BLASTN 2.11.0+ Reference: Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000), "A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000; 7(1-2):203-14. Database: SS_all_quivered_hq.fasta 42,166 sequences; 76,657,983 total letters Query= Untitled_sequence Length=627 Score E Sequences producing significant alignments: (Bits) Value c141474/f2p2/1198isoform=c141474;full_length_coverage=2;non_full_... 1142 0.0 c88411/f3p2/1200isoform=c88411;full_length_coverage=3;non_full_le... 1142 0.0 c131173/f2p2/1734isoform=c131173;full_length_coverage=2;non_full_... 1099 0.0 c103389/f2p2/1359isoform=c103389;full_length_coverage=2;non_full_... 1099 0.0 c108240/f3p2/1193isoform=c108240;full_length_coverage=3;non_full_... 1077 0.0 >c141474/f2p2/1198 isoform=c141474;full_length_coverage=2;non_full_length_coverage=2;isoform_length=1198 Length=1198 Score = 1142 bits (618), Expect = 0.0 Identities = 624/627 (99%), Gaps = 0/627 (0%) Strand=Plus/Plus Query 1 ATGTTTCCGAAGGCCAAAGTTTTGATTTACACATTAACATTCCTAGGATATATCTACAGT 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 192 ATGTTTCCGAAGGCCAAAGTTTTGATTTACACATTAACATTCCTAGGATATATCTACAGT 251 Query 61 GGCTATGGGTCTGGCTTATTAGGAAACTTGCGAGAGGCAGTTTTGTCTGCTGAGAATATA 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 252 GGCTATGGGTCTGGCTTATTAGGAAACTTGCGAGAGGCAGTTTTGTCTGCTGAGAATATA 311 Query 121 TTTGGAAATGTCTTGGAGACTGTAGTCTCATTTACCAAAGAATTCAAACATATTCATGAA 180 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 312 TTTGGAAATGTCTTGGAGACTGTAGTCTCATTTACCAAAGAATTCAAACATATTCATGAA 371 Query 181 ACGATTGATGATGCAGCTGAAGAAGTGTGTACTTTCCAATGTCCTTCAGGAACTAAGCCT 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 372 ACGATTGATGATGCAGCTGAAGAAGTGTGTACTTTCCAATGTCCTTCAGGAACTAAGCCT 431 Query 241 GTAAAGAACAAATACTATGTACCCAAGCCTAATGGATGTGGTCAAGAAGGATCACAGGTA 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 432 GTAAAGAACAAATACTATGTACCCAAGCCTAATGGATGTGGTCAAGAAGGATCACAGGTA 491 Query 301 AATAGGCTCTCCCAGTATTTTTCATTTGAAGAACTCACCACCTGTTGCAATGAGCATGAC 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 492 AATAGGCTCTCCCAGTATTTTTCATTTGAAGAACTCACCACCTGTTGCAATGAGCATGAC 551 Query 361 ATCTGTTATGGCACTTGTAACAAGCTCAAGGAAACATGTGACTTTGACTTTAGGAAATGT 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 552 ATCTGTTATGGCACTTGTAACAAGCTCAAGGAAACATGTGACTTTGACTTTAGGAAATGT 611 Query 421 TTGTATCGGATATGTGATCAACTTGAAGGCAAATCTGTAAACTCCCCCACACTGGATACA 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct 612 TTGTATCGGATATGTGATCAACTTGAAGGCAAATCTGTTAACTCCCCCACACTGGATACA 671 Query 481 ATCTCAAAAGGTTGTAAGGTGGCAGCTAAGACCATGTTCACAAGTACCATGACATTCGGG 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 672 ATCTCAAAAGGTTGTAAGGTGGCAGCTAAGACCATGTTCACAAGTACCATGACATTCGGG 731 Query 541 TGTAAATATTACAAGGCAGCCCAGGCTCAAGCTTGTTTCTGTCCTCCGACCAAGAAGAGA 600 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| Sbjct 732 TGTAAATATTACAAGGCAGCCCAGGCTCAAGCTTGTTTCTGTCCTCCAATCAAGAAGAGA 791 Query 601 AAGTTTGCTGCTAATGAAGAGCTTTGA 627 ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 792 AAGTTTGCTGCTAATGAAGAGCTTTGA 818 >c88411/f3p2/1200 isoform=c88411;full_length_coverage=3;non_full_length_coverage=2;isoform_length=1200 