BLASTN 2.11.0+ Reference: Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000), "A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000; 7(1-2):203-14. Database: Candidatus_Liberibacter_asiaticus_gxpsy_genome.fasta 1 sequences; 1,268,237 total letters Query= Untitled_sequence Length=2268 Score E Sequences producing significant alignments: (Bits) Value gi|470204499|ref|NC_020549.1| Candidatus Liberibacter asiaticus ... 4189 0.0 >gi|470204499|ref|NC_020549.1| Candidatus Liberibacter asiaticus str. gxpsy, complete genome Length=1268237 Score = 4189 bits (2268), Expect = 0.0 Identities = 2268/2268 (100%), Gaps = 0/2268 (0%) Strand=Plus/Minus Query 1 ATGGCGGAGTATGCAAGAGAAAATCGATTATTTTTACCGATTCAAATCATTCCCTCACAC 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 502017 ATGGCGGAGTATGCAAGAGAAAATCGATTATTTTTACCGATTCAAATCATTCCCTCACAC 501958 Query 61 GTTAAATATGCATTTGTTTCTGCTGAAGATAAAAATTTCTACTATCATTCAGGAGTTGAT 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 501957 GTTAAATATGCATTTGTTTCTGCTGAAGATAAAAATTTCTACTATCATTCAGGAGTTGAT 501898 Query 121 ATCTTTGGTATCATGCGCGCTGTCCTGCACAATATAAGAAACATTAGTCATGGACGACGT 180 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 501897 ATCTTTGGTATCATGCGCGCTGTCCTGCACAATATAAGAAACATTAGTCATGGACGACGT 501838 Query 181 CCAGAGGGAGCTTCAACTATCACACAACAAGTTGCAAAGAATTTTCTCTTAACCTCTAAT 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 501837 CCAGAGGGAGCTTCAACTATCACACAACAAGTTGCAAAGAATTTTCTCTTAACCTCTAAT 501778 Query 241 CAAACCATGGATCGAAAAATCAAGGAAATCCTCCTATCTTTTCGCCTTGAAAAAGCCTAT 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 501777 CAAACCATGGATCGAAAAATCAAGGAAATCCTCCTATCTTTTCGCCTTGAAAAAGCCTAT 501718 Query 301 GACAAGGAAAAAATACTAGAATTTTACTTAAATGAAATTTTTTTCGGATTTAACTCCTAT 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 501717 GACAAGGAAAAAATACTAGAATTTTACTTAAATGAAATTTTTTTCGGATTTAACTCCTAT 501658 Query 361 GGAATAGCAAGCGCCGCTCTAACTTATTTTAATAAATCAGTGAGTGAATTAACCATAGAA 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 501657 GGAATAGCAAGCGCCGCTCTAACTTATTTTAATAAATCAGTGAGTGAATTAACCATAGAA 501598 Query 421 GAAGCCGCTTACTTAGCAGCTCTTCCTAAGGGTCCGAGTAATTATGATCCTTTCCGCAAG 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 501597 GAAGCCGCTTACTTAGCAGCTCTTCCTAAGGGTCCGAGTAATTATGATCCTTTCCGCAAG 501538 Query 481 AATAAAGCGGCGATTGCTCGCCGAAATTGGGTCATTGACCGTATGGAGGAAAATGGGTAT 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 501537 AATAAAGCGGCGATTGCTCGCCGAAATTGGGTCATTGACCGTATGGAGGAAAATGGGTAT 501478 Query 541 ATCTCCCAAGAGCAAGCTCTTGTCGCCAAACAGAAACCTCTCAAAATCACGATTAAACAA 600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 501477 ATCTCCCAAGAGCAAGCTCTTGTCGCCAAACAGAAACCTCTCAAAATCACGATTAAACAA 501418 Query 601 CGTAGATCCCATCTTTTTGGAAGTGAATACTTCGCTGAAGAAGTGAGACGACAGCTTATT 660 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 501417 CGTAGATCCCATCTTTTTGGAAGTGAATACTTCGCTGAAGAAGTGAGACGACAGCTTATT 501358 Query 661 GATCGTTATGGAGAAAAGGCACTTTATGAAGATGGTTTATCCATACGAACGTCGCTTGAT 