BLASTN 2.11.0+ Reference: Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000), "A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000; 7(1-2):203-14. Database: Candidatus_Liberibacter_asiaticus_psy62_genome.fasta 1 sequences; 1,227,328 total letters Query= Untitled_sequence Length=2268 Score E Sequences producing significant alignments: (Bits) Value gi|346722692|ref|NC_012985.3| Candidatus Liberibacter asiaticus ... 4189 0.0 >gi|346722692|ref|NC_012985.3| Candidatus Liberibacter asiaticus str. psy62 chromosome, complete genome Length=1227328 Score = 4189 bits (2268), Expect = 0.0 Identities = 2268/2268 (100%), Gaps = 0/2268 (0%) Strand=Plus/Minus Query 1 ATGGCGGAGTATGCAAGAGAAAATCGATTATTTTTACCGATTCAAATCATTCCCTCACAC 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 516953 ATGGCGGAGTATGCAAGAGAAAATCGATTATTTTTACCGATTCAAATCATTCCCTCACAC 516894 Query 61 GTTAAATATGCATTTGTTTCTGCTGAAGATAAAAATTTCTACTATCATTCAGGAGTTGAT 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 516893 GTTAAATATGCATTTGTTTCTGCTGAAGATAAAAATTTCTACTATCATTCAGGAGTTGAT 516834 Query 121 ATCTTTGGTATCATGCGCGCTGTCCTGCACAATATAAGAAACATTAGTCATGGACGACGT 180 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 516833 ATCTTTGGTATCATGCGCGCTGTCCTGCACAATATAAGAAACATTAGTCATGGACGACGT 516774 Query 181 CCAGAGGGAGCTTCAACTATCACACAACAAGTTGCAAAGAATTTTCTCTTAACCTCTAAT 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 516773 CCAGAGGGAGCTTCAACTATCACACAACAAGTTGCAAAGAATTTTCTCTTAACCTCTAAT 516714 Query 241 CAAACCATGGATCGAAAAATCAAGGAAATCCTCCTATCTTTTCGCCTTGAAAAAGCCTAT 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 516713 CAAACCATGGATCGAAAAATCAAGGAAATCCTCCTATCTTTTCGCCTTGAAAAAGCCTAT 516654 Query 301 GACAAGGAAAAAATACTAGAATTTTACTTAAATGAAATTTTTTTCGGATTTAACTCCTAT 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 516653 GACAAGGAAAAAATACTAGAATTTTACTTAAATGAAATTTTTTTCGGATTTAACTCCTAT 516594 Query 361 GGAATAGCAAGCGCCGCTCTAACTTATTTTAATAAATCAGTGAGTGAATTAACCATAGAA 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 516593 GGAATAGCAAGCGCCGCTCTAACTTATTTTAATAAATCAGTGAGTGAATTAACCATAGAA 516534 Query 421 GAAGCCGCTTACTTAGCAGCTCTTCCTAAGGGTCCGAGTAATTATGATCCTTTCCGCAAG 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 516533 GAAGCCGCTTACTTAGCAGCTCTTCCTAAGGGTCCGAGTAATTATGATCCTTTCCGCAAG 516474 Query 481 AATAAAGCGGCGATTGCTCGCCGAAATTGGGTCATTGACCGTATGGAGGAAAATGGGTAT 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 516473 AATAAAGCGGCGATTGCTCGCCGAAATTGGGTCATTGACCGTATGGAGGAAAATGGGTAT 516414 Query 541 ATCTCCCAAGAGCAAGCTCTTGTCGCCAAACAGAAACCTCTCAAAATCACGATTAAACAA 600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 516413 ATCTCCCAAGAGCAAGCTCTTGTCGCCAAACAGAAACCTCTCAAAATCACGATTAAACAA 516354 Query 601 CGTAGATCCCATCTTTTTGGAAGTGAATACTTCGCTGAAGAAGTGAGACGACAGCTTATT 660 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 516353 CGTAGATCCCATCTTTTTGGAAGTGAATACTTCGCTGAAGAAGTGAGACGACAGCTTATT 516294 Query 661 GATCGTTATGGAGAAAAGGCACTTTATGAAGATGGTTTATCCATACGAACGTCGCTTGAT 