Length=1200 Score = 1142 bits (618), Expect = 0.0 Identities = 624/627 (99%), Gaps = 0/627 (0%) Strand=Plus/Plus Query 1 ATGTTTCCGAAGGCCAAAGTTTTGATTTACACATTAACATTCCTAGGATATATCTACAGT 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 195 ATGTTTCCGAAGGCCAAAGTTTTGATTTACACATTAACATTCCTAGGATATATCTACAGT 254 Query 61 GGCTATGGGTCTGGCTTATTAGGAAACTTGCGAGAGGCAGTTTTGTCTGCTGAGAATATA 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 255 GGCTATGGGTCTGGCTTATTAGGAAACTTGCGAGAGGCAGTTTTGTCTGCTGAGAATATA 314 Query 121 TTTGGAAATGTCTTGGAGACTGTAGTCTCATTTACCAAAGAATTCAAACATATTCATGAA 180 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 315 TTTGGAAATGTCTTGGAGACTGTAGTCTCATTTACCAAAGAATTCAAACATATTCATGAA 374 Query 181 ACGATTGATGATGCAGCTGAAGAAGTGTGTACTTTCCAATGTCCTTCAGGAACTAAGCCT 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 375 ACGATTGATGATGCAGCTGAAGAAGTGTGTACTTTCCAATGTCCTTCAGGAACTAAGCCT 434 Query 241 GTAAAGAACAAATACTATGTACCCAAGCCTAATGGATGTGGTCAAGAAGGATCACAGGTA 300 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 435 GTAAAGAACAAATACTATGTTCCCAAGCCTAATGGATGTGGTCAAGAAGGATCACAGGTA 494 Query 301 AATAGGCTCTCCCAGTATTTTTCATTTGAAGAACTCACCACCTGTTGCAATGAGCATGAC 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 495 AATAGGCTCTCCCAGTATTTTTCATTTGAAGAACTCACCACCTGTTGCAATGAGCATGAC 554 Query 361 ATCTGTTATGGCACTTGTAACAAGCTCAAGGAAACATGTGACTTTGACTTTAGGAAATGT 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 555 ATCTGTTATGGCACTTGTAACAAGCTCAAGGAAACATGTGACTTTGACTTTAGGAAATGT 614 Query 421 TTGTATCGGATATGTGATCAACTTGAAGGCAAATCTGTAAACTCCCCCACACTGGATACA 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 615 TTGTATCGGATATGTGATCAACTTGAAGGCAAATCTGTAAACTCCCCCACACTGGATACA 674 Query 481 ATCTCAAAAGGTTGTAAGGTGGCAGCTAAGACCATGTTCACAAGTACCATGACATTCGGG 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 675 ATCTCAAAAGGTTGTAAGGTGGCAGCTAAGACCATGTTCACAAGTACCATGACATTCGGG 734 Query 541 TGTAAATATTACAAGGCAGCCCAGGCTCAAGCTTGTTTCTGTCCTCCGACCAAGAAGAGA 600 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| Sbjct 735 TGTAAATATTACAAGGCAGCCCAGGCTCAAGCTTGTTTCTGTCCTCCAATCAAGAAGAGA 794 Query 601 AAGTTTGCTGCTAATGAAGAGCTTTGA 627 ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 795 AAGTTTGCTGCTAATGAAGAGCTTTGA 821 >c131173/f2p2/1734 isoform=c131173;full_length_coverage=2;non_full_length_coverage=2;isoform_length=1734 Length=1734 Score = 1099 bits (595), Expect = 0.0 Identities = 618/627 (99%), Gaps = 9/627 (1%) Strand=Plus/Plus Query 1 ATGTTTCCGAAGGCCAAAGTTTTGATTTACACATTAACATTCCTAGGATATATCTACAGT 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 222 ATGTTTCCGAAGGCCAAAGTTTTGATTTACACATTAACATTCCTAGGATATATCTACAGT 281 Query 61 GGCTATGGGTCTGGCTTATTAGGAAACTTGCGAGAGGCAGTTTTGTCTGCTGAGAATATA 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 282 GGCTATGGGTCTGGCTTATTAGGAAACTTGCGAGAGGCAGTTTTGTCTGCTGAGAATATA 341 Query 121 TTTGGAAATGTCTTGGAGACTGTAGTCTCATTTACCAAAGAATTCAAACATATTCATGAA 180 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 342 TTTGGAAATGTCTTGGAGACTGTAGTCTCATTTACCAAAGAATTCAAACATATTCATGAA 401 Query 181 ACGATTGATGATGCAGCTGAAGAAGTGTGTACTTTCCAATGTCCTTCAGGAACTAAGCCT 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 