720 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 501357 GATCGTTATGGAGAAAAGGCACTTTATGAAGATGGTTTATCCATACGAACGTCGCTTGAT 501298 Query 721 CCACAATTACAACTCTATGCAAGAAAAGCCCTCCAAAATGGATTGATCAATTACGATCAG 780 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 501297 CCACAATTACAACTCTATGCAAGAAAAGCCCTCCAAAATGGATTGATCAATTACGATCAG 501238 Query 781 AATGACGGTTTTCGTGGACCTATAAAGCGCATAGATTTAAAAAAAGATTGGGGAAATACT 840 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 501237 AATGACGGTTTTCGTGGACCTATAAAGCGCATAGATTTAAAAAAAGATTGGGGAAATACT 501178 Query 841 CTGGCATCAATCCCTACCTTATATGATGTGCCCGAATGGGACATTGCTGTCGTTCTAGAA 900 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 501177 CTGGCATCAATCCCTACCTTATATGATGTGCCCGAATGGGACATTGCTGTCGTTCTAGAA 501118 Query 901 GTATCCAATTCTCATATAACTATAGGGATCCGTCCAACTATTGACTCAAATGGGAAAGTC 960 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 501117 GTATCCAATTCTCATATAACTATAGGGATCCGTCCAACTATTGACTCAAATGGGAAAGTC 501058 Query 961 ACGACCGAAAGGAAAAAAGGCATAATTGAAGCAGATTCGATGCGATGGGTCTATAATAAA 1020 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 501057 ACGACCGAAAGGAAAAAAGGCATAATTGAAGCAGATTCGATGCGATGGGTCTATAATAAA 500998 Query 1021 GAGCAAACCACAGAAGAAACATCAGAAAATCGCAATGTTCTTTCGCTCGGCGATGTAATC 1080 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 500997 GAGCAAACCACAGAAGAAACATCAGAAAATCGCAATGTTCTTTCGCTCGGCGATGTAATC 500938 Query 1081 TACGTAGAACATATTAATGAAGGATGGAGACTCCGTCAAATTCCAAAAGTACAAGGAGGA 1140 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 500937 TACGTAGAACATATTAATGAAGGATGGAGACTCCGTCAAATTCCAAAAGTACAAGGAGGA 500878 Query 1141 TTAATAGCTATGGATCCTCGTACTGGTCGCATTCTTGCCACTATAGGAGGATTCTCTTAT 1200 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 500877 TTAATAGCTATGGATCCTCGTACTGGTCGCATTCTTGCCACTATAGGAGGATTCTCTTAT 500818 Query 1201 TCACAGTCAGAATTTAATCGCTCTACTCAAGCAATGCGCCAACCCGGATCCTGTTTTAAA 1260 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 500817 TCACAGTCAGAATTTAATCGCTCTACTCAAGCAATGCGCCAACCCGGATCCTGTTTTAAA 500758 Query 1261 CCAATTGTATATGCAGCCGCATTAGATAGCGGATATACTCCTGCATCGGTCATTATGGAT 1320 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 500757 CCAATTGTATATGCAGCCGCATTAGATAGCGGATATACTCCTGCATCGGTCATTATGGAT 500698 Query 1321 GCCCCAATTGAAGTCGTTTCCAGAGGAAAAATTTGGAAACCTGAAAATTATAGCAAAAAC 1380 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 500697 GCCCCAATTGAAGTCGTTTCCAGAGGAAAAATTTGGAAACCTGAAAATTATAGCAAAAAC 500638 Query 1381 TTTTCTGGTGCGTCCACTTTGCGCTTTGGACTCGAAAAATCTCGTAATCTCATGACAGTA 1440 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 500637 TTTTCTGGTGCGTCCACTTTGCGCTTTGGACTCGAAAAATCTCGTAATCTCATGACAGTA 500578 Query 1441 CGTCTTGCCCATAATATGGGAATGACTGTTGTAGCCGATTATGCCGAAAACTTTGGCATT 1500 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 500577 CGTCTTGCCCATAATATGGGAATGACTGTTGTAGCCGATTATGCCGAAAACTTTGGCATT 500518 Query 1501 TATGATAAAATGTTACCTGTTTTACCAATGTCTTTGGGGGCAGGAGAAACCACAGTACTA 1560 