720 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 516293 GATCGTTATGGAGAAAAGGCACTTTATGAAGATGGTTTATCCATACGAACGTCGCTTGAT 516234 Query 721 CCACAATTACAACTCTATGCAAGAAAAGCCCTCCAAAATGGATTGATCAATTACGATCAG 780 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 516233 CCACAATTACAACTCTATGCAAGAAAAGCCCTCCAAAATGGATTGATCAATTACGATCAG 516174 Query 781 AATGACGGTTTTCGTGGACCTATAAAGCGCATAGATTTAAAAAAAGATTGGGGAAATACT 840 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 516173 AATGACGGTTTTCGTGGACCTATAAAGCGCATAGATTTAAAAAAAGATTGGGGAAATACT 516114 Query 841 CTGGCATCAATCCCTACCTTATATGATGTGCCCGAATGGGACATTGCTGTCGTTCTAGAA 900 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 516113 CTGGCATCAATCCCTACCTTATATGATGTGCCCGAATGGGACATTGCTGTCGTTCTAGAA 516054 Query 901 GTATCCAATTCTCATATAACTATAGGGATCCGTCCAACTATTGACTCAAATGGGAAAGTC 960 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 516053 GTATCCAATTCTCATATAACTATAGGGATCCGTCCAACTATTGACTCAAATGGGAAAGTC 515994 Query 961 ACGACCGAAAGGAAAAAAGGCATAATTGAAGCAGATTCGATGCGATGGGTCTATAATAAA 1020 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 515993 ACGACCGAAAGGAAAAAAGGCATAATTGAAGCAGATTCGATGCGATGGGTCTATAATAAA 515934 Query 1021 GAGCAAACCACAGAAGAAACATCAGAAAATCGCAATGTTCTTTCGCTCGGCGATGTAATC 1080 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 515933 GAGCAAACCACAGAAGAAACATCAGAAAATCGCAATGTTCTTTCGCTCGGCGATGTAATC 515874 Query 1081 TACGTAGAACATATTAATGAAGGATGGAGACTCCGTCAAATTCCAAAAGTACAAGGAGGA 1140 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 515873 TACGTAGAACATATTAATGAAGGATGGAGACTCCGTCAAATTCCAAAAGTACAAGGAGGA 515814 Query 1141 TTAATAGCTATGGATCCTCGTACTGGTCGCATTCTTGCCACTATAGGAGGATTCTCTTAT 1200 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 515813 TTAATAGCTATGGATCCTCGTACTGGTCGCATTCTTGCCACTATAGGAGGATTCTCTTAT 515754 Query 1201 TCACAGTCAGAATTTAATCGCTCTACTCAAGCAATGCGCCAACCCGGATCCTGTTTTAAA 1260 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 515753 TCACAGTCAGAATTTAATCGCTCTACTCAAGCAATGCGCCAACCCGGATCCTGTTTTAAA 515694 Query 1261 CCAATTGTATATGCAGCCGCATTAGATAGCGGATATACTCCTGCATCGGTCATTATGGAT 1320 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 515693 CCAATTGTATATGCAGCCGCATTAGATAGCGGATATACTCCTGCATCGGTCATTATGGAT 515634 Query 1321 GCCCCAATTGAAGTCGTTTCCAGAGGAAAAATTTGGAAACCTGAAAATTATAGCAAAAAC 1380 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 515633 GCCCCAATTGAAGTCGTTTCCAGAGGAAAAATTTGGAAACCTGAAAATTATAGCAAAAAC 515574 Query 1381 TTTTCTGGTGCGTCCACTTTGCGCTTTGGACTCGAAAAATCTCGTAATCTCATGACAGTA 1440 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 515573 TTTTCTGGTGCGTCCACTTTGCGCTTTGGACTCGAAAAATCTCGTAATCTCATGACAGTA 515514 Query 1441 CGTCTTGCCCATAATATGGGAATGACTGTTGTAGCCGATTATGCCGAAAACTTTGGCATT 1500 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 515513 CGTCTTGCCCATAATATGGGAATGACTGTTGTAGCCGATTATGCCGAAAACTTTGGCATT 515454 Query 1501 TATGATAAAATGTTACCTGTTTTACCAATGTCTTTGGGGGCAGGAGAAACCACAGTACTA 1560 