BLASTN 2.11.0+ Reference: Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000), "A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000; 7(1-2):203-14. Database: Dcitri_transcriptome.fasta 60,261 sequences; 104,618,276 total letters Query= Dcitr11g07200.1.1 Length=1737 Score E Sequences producing significant alignments: (Bits) Value DcDTr30769.1Unknown protein 3153 0.0 DcDTr08685.10Unknown protein 272 2e-71 >DcDTr30769.1 Unknown protein Length=4972 Score = 3153 bits (1707), Expect = 0.0 Identities = 1715/1719 (99%), Gaps = 0/1719 (0%) Strand=Plus/Minus Query 19 ATGATGTATTTCTGGAACTTTTGGCCCACCAATGGAGGTCTGCTCATTCTTCTGCTTGTG 78 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2090 ATGATTTATTTCTGGAACTTTTGGCCCACCAATGGAGGTCTGCTCATTCTTCTGCTTGTG 2031 Query 79 AACTGTGTGAATAACATCCAGGAGGCATTTGGTGGCATAGTCATTCATGATGAGGCGGAT 138 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2030 AACTGTGTGAATAACATCCAGGAGGCATTTGGTGGCATAGTCATTCATGATGAGGCGGAT 1971 Query 139 AAGTATTCAGAATACTTCAAGTACAAGGCGCAGGCAGAAATCTCAGAAAATGAGCCCAAC 198 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1970 AAGTATTCAGAATACTTCAAGTACAAGGCGCAGGCAGAAATCTCAGAAAATGAGCCCAAC 1911 Query 199 TACTGGCAGCAGGTCGGTCTCCACGAGCTCAAGTTCAAACTGAACAAACCTCTCATCAAG 258 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1910 TACTGGCAGCAGGTCGGTCTCCACGAGCTCAAGTTCAAACTGAACAAACCTCTCATCAAG 1851 Query 259 GGAGAGGCAAAGAATGTGATCATGTTCCTAGGGGACGGTATGTCCCTGCCCACCATTACG 318 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1850 GGAGAGGCAAAGAATGTGATCATGTTCCTAGGGGACGGTATGTCCCTGCCCACCATTACG 1791 Query 319 GCCGCCAGGATCTACAAGGGTCAATTAGGAGAACGGGGCCCTGATGAACCCCGGGGGGAG 378 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1790 GCCGCCAGGATCTACAAGGGTCAATTAGGAGAACGGGGCCCTGATGAACCCCGGGGGGAG 1731 Query 379 CAAGATCATCTCTCCTTTGAGAATTTCCCCTTCACTGGGATGGCCAAGACATACTGTGTG 438 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1730 CAAGATCATCTCTCCTTTGAGAATTTCCCCTTCACTGGGATGGCCAAGACATACTGTGTG 1671 Query 439 GACCAGCAGACGGCCGATTCAGCGTGCACAGCCACCGCCTATCTGTGCGGGGTTAAAAAC 498 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1670 GACCAGCAGACGGCCGATTCAGCGTGCACAGCCACCGCCTATCTGTGCGGGGTTAAAAAC 1611 Query 499 AACTTCGGGACCATAGGGGTTAACTCTAAAATCTCGAGGAAGAATTGTGAGGGCATGAAG 558 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1610 AACTTCGGGACCATAGGGGTTAACTCTAAAATCTCGAGGAAGAATTGTGAGGGCATGAAG 1551 Query 559 AACCCGGAATATTTCACGACCAGCATTCTGAAGTGGGCGCAGGACTTTGGCAAATCTACA 618 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1550 AACCCGGAATATTTCACGACCAGCATTCTGAAGTGGGCGCAGGACTTTGGCAAATCTACA 1491 Query 619 GGCGTCGTCACAACTACCAGAGTAACGCATGCGTCACCCGCAGGTACGTATGCGCACACG 678 