BLASTN 2.11.0+ Reference: Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000), "A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000; 7(1-2):203-14. Database: Dcitri_transcriptome.fasta 60,261 sequences; 104,618,276 total letters Query= Dcit001969.1 Length=2982 Score E Sequences producing significant alignments: (Bits) Value DcDTr18741.1Pro-Pol polyprotein 4726 0.0 >DcDTr18741.1 Pro-Pol polyprotein Length=7621 Score = 4726 bits (2559), Expect = 0.0 Identities = 2586/2599 (99%), Gaps = 1/2599 (0%) Strand=Plus/Plus Query 385 TTTGAAGGCGATCCTTCAAATTTCCAAACCTGGTTAGGACTTTTCGACCAGCTCATCCAC 444 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1 TTTGAAGGCGATCCTTCAAATTTCCAAACCTGGTTAGGACTTTTCGACCAGCTCATCCAC 60 Query 445 AGAAATGCACAAATCAGTGAAATTGAAAAATTTAGCTATTTGAAATCCTTCCTTAAGGGC 504 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 61 AGAAATGCACAAATCAGTGAAATTGAAAAATTTAGCTATTTGAAATCCTTCCTTAAGGGC 120 Query 505 CCCGCCCTAGCGTGTATTGAACATGTTTCCTTTGTAGGTTCTAGCTATCCTCTTGCCTAC 564 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 121 CCCGCCCTAGCGTGTATTGAACATGTTCCCTTTGTAGGTTCTAGCTATCCTCTTGCCTAC 180 Query 565 CACACGTTGAAGGAAAGGTTCTTGAGGAAAAGAATTATAGCAGGTTCCCACCTAAGCAAA 624 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 181 CACACGTTGAAGGAAAGGTTCTTGAGGAAAAGAATTATAGCAGGTTCCCACCTAAGCAAA 240 Query 625 GTCCTTCAGTTTTCTCCCCTTAAACACGAAAGTCTCGCAGGACTTCGATCCTTTCTCGAC 684 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 241 GTCCTTCAGTTTTCTCCCCTTAAACACGAAAGTCTCGCAGGACTTCGATCCTTTCTCGAC 300 Query 685 ATTGTGAATGTTTCTGTAGAGAGTTTGAAGGGACTAACCCTTGCCAAACTAGATGAGTTC 744 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 301 ATTGTGAATGTTTCTGTAGAGAGTTTGAAGGGACTAACCCTTGCCAAACTAGATGAGTTC 360 Query 745 ATCCTGGTGTATCTGGGTTTGAATTTGTTAGACTCTACAACTAGGAAATTATTCGAAACA 804 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 361 ATCCTGGTGTATCTGGGTTTGAATTTGTTAGACTCTACAACTAGGAAATTATTCGAAACA 420 Query 805 GAGTACAAAGACACTGAATTTCCTTCATTCAAACAATTAGTGACCTTTATAAAAGATAGG 864 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 421 GAGTACAAAGACACTGAATTTCCTTCATTCAAACAATTAGTGACCTTTATAAAAGATAGG 480 Query 865 TGCTCTGTTCTGGAAATGACTAGTAACCAAGGTGTTATTGATCTTAATAAATCCAGTTTT 924 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 481 TGCTCTGTTCTGGAAATGACTAGTAACCAAGGTGTTATTGATCTTAATAAATCCAGTTTT 540 Query 925 AAGAAGTCCTCATTTGTTAGTGTGCAATCCAATCCGATTGTTCAAAAACCTTCCACTTCC 984 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 541 AAGAAGTCCTCATTTGTTAGTGTGCAATCCAATCCGATTGTTCAAAAACCTTCCACTTCC 600 Query 985 GCTTTTCCCAATGAGCCCAAGCCAAATAAACAACCGTTCCCAAAATGTACTTTGTGTCAC 1044 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 601 GCTTTTCCCAATGAGCCCAAGCCAAATAAACAACCGTTCCCAAAATGTACTTTGTGTCAC 660 Query 1045 CAGCAACCTTTCCATAAAATTGCCTGGTGTCCTAAATTTCTGAAGGCTGAACCTTCTAAG 1104 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 