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 515453 TATGATAAAATGTTACCTGTTTTACCAATGTCTTTGGGGGCAGGAGAAACCACAGTACTA 515394 Query 1561 CGTATGGTCTCGGCTTATGCTGTTTTTGCCAATGGAGGAAAACAAATTCGACCTTCATTT 1620 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 515393 CGTATGGTCTCGGCTTATGCTGTTTTTGCCAATGGAGGAAAACAAATTCGACCTTCATTT 515334 Query 1621 ATTGATCGCATTCAAAATAGGTATGGCAAAACCATATTTAATCAAGAACAACGCATTTGT 1680 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 515333 ATTGATCGCATTCAAAATAGGTATGGCAAAACCATATTTAATCAAGAACAACGCATTTGT 515274 Query 1681 GATGATTGCAATTATGATACTTGGAATGGACAAGACGAACCGGAAATAATCGATAAACGA 1740 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 515273 GATGATTGCAATTATGATACTTGGAATGGACAAGACGAACCGGAAATAATCGATAAACGA 515214 Query 1741 GAACAAGTGTTGGATCCCATGACTGCTTATCAAATTACTTCTATGTTAGAAGGAGTTATT 1800 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 515213 GAACAAGTGTTGGATCCCATGACTGCTTATCAAATTACTTCTATGTTAGAAGGAGTTATT 515154 Query 1801 AAGCATGGAACTGCCACAGGTAAAGTCCGATTGAATCGGCCTGTCGCTGGGAAAACGGGC 1860 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 515153 AAGCATGGAACTGCCACAGGTAAAGTCCGATTGAATCGGCCTGTCGCTGGGAAAACGGGC 515094 Query 1861 ACAACGAGTAGCTATAGAGATACTTGGTTTATAGGATATACCCCTACACTTGTAGTTGGC 1920 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 515093 ACAACGAGTAGCTATAGAGATACTTGGTTTATAGGATATACCCCTACACTTGTAGTTGGC 515034 Query 1921 GTTTATGTTGGTTATGACATCCCAGCTCCTTTAAACAACCATGCAACCGGAAGCACTCTT 1980 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 515033 GTTTATGTTGGTTATGACATCCCAGCTCCTTTAAACAACCATGCAACCGGAAGCACTCTT 514974 Query 1981 ACTGCACCTATTTTTAATGCTTTCATGAAAGAAGCACTAAAAAACATTCCTTCTTCTCGT 2040 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 514973 ACTGCACCTATTTTTAATGCTTTCATGAAAGAAGCACTAAAAAACATTCCTTCTTCTCGT 514914 Query 2041 TTTGTTGCTCCACCAGGCATGAGTCTGATTCCTATCAATAAATGGACAGGCATGTTGTCT 2100 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 514913 TTTGTTGCTCCACCAGGCATGAGTCTGATTCCTATCAATAAATGGACAGGCATGTTGTCT 514854 Query 2101 AAAAAAGGAGATCCTGATACCATTATTGAAGCATTTAAACCTGGGACAGGACCAGCAGAA 2160 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 514853 AAAAAAGGAGATCCTGATACCATTATTGAAGCATTTAAACCTGGGACAGGACCAGCAGAA 514794 Query 2161 ACCTATACTGTCATTGATGAAGATAGTAATGTTTCTTCCGAAGAAATTCTCCGCAGATCT 2220 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 514793 ACCTATACTGTCATTGATGAAGATAGTAATGTTTCTTCCGAAGAAATTCTCCGCAGATCT 514734 Query 2221 CCTCAAGCCAATCAAGCAATTAATTCTGGAAGTGGAGGCTTATACTAA 2268 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 514733 CCTCAAGCCAATCAAGCAATTAATTCTGGAAGTGGAGGCTTATACTAA 514686 Lambda K H 1.33 0.621 1.12 Gapped Lambda K H 1.28 0.460 0.850 Effective search space used: 2756529276 Database: Candidatus_Liberibacter_asiaticus_psy62_genome.fasta Posted date: Jul 20, 2015 1:36 PM Number of letters in database: 1,227,328 Number of sequences in database: 1 Matrix: blastn matrix 1 -2 Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5