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1490 GGCGTCGTCACAACTACCAGAGTAACGCATGCGTCACCCGCAGGTACGTATGCGCACACG 1431 Query 679 GCGGAGAGAGACTGGGAATGTGATGCGGATATCAAGAAGGATCCGGAGCGGATTGGAAAC 738 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1430 GCGGAGAGAGACTGGGAATGTGATGCGGATATCAAGAAGGATCCGGAGCGGATTGGAAAC 1371 Query 739 GGATGTAAGGACATTGCGTACCAACTGGTCAAGGATGACCCCGGACGGAGGATCAAGGTC 798 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1370 GGATGTAAGGACATTGCGTACCAACTGGTCAAGGATGACCCCGGACGGAGGATCAAGGTC 1311 Query 799 ATCATGGGAGGTGGTCGGGCCAAATTCCTGCCAGTGTCTTCTAAGGATGATGAGGGCAAT 858 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1310 ATCATGGGAGGTGGTCGGGCCAAATTCCTGCCAGTGTCTTCTAAGGATGATGAGGGCAAT 1251 Query 859 GTTGGAGAGAGGTCAGATGGACAGGACCTTATTAAGGAGTGGTTATTGGATAAGACCAAC 918 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1250 GTTGGAGAGAGGTCAGATGGACAGGACCTTATTAAGGAGTGGTTATTGGATAAGACCAAC 1191 Query 919 AGGACTAAGAAGGCCAAGTTCATTACGACAAGGCAACAGTTGCTTGAGTTGGACCCTAAT 978 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1190 AGGACTAAGAAGGCCAAGTTCATTACGACAAGGCAACAGTTGCTTGAGTTGGACCCTAAT 1131 Query 979 AAGGGCACGGACTATCTGCTGGGTCTGTTCGCTTCCGATCACCTCCACTACAATCTCGGA 1038 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1130 AAGGGCACGGACTATCTGCTGGGTCTGTTCGCTTCCGATCACCTCCACTACAATCTCGGA 1071 Query 1039 GCGCCCGCGTCGCAGCCGACTCTCGCCGAGATGACCCGAACCGCCATTCGGCTCCTCGAG 1098 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1070 GCGCCCGCGTCGCAGCCGACTCTCGCCGAGATGACCCGAACCGCCATTCGGCTCCTCGAG 1011 Query 1099 AAGGAGCAGAAGGGGTATTTCCTCTTCGTTGAGGGCGGGCATATAGATACCGCACACCAC 1158 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1010 AAGGAGCAGAAGGGGTATTTCCTCTTCGTTGAGGGCGGGCATATAGATACCGCACACCAC 951 Query 1159 AACAACACACCGCGTTATGCGTTGGACGAAACGGTGGAGCTGGCGAAAGCGGTGAGTGTT 1218 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 950 AACAACACACCGCGTTATGCGTTGGACGAAACGGTGGAGCTGGCGAAAGCGGTGAGTGTT 891 Query 1219 GCGGTGAATCTGACGAGTGAGAAGGACACGTTGATTGTGGTGACAGCAGATCACGCGCAT 1278 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 890 GCGGTGAATCTGACGAGTGAGAAGGACACGTTGATTGTGGTGACAGCAGATCACGCGCAT 831 Query 1279 ACCATGATGATCAGCGGATATTCCAAACGAAATAATGATATACTGGGTGCGGCCGACCAG 1338 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 830 ACCATGATGATCAGCGGATATTCCAAACGAAATAATGATATACTGGGTGCGGCCGACCAG 771 Query 1339 AAGGACCTCAATGGGAACCCTTACCCTACACTGAGTTATGCCAATGGTCCAGCTGCCAGG 1398 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 770 AAGGACCTCAATGGGAACCCCTACCCTACACTGAGTTATGCCAATGGTCCAGCTGCCAGG 711 Query 1399 GCTCCAGTTTATAATGCAACGTCCAGTACATGTCAGATGCCGACCGTCACAATGGAAGCC 1458 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 