655 CCACCTGCACCAGCTCCAAAATATGACCCCCCAGTTTACGTCCCACCACCACC-CC--CT 711 Query 715 CCAGTTTACGTTCCACCACCACCCCCTCCAAAATATG-ACCC-C-CCAGTTTACGTTCCA 771 ||| || | || ||| | |||| | || ||| | ||||||||||||||| Sbjct 712 CCAAAATATGACCCCCCAGTTTACGTTCCAGCACCTGCACCAGCTCCAGTTTACGTTCCA 771 Query 772 CCACC-CG--CTCCAAAATATGACCCCCCAGTCTACGTTCCA 810 ||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct 772 CCACCACCCCCTCCAAAATATGACCCCCCAGTTTACGTTCCA 813 Score = 555 bits (300), Expect = 2e-157 Identities = 321/330 (97%), Gaps = 6/330 (2%) Strand=Plus/Plus Query 553 TATGACCCTCCAGTCTATGTTCCTCCTCCTCCAAAATATGACCCCCCAGTTTATGTCCCA 612 ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 598 TATGAGCCTCCAGTCTATGT---TCCTCCTCCAAAATATGACCCCCCAGTTTATGTCCCA 654 Query 613 CCACCTGTACCAGCTCCAAAATATGACCCCCCAGTTTACGTCCCACCACCACCCCCTCCA 672 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 655 CCACCTGCACCAGCTCCAAAATATGACCCCCCAGTTTACGTCCCACCACCACCCCCTCCA 714 Query 673 AAATATGACCCCCCAGTTTACGTTCCAGCACCTGCACCAGCTCCAGTTTACGTTCCACCA 732 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 715 AAATATGACCCCCCAGTTTACGTTCCAGCACCTGCACCAGCTCCAGTTTACGTTCCACCA 774 Query 733 CCACCCCCTCCAAAATATGACCCCCCAGTTTACGTT---CCACCACCCGCTCCAAAATAT 789 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct 775 CCACCCCCTCCAAAATATGACCCCCCAGTTTACGTTCCACCACCACCCGCTCCAAAATAT 834 Query 790 GACCCCCCAGTCTACGTTCCAGCCCCGGCACCACCCCCGGTTTATGACCCTCCAGTTTAT 849 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 835 GACCCCCCAGTCTACGTTCCAGCCCCGGCACCACCCCCGGTTTATGACCCTCCAGTTTAT 894 Query 850 GCCCCACCTCCACCACCATATTACAGCTAG 879 |||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct 895 GCCCCACCTCCACCACCATATTACAGATAG 924 Score = 191 bits (103), Expect = 7e-48 Identities = 133/148 (90%), Gaps = 0/148 (0%) Strand=Plus/Plus Query 284 CTCCAGTTTATGTCCCACCACCACCCCCTCCAAAATATGACCCCCCAGTCTACGCCCCAC 343 |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| Sbjct 755 CTCCAGTTTACGTTCCACCACCACCCCCTCCAAAATATGACCCCCCAGTTTACGTTCCAC 814 Query 344 CACCGCCTCCTCCAAAATATGACCCTCCAGTCTACGTTCCTGCTCCTGCACCACCCCCGG 403 |||| || |||||||||||||||| |||||||||||||| || || ||||||||||||| Sbjct 815 CACCACCCGCTCCAAAATATGACCCCCCAGTCTACGTTCCAGCCCCGGCACCACCCCCGG 874 Query 404 TTTATGACCCTCCAGTCTATGTTCCACC 431 |||||||||||||||| |||| ||||| Sbjct 875 TTTATGACCCTCCAGTTTATGCCCCACC 902 Score = 182 bits (98), Expect = 4e-45 Identities = 132/148 (89%), Gaps = 3/148 (2%) Strand=Plus/Plus Query 713 CTCCAGTTTACGTTCCACCACCACCCCCTCCAAAATATGACCCCCCAGTTTACGTTCCAC 772 |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| Sbjct 284 CTCCAGTTTATGTCCCACCACCACCCCCTCCAAAATATGACCCCCCAGTCTACGCCCCAC 343 Query 773 CACC-CG--CTCCAAAATATGACCCCCCAGTCTACGTTCCAGCCCCGGCACCACCCCCGG 829 |||| | |||||||||||||||| |||||||||||||| || || ||||||||||||| Sbjct 