661 CAGCAACCTTTCCATAAAATTGCCTGGTGTCCTAAATTTCTGAAGGCTGAACCTTCTAAG 720 Query 1105 CGTTACTCCATTATCAAAGAACACCAGTTGTGTTTTTCGTGTTTTAGTGCACACCACCCT 1164 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 721 CGTTACTCCATTATCAAAGAACACCAGTTGTGTTTTTCGTGTTTTAGTGCACACCACCCT 780 Query 1165 TCCTCATTATGTACCTCTACCTTTACATGCCGACAATGTAACAGCTCTCAGCACCACACT 1224 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 781 TCCTCATTATGTACCTCTACCTTTACATGCCGACAATGTAACAGCTCTCAGCACCACACT 840 Query 1225 CTCCTACACCCGGCTGATAACAAGAAACCTACGGCTCCTATAGAGACTACGGGTTCGAAC 1284 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct 841 CTCCTACACCCGGCTGATAACAAGAAACCTACGGGTCCTATAGAGACTACGGGTTCGAAC 900 Query 1285 CCCGGCAGTCATCGTGCACAGAAGCTGGTTTCCAACATAGGGACCGCGGGTTCGACTCCC 1344 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 901 CCCGGCAGTCATCGTGCACAGAAGCTGGTTTCCAACATAGGGACCGCGGGTTCGACTCCC 960 Query 1345 GATGGGGGCGTAACTTCCAAGGTTGTTAGTGGTGTGGCGCAAGCCTCACACTCGGTATTG 1404 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 961 GATGGGGGCGTAACTTCCAAGGTTGTTAGTGGTGTGGCGCAAGCCTCACACTCGGTATTG 1020 Query 1405 TTAGGTACTGCCACTGTGCAGATTCAAGATTCCATTGGGCAGTGGCATAACGTACGTTGT 1464 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1021 TTAGGTACTGCCACTGTGCAGATTCAAGATTCCATTGGGCAGTGGCATAACGTACGTTGT 1080 Query 1465 ATCATCGATCCCGGGTCACAAATATCCGCTGTATCCGAGGCTCTAGTTCAAACCCTTGGA 1524 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1081 ATTATCGATCCCGGGTCACAAATATCCGCTGTATCCGAGGCTCTAGTTCAAACCCTTGGA 1140 Query 1525 CTTCCAAGAAAAAGGTGTACACTAGAAATTTCAGGCATCGGTTCTCAAAGTTCGATCCGT 1584 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1141 CTTCCAAGAAAAAGGTGTACACTAGAAATTTCAGGCATCGGTTCTCAAAGTTCGATCCGT 1200 Query 1585 GCCAAAGGTGAGGTGAATTGTGCAATTTTACCACATCCTAAAGTATGTTCTAGTGAAATT 1644 |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||| Sbjct 1201 GCCAAAGGTGAGGTAAATTGTGTAATTTTACCACATCCTAAGGTGTGTTCTAGTGAAATT 1260 Query 1645 CAACCACTGCATGTTTGCGCTGCAGTGCTTCCCAAAATTGCGTCGGACATACCCAGTAGT 1704 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1261 CAACCATTGCATGTTTGCGCTGCAGTGCTTCCCAAAATTGCGTCGGACATACCCAGTAGT 1320 Query 1705 GTACCTATTGAAGTGTTGGATAAATTCCGTCACCTACAGTTAGCAGATAATAATTATCTT 1764 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1321 GTACCTATTGAAGTGTTGGATAAATTCCGTCACCTACAGTTAGCAGATAATAATTATCTT 1380 Query 1765 TCACACAGTGATAGTGTTAGTGATTCCTTAGATCTCCTGTTAGGGGCAGAATATTATGCC 1824 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1381 TCACACAGTGATAGTGTTAGTGATTCCTTAGATCTCCTGTTAGGGGCAGAATATTATGCC 1440 Query 1825 GACGTGCTTGTTTCTACCTTCCCTGTTATTCCCGGCTCTCCCTCTGCTGTCCCTAGCTAC 1884 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct 1441 GACGTGCTTGTTTCTACCTTCCCTGTTATTCCCGGCTCTCCCTCCGCTGTCCCTAGCTAC 1500 Query 1885 TTTGGGTGGCTTCTTATGGGCAAAGTATGCGATGTAAGTTCTTCCATTCCTAGTAAGGCT 1944 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1501 