710 GCTCCAGTTTATAATGCAACGTCCAGTACATGTCAGATGCCGACCGTCACAATGGAAGCC 651 Query 1459 GGATTTGGGGACGCCTCGTTCCACTACCCCGCCCTGGTGCCCGCCAAGGACGAAACGCAC 1518 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 650 GGATTTGGGGACGCCTCGTTCCACTACCCCGCCCTGGTGCCCGCCAAGGACGAAACGCAC 591 Query 1519 GGAGGTGATGACGTCATGGTCTACGCGCGAGGACCCTGGTCTCATCTATTCACCGGGTCC 1578 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 590 GGAGGTGATGACGTCATGGTCTACGCGCGAGGACCCTGGTCTCATCTATTCACCGGGTCC 531 Query 1579 TACGAGCAGAACTTCATTCCGATCGCCATGGGCTTCGCGTCGCGCGTCGGACCCAACTCA 1638 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 530 TACGAGCAGAACTTCATTCCGATCGCCATGGGCTTCGCGTCGCGCGTCGGACCCAACTCA 471 Query 1639 AAATTGGCCGGTGCGTCAGGGGGAGTTTCGACGCATGAGACGCATGCGGTCCTGGTGCTG 1698 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct 470 AAATTGGCCGGTGCGTCAGGGGGAGTTTCGACGCATGAGACGCATGCGGTCCTGATGCTG 411 Query 1699 CTGAGCGTGGCCGTGGTGTATCTGACGCAGAGACGCTGA 1737 ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct 410 CTGAGCGTGGCCGTGGTGTTTCTGACGCAGAGACGCTGA 372 Score = 3153 bits (1707), Expect = 0.0 Identities = 1715/1719 (99%), Gaps = 0/1719 (0%) Strand=Plus/Minus Query 19 ATGATGTATTTCTGGAACTTTTGGCCCACCAATGGAGGTCTGCTCATTCTTCTGCTTGTG 78 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4576 ATGATTTATTTCTGGAACTTTTGGCCCACCAATGGAGGTCTGCTCATTCTTCTGCTTGTG 4517 Query 79 AACTGTGTGAATAACATCCAGGAGGCATTTGGTGGCATAGTCATTCATGATGAGGCGGAT 138 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4516 AACTGTGTGAATAACATCCAGGAGGCATTTGGTGGCATAGTCATTCATGATGAGGCGGAT 4457 Query 139 AAGTATTCAGAATACTTCAAGTACAAGGCGCAGGCAGAAATCTCAGAAAATGAGCCCAAC 198 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4456 AAGTATTCAGAATACTTCAAGTACAAGGCGCAGGCAGAAATCTCAGAAAATGAGCCCAAC 4397 Query 199 TACTGGCAGCAGGTCGGTCTCCACGAGCTCAAGTTCAAACTGAACAAACCTCTCATCAAG 258 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4396 TACTGGCAGCAGGTCGGTCTCCACGAGCTCAAGTTCAAACTGAACAAACCTCTCATCAAG 4337 Query 259 GGAGAGGCAAAGAATGTGATCATGTTCCTAGGGGACGGTATGTCCCTGCCCACCATTACG 318 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4336 GGAGAGGCAAAGAATGTGATCATGTTCCTAGGGGACGGTATGTCCCTGCCCACCATTACG 4277 Query 319 GCCGCCAGGATCTACAAGGGTCAATTAGGAGAACGGGGCCCTGATGAACCCCGGGGGGAG 378 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4276 GCCGCCAGGATCTACAAGGGTCAATTAGGAGAACGGGGCCCTGATGAACCCCGGGGGGAG 4217 Query 379 CAAGATCATCTCTCCTTTGAGAATTTCCCCTTCACTGGGATGGCCAAGACATACTGTGTG 438 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4216 CAAGATCATCTCTCCTTTGAGAATTTCCCCTTCACTGGGATGGCCAAGACATACTGTGTG 4157 Query 439 GACCAGCAGACGGCCGATTCAGCGTGCACAGCCACCGCCTATCTGTGCGGGGTTAAAAAC 498 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4156 