344 CACCGCCTCCTCCAAAATATGACCCTCCAGTCTACGTTCCTGCTCCTGCACCACCCCCGG 403 Query 830 TTTATGACCCTCCAGTTTATGCCCCACC 857 |||||||||||||||| |||| ||||| Sbjct 404 TTTATGACCCTCCAGTCTATGTTCCACC 431 Score = 176 bits (95), Expect = 2e-43 Identities = 456/615 (74%), Gaps = 86/615 (14%) Strand=Plus/Plus Query 151 CCACCTCCAGTATATGATCCCCCTGTCTATGCCCCACCACCGGCCCCACCTGTATATGAC 210 || |||||| |||||| ||||| ||||| |||||||||||| | || || ||||||| Sbjct 307 CCCCCTCCAAAATATGACCCCCCAGTCTACGCCCCACCACCGCCTCCTCCAAAATATGAC 366 Query 211 CCTCCAGTCTACGTTCCGGCTCCTGCACCACCCCCGGTCTACG--CC-CCA--CCA---- 261 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || | || ||| | | Sbjct 367 CCTCCAGTCTACGTTCCTGCTCCTGCACCACCCCCGGTTTATGACCCTCCAGTCTATGTT 426 Query 262 CCACCACCT-CTG-A-AGTATGACCCTCCAGT-T-T-ATG-TCC-----CACC-AC---- 304 ||||||||| ||| | | ||||| |||||||| | | || ||| |||| || Sbjct 427 CCACCACCTGCTGTAGATTATGAGCCTCCAGTGTATGCTGCTCCTATTGCACCAACATAT 486 Query 305 C-ACC-CCC-TC--C-A---A--A-ATATGACCCCCCAGTCTACGC-CC-C-ACCACCGC 349 | ||| ||| || | | | | || |||||||| | || || || | |||||||| Sbjct 487 CTACCACCCATCTACGACCCAGCACCGAT-ACCCCCCACT-TATGCTCCACTACCACCGC 544 Query 350 CTCCTCCAAAATATGACCCTCCAGTCTACGTTCCTGCTCCTGCACCACCCCCGGTTTATG 409 | || || || |||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||| ||||||| Sbjct 545 C-CC-CC-AAGTATGACCCTCCAGTCTACGTCCCACCTCCTGCACCAGCCCCAGTTTATG 601 Query 410 ACCCTCCAGTCTATGTTCCACCACCTGCTGTAGATTATGAGCCTCCAGTGTATGCTGCTC 469 | ||||||||||||||||| ||| | | | ||||| || ||||| | | || || Sbjct 602 AGCCTCCAGTCTATGTTCC---TCCT-C--CAAAATATGACCCCCCAGT-T-T-ATG-TC 651 Query 470 CTATTGCACCAACATATCTACCACCCATCTACGACCCAGCACCGAT-ACCCCCCA-CTTA 527 | |||| || || || ||| || ||| | || |||||||| ||| Sbjct 652 C-----CACC-AC----CT-GCA-CCAGCT-----CCA--AAATATGACCCCCCAGTTTA 692 Query 528 TGCTCCACTACCACCGCCCCCCAAGTATGACCCTCCAGTCTATGTTCCTCCTCCTCCAAA 587 | |||| |||||| || || || |||||||| ||||| || ||||| | ||| || Sbjct 693 CGTCCCACCACCACCCCCTCCAAAATATGACCCCCCAGTTTACGTTCCAGCACCTGCA-- 750 Query 588 ATATGACCCCCCAGTTTATGTCCCACCACCTGTACCAGCTCCAAAATATGACCCCCCAGT 647 | | | |||||||| || |||||||| ||| |||||||||||||||||||||| Sbjct 751 CCA-G---CTCCAGTTTACGTTCCACCACC---ACCCCCTCCAAAATATGACCCCCCAGT 803 Query 648 TTACGTCCCACCACCACCCCCTCCAAAATATGACCCCCCAGTTTACGTTCCAGCACCTGC 707 |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || Sbjct 804 TTACGTTCCACCACCACCCGCTCCAAAATATGACCCCCCAGTCTACGTTCCAGCCCCGGC 863 Query 708 ACCAGCTCCAGTTTA 722 |||| | || ||||| Sbjct 864 ACCACCCCCGGTTTA 878 Score = 172 bits (93), Expect = 3e-42 Identities = 195/242 (81%), Gaps = 15/242 (6%) Strand=Plus/Plus Query 178 TATGC-CC-C-ACCACCGGCCCCACCTGTATATGACCCTCCAGTCTACGTTCCGGCTCCT 234 ||||| || | |||||| ||||| || |||||||||||||||||||| || ||||| Sbjct 526 TATGCTCCACTACCACC-GCCCC-CC-AAGTATGACCCTCCAGTCTACGTCCCACCTCCT 