TTTGGGTGGCTTCTTATGGGCAAAGTATGCGATGTAAGTTCTTCCATTCCTAGTAAGGCT 1560 Query 1945 ACTTCCCTATTCATTTCTTCTCTCCACGACCCACTATCCGACCAAATCCAAAAATTTTGG 2004 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1561 ACTTCCCTATTCATTTCTTCTCTCCACGACCCACTATCCGACCAAATCCAAAAATTTTGG 1620 Query 2005 AAATTGGAGGATATTTCCGAGGTCAAACCTGTTGATCCAAATGATGTTTTATGTGAATCC 2064 ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1621 AAATTGGAGGATATTTCCGAGGTCAAACCCGTTGATCCAAATGATGTTTTATGTGAATCC 1680 Query 2065 CACTTCCTTGAAACTCATTCCCGTGATCCAGCGACTGGCAAATATATTGTCCGACTTCCT 2124 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1681 CACTTCCTTGAAACTCATTCCCGTGATCCAGCGACTGGCAAATATATTGTCCGACTTCCT 1740 Query 2125 TTCACGGATAATAAACCGCCTGAGCTGCCATCCAATCGTGCAATAGCTATCAAAAGATTC 2184 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1741 TTCACGGATAATAAACCGCCTGAGCTGCCATCCAATCGTGCAATAGCTATCAAAAGATTC 1800 Query 2185 CAAAACTTACAAATCAAATTGGATAAAAATCCTCACATGAAATCCCTTTATTCTGAAAAC 2244 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1801 CAAAACTTACAAATCAAATTGGATAAAAATCCTCACATGAAATCCCTTTATTCTGAAAAC 1860 Query 2245 TTGAAATCCTACATTGACCAGGGGCACATGGCAGTGGCTGAGAACCACTCGCCATTCTTG 2304 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1861 TTGAAATCCTACATTGACCAGGGGCACATGGCAGTGGCTGAGAACCACTCGCCATTCTTG 1920 Query 2305 TTAGTTCATCACGCTGTGTATAAGCAAAGTAGTTCTACACCAGTGCGAGTAGTGTTTGAT 2364 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct 1921 TTAGTTCATCACGCTGTGTATAAGCAAAGTAGTTCTACACCAGTTCGAGTAGTGTTTGAT 1980 Query 2365 CCTAATGTATCAGTAGGTAAGAACCCATCGCTTAGCAATGTGTTATTAACTGGGGAGAAT 2424 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1981 CCTAATGTATCAGTAGGTAAGAACCCATCGCTTAGCAATGTGTTATTAACTGGGGAGAAT 2040 Query 2425 CTACAAGCTAACATTGGGGATCTGTTAGTTAAGTTCAGACTTAACTTGGTGGCTTTATTA 2484 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2041 CTACAAGCTAACATTGGGGATCTGTTAGTTAAGTTCAGACTTAACTTGGTGGCTTTATTA 2100 Query 2485 TGTGACATCAAAGCTATGTACCGATGCATTTGGTTACATGATGATGATTGTAAATACCAA 2544 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2101 TGTGACATCAAAGCTATGTACCGATGCATTTGGTTACATGATGATGATTGTAAATACCAA 2160 Query 2545 CACCTACTATGGCAGGGTGAACACGGAAAAATGATAGAATACGAGCTTAAAACTGTCACG 2604 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2161 CACCTACTATGGCAGGGTGAACACGGAAAAATGATAGAATACGAGCTTAAAACTGTCACG 2220 Query 2605 TTCGGTCTACCTCCTAGTAGTTTCCTTGCCCAACGAGTGGTCAAACAACTCGTCAGTGAT 2664 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2221 TTCGGTCTACCTCCTAGTAGTTTCCTTGCCCAACGAGTGGTCAAACAACTCGTCAGTGAT 2280 Query 2665 GAGGGCCATAATTTTCCGATGGCTGGTAATGTTGTTGCCAACTCCGTGTATGTAGACGAT 2724 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2281 GAGGGCCATAATTTTCCGATGGCTGGTAATGTTGTTGCCAACTCCGTGTATGTAGACGAT 2340 Query 2725 GTAGTGACAGGTTCCGATTCCATTCAATCCGCCTGCGCTCTAAAACAAGAGCTTATTGAT 2784 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2341 