GACCAGCAGACGGCCGATTCAGCGTGCACAGCCACCGCCTATCTGTGCGGGGTTAAAAAC 4097 Query 499 AACTTCGGGACCATAGGGGTTAACTCTAAAATCTCGAGGAAGAATTGTGAGGGCATGAAG 558 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4096 AACTTCGGGACCATAGGGGTTAACTCTAAAATCTCGAGGAAGAATTGTGAGGGCATGAAG 4037 Query 559 AACCCGGAATATTTCACGACCAGCATTCTGAAGTGGGCGCAGGACTTTGGCAAATCTACA 618 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4036 AACCCGGAATATTTCACGACCAGCATTCTGAAGTGGGCGCAGGACTTTGGCAAATCTACA 3977 Query 619 GGCGTCGTCACAACTACCAGAGTAACGCATGCGTCACCCGCAGGTACGTATGCGCACACG 678 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3976 GGCGTCGTCACAACTACCAGAGTAACGCATGCGTCACCCGCAGGTACGTATGCGCACACG 3917 Query 679 GCGGAGAGAGACTGGGAATGTGATGCGGATATCAAGAAGGATCCGGAGCGGATTGGAAAC 738 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3916 GCGGAGAGAGACTGGGAATGTGATGCGGATATCAAGAAGGATCCGGAGCGGATTGGAAAC 3857 Query 739 GGATGTAAGGACATTGCGTACCAACTGGTCAAGGATGACCCCGGACGGAGGATCAAGGTC 798 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3856 GGATGTAAGGACATTGCGTACCAACTGGTCAAGGATGACCCCGGACGGAGGATCAAGGTC 3797 Query 799 ATCATGGGAGGTGGTCGGGCCAAATTCCTGCCAGTGTCTTCTAAGGATGATGAGGGCAAT 858 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3796 ATCATGGGAGGTGGTCGGGCCAAATTCCTGCCAGTGTCTTCTAAGGATGATGAGGGCAAT 3737 Query 859 GTTGGAGAGAGGTCAGATGGACAGGACCTTATTAAGGAGTGGTTATTGGATAAGACCAAC 918 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3736 GTTGGAGAGAGGTCAGATGGACAGGACCTTATTAAGGAGTGGTTATTGGATAAGACCAAC 3677 Query 919 AGGACTAAGAAGGCCAAGTTCATTACGACAAGGCAACAGTTGCTTGAGTTGGACCCTAAT 978 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3676 AGGACTAAGAAGGCCAAGTTCATTACGACAAGGCAACAGTTGCTTGAGTTGGACCCTAAT 3617 Query 979 AAGGGCACGGACTATCTGCTGGGTCTGTTCGCTTCCGATCACCTCCACTACAATCTCGGA 1038 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3616 AAGGGCACGGACTATCTGCTGGGTCTGTTCGCTTCCGATCACCTCCACTACAATCTCGGA 3557 Query 1039 GCGCCCGCGTCGCAGCCGACTCTCGCCGAGATGACCCGAACCGCCATTCGGCTCCTCGAG 1098 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3556 GCGCCCGCGTCGCAGCCGACTCTCGCCGAGATGACCCGAACCGCCATTCGGCTCCTCGAG 3497 Query 1099 AAGGAGCAGAAGGGGTATTTCCTCTTCGTTGAGGGCGGGCATATAGATACCGCACACCAC 1158 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3496 AAGGAGCAGAAGGGGTATTTCCTCTTCGTTGAGGGCGGGCATATAGATACCGCACACCAC 3437 Query 1159 AACAACACACCGCGTTATGCGTTGGACGAAACGGTGGAGCTGGCGAAAGCGGTGAGTGTT 1218 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3436 AACAACACACCGCGTTATGCGTTGGACGAAACGGTGGAGCTGGCGAAAGCGGTGAGTGTT 3377 Query 1219 GCGGTGAATCTGACGAGTGAGAAGGACACGTTGATTGTGGTGACAGCAGATCACGCGCAT 1278 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3376 