582 Query 235 GCACCACCCCCGGTCTA--CGCC-CCA--CCA-CCACCACCTCTGAAGTATGACCCTCCA 288 |||||| |||| || || ||| ||| | | || |||| || |||||||| ||| Sbjct 583 GCACCAGCCCCAGTTTATGAGCCTCCAGTCTATGTTCCTCCTCCAAAATATGACCCCCCA 642 Query 289 GTTTATGTCCCACCAC---CACCCCCTCCAAAATATGACCCCCCAGTCTACGCCCCACCA 345 |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||| Sbjct 643 GTTTATGTCCCACCACCTGCACCAGCTCCAAAATATGACCCCCCAGTTTACGTCCCACCA 702 Query 346 CCGCCTCCTCCAAAATATGACCCTCCAGTCTACGTTCCTGCTCCTGCACCACCCCCGGTT 405 || || ||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||| | || ||| Sbjct 703 CCACCCCCTCCAAAATATGACCCCCCAGTTTACGTTCCAGCACCTGCACCAGCTCCAGTT 762 Query 406 TA 407 || Sbjct 763 TA 764 Score = 169 bits (91), Expect = 3e-41 Identities = 155/187 (83%), Gaps = 0/187 (0%) Strand=Plus/Plus Query 151 CCACCTCCAGTATATGATCCCCCTGTCTATGCCCCACCACCGGCCCCACCTGTATATGAC 210 ||| ||||| |||||| ||||| || || | ||||||||| |||| || ||||||| Sbjct 664 CCAGCTCCAAAATATGACCCCCCAGTTTACGTCCCACCACCACCCCCTCCAAAATATGAC 723 Query 211 CCTCCAGTCTACGTTCCGGCTCCTGCACCACCCCCGGTCTACGCCCCACCACCACCACCT 270 || ||||| |||||||| || ||||||||| | || || |||| ||||||||||| ||| Sbjct 724 CCCCCAGTTTACGTTCCAGCACCTGCACCAGCTCCAGTTTACGTTCCACCACCACCCCCT 783 Query 271 CTGAAGTATGACCCTCCAGTTTATGTCCCACCACCACCCCCTCCAAAATATGACCCCCCA 330 | || |||||||| |||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct 784 CCAAAATATGACCCCCCAGTTTACGTTCCACCACCACCCGCTCCAAAATATGACCCCCCA 843 Query 331 GTCTACG 337 ||||||| Sbjct 844 GTCTACG 850 Score = 154 bits (83), Expect = 1e-36 Identities = 153/187 (82%), Gaps = 3/187 (2%) Strand=Plus/Plus Query 622 CCAGCTCCAAAATATGACCCCCCAGTTTACGTCCCACCACCACCCCCTCCAAAATATGAC 681 ||| ||||| |||||| ||||| || || | ||||||||| ||||| || ||||||| Sbjct 151 CCACCTCCAGTATATGATCCCCCTGTCTATGCCCCACCACCGCCCCCACCTGTATATGAC 210 Query 682 CCCCCAGTTTACGTTCCAGCACCTGCACCAGCTCCAGTTTACGTTCCACCACCACCCCCT 741 || ||||| |||||||| || ||||||||| | || || |||| ||||||||||| ||| Sbjct 211 CCTCCAGTCTACGTTCCGGCTCCTGCACCACCCCCGGTCTACGCCCCACCACCACCACCT 270 Query 742 CCAAAATATGACCCCCCAGTTTACGT---TCCACCACCCGCTCCAAAATATGACCCCCCA 798 | || |||||||| |||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct 271 CTGAAGTATGACCCTCCAGTTTATGTCCCACCACCACCCCCTCCAAAATATGACCCCCCA 330 Query 799 GTCTACG 805 ||||||| Sbjct 331 GTCTACG 337 Score = 150 bits (81), Expect = 1e-35 Identities = 127/149 (85%), Gaps = 3/149 (2%) Strand=Plus/Plus Query 574 CCTCCTCCTCCAAAATATGACCCCCCAGTTTATGTCCCACCACCTGTACCAGCTCCAAAA 633 || || |||| || |||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||| Sbjct 262 CCACCACCTCTGAAGTATGACCCTCCAGTTTATGTCCCACCACC---ACCCCCTCCAAAA 318 Query 634 TATGACCCCCCAGTTTACGTCCCACCACCACCCCCTCCAAAATATGACCCCCCAGTTTAC 693 |||||||||||||| |||| ||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||| Sbjct 