GTAGTGACAGGTTCCGATTCCATTCAATCCGCCTGCGCTCTAAAACAAGAGCTTATTGAT 2400 Query 2785 TTAATGCGTAA-GGGGGATTCGAACTGCGTAAGTGGGCATCCTCGCACAATCAGGTGCTT 2843 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct 2401 TTAATGCGTAAGGGGGGATTCGAACTGCGTAAGTGGGCATCCTCACACAATCAGGTGCTT 2460 Query 2844 GCCGACTTACCGGCGGAAATGTGTGAAACTGTGCATTCTCTCGGTGACACTGACTCTCTC 2903 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2461 GCCGACTTACCGGCGGAAATGTGTGAAACTGTGCATTCTCTCGGTGACACTGACTCTCTC 2520 Query 2904 AAAGTGTTGGGGGCGCAGTGGTCGCCAACCTCCGATTCCTTTTTCTATTCCGTCAAACCA 2963 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2521 AAAGTGTTGGGGGCGCAGTGGTCGCCAACCTCCGATTCCTTTTTCTATTCCGTCAAACCA 2580 Query 2964 AGTGAAACTTCCAATCTAA 2982 ||||||||||||||||||| Sbjct 2581 AGTGAAACTTCCAATCTAA 2599 Score = 2447 bits (1325), Expect = 0.0 Identities = 1331/1334 (99%), Gaps = 0/1334 (0%) Strand=Plus/Plus Query 1 ATGCCTGCTGAAGATAAGATTAAGCGTCACATTAAAAAGAGACAGCAGTATTTTGAAAAG 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 6288 ATGCCTGCTGAAGATAAGATTAAGCGTCACATTAAAAAGAGACAGCAGTATTTTGAAAAG 6347 Query 61 TTACAATATTGTTTCAATTGTATTCAGGGAGGAGAGGCAAAGAAAAGGGAGTTTCTAGTC 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 6348 TTACAATATTGTTTCAATTGTATTCAGGGAGGAGAGGCAAAGAAAAGGGAGTTTCTAGTC 6407 Query 121 AGGGTCAAGGCTGTTGATGAGATAGTAGAGAAACATGAGAGCTTGATAGACGAAGTAAAC 180 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 6408 AGGGTCAAGGCTGTTGATGAGATAGTAGAGAAACATGAGAGCTTGATAGACGAAGTAAAC 6467 Query 181 GATCTTAACAATGACCTCCCGGAAACTGTTAAACCTACCGACACTAGTCAATGGCAAAAG 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 6468 GATCTTAACAATGACCTCCCGGAAACTGTTAAACCTACCGACACTAGTCAATGGCAAAAG 6527 Query 241 ACATTTGATGATATTTATTACCAAATTAAGGCCCACGAATTGGCTTTATTAGAGCAGGAT 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 6528 ACATTTGATGATATTTATTACCAAATTAAGGCCCACGAATTGGCTTTATTAGAGCAGGAT 6587 Query 301 CGACCCCCTCCGTCTCCAGCTTCAGCCAGCACGTCGGGTGCTAACGAAACGAAAGTAAAA 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 6588 CGACCCCCTCCGTCTCCAGCTTCAGCCAGCACGTCGGGTGCTAACGAAACGAAAGTAAAA 6647 Query 361 CTTCCTGTGCTTTCCATTCCTTGTTTTGAAGGCGATCCTTCAAATTTCCAAACCTGGTTA 420 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 6648 CTTCCTGTGCTTTCCATTCCTTGCTTTGAAGGCGATCCTTCAAATTTCCAAACCTGGTTA 6707 Query 421 GGACTTTTCGACCAGCTCATCCACAGAAATGCACAAATCAGTGAAATTGAAAAATTTAGC 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 6708 GGACTTTTCGACCAGCTCATCCACAGAAATGCACAAATCAGTGAAATTGAAAAATTTAGC 6767 Query 481 TATTTGAAATCCTTCCTTAAGGGCCCCGCCCTAGCGTGTATTGAACATGTTTCCTTTGTA 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct 6768 TATTTGAAATCCTTCCTTAAGGGCCCCGCCCTAGCGTGTATTGAACATGTTCCCTTTGTA 6827 Query 541 GGTTCTAGCTATCCTCTTGCCTACCACACGTTGAAGGAAAGGTTCTTGAGGAAAAGAATT 600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 6828 GGTTCTAGCTATCCTCTTGCCTACCACACGTTGAAGGAAAGGTTCTTGAGGAAAAGAATT 6887 