GCGGTGAATCTGACGAGTGAGAAGGACACGTTGATTGTGGTGACAGCAGATCACGCGCAT 3317 Query 1279 ACCATGATGATCAGCGGATATTCCAAACGAAATAATGATATACTGGGTGCGGCCGACCAG 1338 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3316 ACCATGATGATCAGCGGATATTCCAAACGAAATAATGATATACTGGGTGCGGCCGACCAG 3257 Query 1339 AAGGACCTCAATGGGAACCCTTACCCTACACTGAGTTATGCCAATGGTCCAGCTGCCAGG 1398 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3256 AAGGACCTCAATGGGAACCCCTACCCTACACTGAGTTATGCCAATGGTCCAGCTGCCAGG 3197 Query 1399 GCTCCAGTTTATAATGCAACGTCCAGTACATGTCAGATGCCGACCGTCACAATGGAAGCC 1458 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3196 GCTCCAGTTTATAATGCAACGTCCAGTACATGTCAGATGCCGACCGTCACAATGGAAGCC 3137 Query 1459 GGATTTGGGGACGCCTCGTTCCACTACCCCGCCCTGGTGCCCGCCAAGGACGAAACGCAC 1518 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3136 GGATTTGGGGACGCCTCGTTCCACTACCCCGCCCTGGTGCCCGCCAAGGACGAAACGCAC 3077 Query 1519 GGAGGTGATGACGTCATGGTCTACGCGCGAGGACCCTGGTCTCATCTATTCACCGGGTCC 1578 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3076 GGAGGTGATGACGTCATGGTCTACGCGCGAGGACCCTGGTCTCATCTATTCACCGGGTCC 3017 Query 1579 TACGAGCAGAACTTCATTCCGATCGCCATGGGCTTCGCGTCGCGCGTCGGACCCAACTCA 1638 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3016 TACGAGCAGAACTTCATTCCGATCGCCATGGGCTTCGCGTCGCGCGTCGGACCCAACTCA 2957 Query 1639 AAATTGGCCGGTGCGTCAGGGGGAGTTTCGACGCATGAGACGCATGCGGTCCTGGTGCTG 1698 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct 2956 AAATTGGCCGGTGCGTCAGGGGGAGTTTCGACGCATGAGACGCATGCGGTCCTGATGCTG 2897 Query 1699 CTGAGCGTGGCCGTGGTGTATCTGACGCAGAGACGCTGA 1737 ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct 2896 CTGAGCGTGGCCGTGGTGTTTCTGACGCAGAGACGCTGA 2858 >DcDTr08685.10 Unknown protein Length=647 Score = 272 bits (147), Expect = 2e-71 Identities = 151/153 (99%), Gaps = 0/153 (0%) Strand=Plus/Minus Query 19 ATGATGTATTTCTGGAACTTTTGGCCCACCAATGGAGGTCTGCTCATTCTTCTGCTTGTG 78 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct 232 ATGATGTATTTCTGGAACTTATGGCCCACCAATGGAGGTCTGCTCATTCTTCTGCTAGTG 173 Query 79 AACTGTGTGAATAACATCCAGGAGGCATTTGGTGGCATAGTCATTCATGATGAGGCGGAT 138 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 172 AACTGTGTGAATAACATCCAGGAGGCATTTGGTGGCATAGTCATTCATGATGAGGCGGAT 113 Query 139 AAGTATTCAGAATACTTCAAGTACAAGGCGCAG 171 ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 112 AAGTATTCAGAATACTTCAAGTACAAGGCGCAG 80 Lambda K H 1.34 0.622 1.13 Gapped Lambda K H 1.28 0.460 0.850 Effective search space used: 176115001590 Database: Dcitri_transcriptome.fasta Posted date: Apr 30, 2019 10:57 AM Number of letters in database: 104,618,276 Number of sequences in database: 60,261 Matrix: blastn matrix 1 -2 Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5