319 TATGACCCCCCAGTCTACGCCCCACCACCGCCTCCTCCAAAATATGACCCTCCAGTCTAC 378 Query 694 GTTCCAGCACCTGCACCAGCTCCAGTTTA 722 ||||| || ||||||||| | || ||||| Sbjct 379 GTTCCTGCTCCTGCACCACCCCCGGTTTA 407 Score = 147 bits (79), Expect = 2e-34 Identities = 162/201 (81%), Gaps = 10/201 (5%) Strand=Plus/Plus Query 581 CTCCAAAATATGACCCCCCAGTTTATGTCCCACCACCTGTACCAGCTCCAAAATATGACC 640 ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||| Sbjct 668 CTCCAAAATATGACCCCCCAGTTTACGTCCCACCACC---ACCCCCTCCAAAATATGACC 724 Query 641 CCCCAGTTTACGTCCCACCACCACC-CC--CTCCAAAATATGACCCCCCAGTTTACGTTC 697 ||||||||||||| ||| |||| | || ||||| || | || ||| | || Sbjct 725 CCCCAGTTTACGTTCCAGCACCTGCACCAGCTCCAGTTTACGTTCCACCACCACCCCCTC 784 Query 698 CAGCACCTGCACCAGCTCCAGTTTACGTTCCACCACCACCCCCTCCAAAATATGACCCCC 757 || | || ||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct 785 CAAAATATG-ACCC-C-CCAGTTTACGTTCCACCACCACCCGCTCCAAAATATGACCCCC 841 Query 758 CAGTTTACGTTCCACCACCCG 778 |||| ||||||||| | |||| Sbjct 842 CAGTCTACGTTCCAGC-CCCG 861 Score = 126 bits (68), Expect = 2e-28 Identities = 174/223 (78%), Gaps = 16/223 (7%) Strand=Plus/Plus Query 638 ACCCCCCAGTTTACGTCCCACCACCACCCCCTCCAAAATATGACCCCCCAGTTTACGTTC 697 |||||||| ||| | |||| |||||| || || || |||||||| ||||| ||||| | Sbjct 516 ACCCCCCA-CTTATGCTCCACTACCACCGCCCCCCAAGTATGACCCTCCAGTCTACGTCC 574 Query 698 CAGCACCTGCACCAGCTCCAGTTTACGTTCCACCA--CCA----CCCCCTCCAAAATATG 751 || | ||||||||||| |||||||| | || ||| | | || ||||||||||||| Sbjct 575 CACCTCCTGCACCAGCCCCAGTTTATGAGCCTCCAGTCTATGTTCCTCCTCCAAAATATG 634 Query 752 ACCCCCCAGTTTACGTTCCACCACC--C----GCTCCAAAATATGACCCCCCAGTCTACG 805 ||||||||||||| || |||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct 635 ACCCCCCAGTTTATGTCCCACCACCTGCACCAGCTCCAAAATATGACCCCCCAGTTTACG 694 Query 806 TTCCAGCCCCGGCACCACCCCCGGTTTATGACCCTCCAGTTTA 848 | ||| || | |||| || || |||||||| |||||||| Sbjct 695 TCCCA-CCAC--CACCCCCTCCAAAATATGACCCCCCAGTTTA 734 Score = 126 bits (68), Expect = 2e-28 Identities = 107/125 (86%), Gaps = 6/125 (5%) Strand=Plus/Plus Query 715 CCAGTTTACGTTCCACCAC---CACCCCCTCCAAAATATGACCCCCCAGTTTACGTTCCA 771 |||||||| || ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct 640 CCAGTTTATGTCCCACCACCTGCACCAGCTCCAAAATATGACCCCCCAGTTTACGTCCCA 699 Query 772 CCACC-CG--CTCCAAAATATGACCCCCCAGTCTACGTTCCAGCCCCGGCACCACCCCCG 828 ||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| | || Sbjct 700 CCACCACCCCCTCCAAAATATGACCCCCCAGTTTACGTTCCAGCACCTGCACCAGCTCCA 759 Query 829 GTTTA 833 ||||| Sbjct 760 GTTTA 764 Score = 117 bits (63), Expect = 1e-25 Identities = 95/111 (86%), Gaps = 0/111 (0%) Strand=Plus/Plus Query 307 CCCCCTCCAAAATATGACCCCCCAGTCTACGCCCCACCACCGCCTCCTCCAAAATATGAC 366 || |||||| |||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || ||||||| Sbjct 