Query 601 ATAGCAGGTTCCCACCTAAGCAAAGTCCTTCAGTTTTCTCCCCTTAAACACGAAAGTCTC 660 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 6888 ATAGCAGGTTCCCACCTAAGCAAAGTCCTTCAGTTTTCTCCCCTTAAACACGAAAGTCTC 6947 Query 661 GCAGGACTTCGATCCTTTCTCGACATTGTGAATGTTTCTGTAGAGAGTTTGAAGGGACTA 720 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 6948 GCAGGACTTCGATCCTTTCTCGACATTGTGAATGTTTCTGTAGAGAGTTTGAAGGGACTA 7007 Query 721 ACCCTTGCCAAACTAGATGAGTTCATCCTGGTGTATCTGGGTTTGAATTTGTTAGACTCT 780 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 7008 ACCCTTGCCAAACTAGATGAGTTCATCCTGGTGTATCTGGGTTTGAATTTGTTAGACTCT 7067 Query 781 ACAACTAGGAAATTATTCGAAACAGAGTACAAAGACACTGAATTTCCTTCATTCAAACAA 840 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 7068 ACAACTAGGAAATTATTCGAAACAGAGTACAAAGACACTGAATTTCCTTCATTCAAACAA 7127 Query 841 TTAGTGACCTTTATAAAAGATAGGTGCTCTGTTCTGGAAATGACTAGTAACCAAGGTGTT 900 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 7128 TTAGTGACCTTTATAAAAGATAGGTGCTCTGTTCTGGAAATGACTAGTAACCAAGGTGTT 7187 Query 901 ATTGATCTTAATAAATCCAGTTTTAAGAAGTCCTCATTTGTTAGTGTGCAATCCAATCCG 960 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 7188 ATTGATCTTAATAAATCCAGTTTTAAGAAGTCCTCATTTGTTAGTGTGCAATCCAATCCG 7247 Query 961 ATTGTTCAAAAACCTTCCACTTCCGCTTTTCCCAATGAGCCCAAGCCAAATAAACAACCG 1020 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 7248 ATTGTTCAAAAACCTTCCACTTCCGCTTTTCCCAATGAGCCCAAGCCAAATAAACAACCG 7307 Query 1021 TTCCCAAAATGTACTTTGTGTCACCAGCAACCTTTCCATAAAATTGCCTGGTGTCCTAAA 1080 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 7308 TTCCCAAAATGTACTTTGTGTCACCAGCAACCTTTCCATAAAATTGCCTGGTGTCCTAAA 7367 Query 1081 TTTCTGAAGGCTGAACCTTCTAAGCGTTACTCCATTATCAAAGAACACCAGTTGTGTTTT 1140 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 7368 TTTCTGAAGGCTGAACCTTCTAAGCGTTACTCCATTATCAAAGAACACCAGTTGTGTTTT 7427 Query 1141 TCGTGTTTTAGTGCACACCACCCTTCCTCATTATGTACCTCTACCTTTACATGCCGACAA 1200 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 7428 TCGTGTTTTAGTGCACACCACCCTTCCTCATTATGTACCTCTACCTTTACATGCCGACAA 7487 Query 1201 TGTAACAGCTCTCAGCACCACACTCTCCTACACCCGGCTGATAACAAGAAACCTACGGCT 1260 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct 7488 TGTAACAGCTCTCAGCACCACACTCTCCTACACCCGGCTGATAACAAGAAACCTACGGGT 7547 Query 1261 CCTATAGAGACTACGGGTTCGAACCCCGGCAGTCATCGTGCACAGAAGCTGGTTTCCAAC 1320 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 7548 CCTATAGAGACTACGGGTTCGAACCCCGGCAGTCATCGTGCACAGAAGCTGGTTTCCAAC 7607 Query 1321 ATAGGGACCGCGGG 1334 |||||||||||||| Sbjct 7608 ATAGGGACCGCGGG 7621 Lambda K H 1.33 0.621 1.12 Gapped Lambda K H 1.28 0.460 0.850 Effective search space used: 304058079472 Database: Dcitri_transcriptome.fasta Posted date: Apr 30, 2019 10:57 AM Number of letters in database: 104,618,276 Number of sequences in database: 60,261 Matrix: blastn matrix 1 -2 Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5