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 500517 TATGATAAAATGTTACCTGTTTTACCAATGTCTTTGGGGGCAGGAGAAACCACAGTACTA 500458 Query 1561 CGTATGGTCTCGGCTTATGCTGTTTTTGCCAATGGAGGAAAACAAATTCGACCTTCATTT 1620 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 500457 CGTATGGTCTCGGCTTATGCTGTTTTTGCCAATGGAGGAAAACAAATTCGACCTTCATTT 500398 Query 1621 ATTGATCGCATTCAAAATAGGTATGGCAAAACCATATTTAATCAAGAACAACGCATTTGT 1680 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 500397 ATTGATCGCATTCAAAATAGGTATGGCAAAACCATATTTAATCAAGAACAACGCATTTGT 500338 Query 1681 GATGATTGCAATTATGATACTTGGAATGGACAAGACGAACCGGAAATAATCGATAAACGA 1740 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 500337 GATGATTGCAATTATGATACTTGGAATGGACAAGACGAACCGGAAATAATCGATAAACGA 500278 Query 1741 GAACAAGTGTTGGATCCCATGACTGCTTATCAAATTACTTCTATGTTAGAAGGAGTTATT 1800 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 500277 GAACAAGTGTTGGATCCCATGACTGCTTATCAAATTACTTCTATGTTAGAAGGAGTTATT 500218 Query 1801 AAGCATGGAACTGCCACAGGTAAAGTCCGATTGAATCGGCCTGTCGCTGGGAAAACGGGC 1860 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 500217 AAGCATGGAACTGCCACAGGTAAAGTCCGATTGAATCGGCCTGTCGCTGGGAAAACGGGC 500158 Query 1861 ACAACGAGTAGCTATAGAGATACTTGGTTTATAGGATATACCCCTACACTTGTAGTTGGC 1920 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 500157 ACAACGAGTAGCTATAGAGATACTTGGTTTATAGGATATACCCCTACACTTGTAGTTGGC 500098 Query 1921 GTTTATGTTGGTTATGACATCCCAGCTCCTTTAAACAACCATGCAACCGGAAGCACTCTT 1980 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 500097 GTTTATGTTGGTTATGACATCCCAGCTCCTTTAAACAACCATGCAACCGGAAGCACTCTT 500038 Query 1981 ACTGCACCTATTTTTAATGCTTTCATGAAAGAAGCACTAAAAAACATTCCTTCTTCTCGT 2040 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 500037 ACTGCACCTATTTTTAATGCTTTCATGAAAGAAGCACTAAAAAACATTCCTTCTTCTCGT 499978 Query 2041 TTTGTTGCTCCACCAGGCATGAGTCTGATTCCTATCAATAAATGGACAGGCATGTTGTCT 2100 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 499977 TTTGTTGCTCCACCAGGCATGAGTCTGATTCCTATCAATAAATGGACAGGCATGTTGTCT 499918 Query 2101 AAAAAAGGAGATCCTGATACCATTATTGAAGCATTTAAACCTGGGACAGGACCAGCAGAA 2160 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 499917 AAAAAAGGAGATCCTGATACCATTATTGAAGCATTTAAACCTGGGACAGGACCAGCAGAA 499858 Query 2161 ACCTATACTGTCATTGATGAAGATAGTAATGTTTCTTCCGAAGAAATTCTCCGCAGATCT 2220 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 499857 ACCTATACTGTCATTGATGAAGATAGTAATGTTTCTTCCGAAGAAATTCTCCGCAGATCT 499798 Query 2221 CCTCAAGCCAATCAAGCAATTAATTCTGGAAGTGGAGGCTTATACTAA 2268 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 499797 CCTCAAGCCAATCAAGCAATTAATTCTGGAAGTGGAGGCTTATACTAA 499750 Lambda K H 1.33 0.621 1.12 Gapped Lambda K H 1.28 0.460 0.850 Effective search space used: 2848410890 Database: Candidatus_Liberibacter_asiaticus_gxpsy_genome.fasta Posted date: Jul 20, 2015 1:33 PM Number of letters in database: 1,268,237 Number of sequences in database: 1 Matrix: blastn matrix 1 -2 Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5