151 CCACCTCCAGTATATGATCCCCCTGTCTATGCCCCACCACCGCCCCCACCTGTATATGAC 210 Query 367 CCTCCAGTCTACGTTCCTGCTCCTGCACCACCCCCGGTTTATGACCCTCCA 417 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || | ||| ||| Sbjct 211 CCTCCAGTCTACGTTCCGGCTCCTGCACCACCCCCGGTCTACGCCCCACCA 261 Score = 117 bits (63), Expect = 1e-25 Identities = 145/182 (80%), Gaps = 15/182 (8%) Strand=Plus/Plus Query 526 TATGCTCCACTACCACCGCCCCC-CAAG--TATGACCCTCCAGTCTATGTTCCTCCTCCT 582 ||||| || | |||||||||||| | | ||||||||||||||||| ||||| ||||| Sbjct 178 TATGC-CC-C-ACCACCGCCCCCACCTGTATATGACCCTCCAGTCTACGTTCCGGCTCCT 234 Query 583 CCAAAATATGACCCCCCAGTTTATGTCCCACCACCTGTACCAGCTCCAAAATATGACCCC 642 || | ||||| || || | ||||||||| |||| ||| || |||||||| Sbjct 235 GCA-----CCA-CCCCCGGTCTACGCCCCACCACC---ACCACCTCTGAAGTATGACCCT 285 Query 643 CCAGTTTACGTCCCACCACCACCCCCTCCAAAATATGACCCCCCAGTTTACGTTCCAGCA 702 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| || Sbjct 286 CCAGTTTATGTCCCACCACCACCCCCTCCAAAATATGACCCCCCAGTCTACGCCCCACCA 345 Query 703 CC 704 || Sbjct 346 CC 347 Score = 117 bits (63), Expect = 1e-25 Identities = 152/194 (78%), Gaps = 9/194 (5%) Strand=Plus/Plus Query 163 TATGATCCCCCTGTCTATGCCCCACCACCGGC-CC--CACCTGTATATGACCCTCCAGTC 219 ||||| || || ||||| | |||||| || || || | || || ||||| ||||||||| Sbjct 553 TATGACCCTCCAGTCTACGTCCCACCTCCTGCACCAGCCCCAGTTTATGAGCCTCCAGTC 612 Query 220 TACGTTCCGGCTCC--TGCACCA-CCCCCGGTCTACGCCCCACCAC---CACCACCTCTG 273 || ||||| |||| | | ||||| || || | |||||||| ||||| ||| Sbjct 613 TATGTTCCTCCTCCAAAATATGACCCCCCAGTTTATGTCCCACCACCTGCACCAGCTCCA 672 Query 274 AAGTATGACCCTCCAGTTTATGTCCCACCACCACCCCCTCCAAAATATGACCCCCCAGTC 333 || |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 673 AAATATGACCCCCCAGTTTACGTCCCACCACCACCCCCTCCAAAATATGACCCCCCAGTT 732 Query 334 TACGCCCCACCACC 347 |||| ||| |||| Sbjct 733 TACGTTCCAGCACC 746 Score = 111 bits (60), Expect = 6e-24 Identities = 174/225 (77%), Gaps = 24/225 (11%) Strand=Plus/Plus Query 574 CCTCCTCCTCCAAAATATGACCCCCCAGTTTATGTCCCACCACCTGTACCAGCTCCAAAA 633 || || || || || |||||||| ||||| || |||||||| |||| |||||| ||| Sbjct 538 CCACCGCCCCCCAAGTATGACCCTCCAGTCTACGTCCCACCTCCTGCACCAGCCCCAGTT 597 Query 634 TATGACCCCCCAGTTTACGTCCCACCACCACCCCCTCCAAAATATGACCCCCCAGTTTAC 693 ||||| || ||||| || || || |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 598 TATGAGCCTCCAGTCTATGT---------TCCTCCTCCAAAATATGACCCCCCAGTTTAT 648 Query 694 GTTCCAGCACCTGCACCAGCT---------------CCAGTTTACGTTCCACCACCACCC 738 || ||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| Sbjct 649 GTCCCACCACCTGCACCAGCTCCAAAATATGACCCCCCAGTTTACGTCCCACCACCACCC 708 Query 739 CCTCCAAAATATGACCCCCCAGTTTACGTTCCACCACCCGCTCCA 783 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||| Sbjct 709 CCTCCAAAATATGACCCCCCAGTTTACGTTCCAGCACCTGCACCA 753 Score = 104 bits (56), Expect = 1e-21 Identities = 148/191 (77%), Gaps = 12/191 (6%) Strand=Plus/Plus Query 526 TATGCTCCACTACCACCGCCCCCCAAGTATGACCCTCCAGTCTATGT------TCCTCCT 579 || || |||| |||||| || | ||||||||||||||||| ||||| || || Sbjct 250 TACGCCCCACCACCACCACCTCTGAAGTATGACCCTCCAGTTTATGTCCCACCACCACCC 309 Query 580 CCTCCAAAATATGACCCCCCAGTTTATGTCCCACCACCTGTACCAGCTCCAAAATATGAC 639 ||||||||||||||||||||||| || | ||||||||| | || |||||||||||||| Sbjct 310 CCTCCAAAATATGACCCCCCAGTCTACGCCCCACCACC-G--CCTCCTCCAAAATATGAC 366 Query 640 CCCCCAGTTTACGT-CC--CACCACCACCCCCTCCAAAATATGACCCCCCAGTTTACGTT 696 || ||||| ||||| || | || |||| || || |||||||| ||||| || ||| Sbjct 367 CCTCCAGTCTACGTTCCTGCTCCTGCACCACCCCCGGTTTATGACCCTCCAGTCTATGTT 426 Query 697 CCAGCACCTGC 707 ||| ||||||| Sbjct 427 CCACCACCTGC 437 Score = 104 bits (56), Expect = 1e-21 Identities = 60/62 (97%), Gaps = 0/62 (0%) Strand=Plus/Plus Query 643 CCAGTTTACGTCCCACCACCACCCCCTCCAAAATATGACCCCCCAGTTTACGTTCCAGCA 702 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct 757 CCAGTTTACGTTCCACCACCACCCCCTCCAAAATATGACCCCCCAGTTTACGTTCCACCA 816 Query 703 CC 704 || Sbjct 817 CC 818 Score = 99.0 bits (53), Expect = 5e-20 Identities = 117/148 (79%), Gaps = 4/148 (3%) Strand=Plus/Plus Query 281 ACCCTCCAGTTTATGTCCCACCACCACCCCCTCCAAAATATGACCCCCCAGTCTACGCCC 340 |||| || || || | |||||||||||| |||| || |||||||| ||||| || | || Sbjct 240 ACCC-CCGGTCTACGCCCCACCACCACCACCTCTGAAGTATGACCCTCCAGTTTATGTCC 298 Query 341 CACCACCGCCTCCTCCAAAATATGACCCTCCAGTCTACGTTCCTGCTCCTGCACCACCCC 400 ||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||| || | || || | || | Sbjct 299 CACCACCACCCCCTCCAAAATATGACCCCCCAGTCTACGCCCCACCACC-GC-CT-CCTC 355 Query 401 CGGTTTATGACCCTCCAGTCTATGTTCC 428 | ||||||||||||||||| ||||| Sbjct 356 CAAAATATGACCCTCCAGTCTACGTTCC 383 Score = 99.0 bits (53), Expect = 5e-20 Identities = 117/148 (79%), Gaps = 4/148 (3%) Strand=Plus/Plus Query 240 ACCC-CCGGTCTACGCCCCACCACCACCACCTCTGAAGTATGACCCTCCAGTTTATGTCC 298 |||| || || || | |||||||||||| |||| || |||||||| ||||| || | || Sbjct 281 ACCCTCCAGTTTATGTCCCACCACCACCCCCTCCAAAATATGACCCCCCAGTCTACGCCC 340 Query 299 CACCACCACCCCCTCCAAAATATGACCCCCCAGTCTACGCCCCACCACC-GC-CT-CCTC 355 ||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||| || | || || | || | Sbjct 341 CACCACCGCCTCCTCCAAAATATGACCCTCCAGTCTACGTTCCTGCTCCTGCACCACCCC 400 Query 356 CAAAATATGACCCTCCAGTCTACGTTCC 383 | ||||||||||||||||| ||||| Sbjct 401 CGGTTTATGACCCTCCAGTCTATGTTCC 428 Lambda K H 1.33 0.621 1.12 Gapped Lambda K H 1.28 0.460 0.850 Effective search space used: 28628867456 Database: Dcitr_OGSv2.0_cds.fa Posted date: Mar 4, 2018 10:37 PM Number of letters in database: 34,155,564 Number of sequences in database: 25,292 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