402 ACGATTGATGATGCAGCTGAAGAAGTGTGTACTTTCCAATGTCCTTCAGGAACTAAGCCT 461 Query 241 GTAAAGAACAAATACTATGTACCCAAGCCTAATGGATGTGGTCAAGAAGGATCACAGGTA 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 462 GTAAAGAACAAATACTATGTACCCAAGCCTAATGGATGTGGTCAAGAAGGATCACA---- 517 Query 301 AATAGGCTCTCCCAGTATTTTTCATTTGAAGAACTCACCACCTGTTGCAATGAGCATGAC 360 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 518 -----GCTCTCCCAGTATTTTTCATTTGAAGAACTCACCACCTGTTGCAATGAGCATGAC 572 Query 361 ATCTGTTATGGCACTTGTAACAAGCTCAAGGAAACATGTGACTTTGACTTTAGGAAATGT 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 573 ATCTGTTATGGCACTTGTAACAAGCTCAAGGAAACATGTGACTTTGACTTTAGGAAATGT 632 Query 421 TTGTATCGGATATGTGATCAACTTGAAGGCAAATCTGTAAACTCCCCCACACTGGATACA 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 633 TTGTATCGGATATGTGATCAACTTGAAGGCAAATCTGTAAACTCCCCCACACTGGATACA 692 Query 481 ATCTCAAAAGGTTGTAAGGTGGCAGCTAAGACCATGTTCACAAGTACCATGACATTCGGG 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 693 ATCTCAAAAGGTTGTAAGGTGGCAGCTAAGACCATGTTCACAAGTACCATGACATTCGGG 752 Query 541 TGTAAATATTACAAGGCAGCCCAGGCTCAAGCTTGTTTCTGTCCTCCGACCAAGAAGAGA 600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 753 TGTAAATATTACAAGGCAGCCCAGGCTCAAGCTTGTTTCTGTCCTCCGACCAAGAAGAGA 812 Query 601 AAGTTTGCTGCTAATGAAGAGCTTTGA 627 ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 813 AAGTTTGCTGCTAATGAAGAGCTTTGA 839 >c103389/f2p2/1359 isoform=c103389;full_length_coverage=2;non_full_length_coverage=2;isoform_length=1359 Length=1359 Score = 1099 bits (595), Expect = 0.0 Identities = 618/627 (99%), Gaps = 9/627 (1%) Strand=Plus/Plus Query 1 ATGTTTCCGAAGGCCAAAGTTTTGATTTACACATTAACATTCCTAGGATATATCTACAGT 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 191 ATGTTTCCGAAGGCCAAAGTTTTGATTTACACATTAACATTCCTAGGATATATCTACAGT 250 Query 61 GGCTATGGGTCTGGCTTATTAGGAAACTTGCGAGAGGCAGTTTTGTCTGCTGAGAATATA 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 251 GGCTATGGGTCTGGCTTATTAGGAAACTTGCGAGAGGCAGTTTTGTCTGCTGAGAATATA 310 Query 121 TTTGGAAATGTCTTGGAGACTGTAGTCTCATTTACCAAAGAATTCAAACATATTCATGAA 180 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 311 TTTGGAAATGTCTTGGAGACTGTAGTCTCATTTACCAAAGAATTCAAACATATTCATGAA 370 Query 181 ACGATTGATGATGCAGCTGAAGAAGTGTGTACTTTCCAATGTCCTTCAGGAACTAAGCCT 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 371 ACGATTGATGATGCAGCTGAAGAAGTGTGTACTTTCCAATGTCCTTCAGGAACTAAGCCT 430 Query 241 GTAAAGAACAAATACTATGTACCCAAGCCTAATGGATGTGGTCAAGAAGGATCACAGGTA 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 431 GTAAAGAACAAATACTATGTACCCAAGCCTAATGGATGTGGTCAAGAAGGATCACA---- 486 Query 301 AATAGGCTCTCCCAGTATTTTTCATTTGAAGAACTCACCACCTGTTGCAATGAGCATGAC 360 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 487 -----GCTCTCCCAGTATTTTTCATTTGAAGAACTCACCACCTGTTGCAATGAGCATGAC 541 Query 361 ATCTGTTATGGCACTTGTAACAAGCTCAAGGAAACATGTGACTTTGACTTTAGGAAATGT 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 542 ATCTGTTATGGCACTTGTAACAAGCTCAAGGAAACATGTGACTTTGACTTTAGGAAATGT 601 Query 421 TTGTATCGGATATGTGATCAACTTGAAGGCAAATCTGTAAACTCCCCCACACTGGATACA 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 602 TTGTATCGGATATGTGATCAACTTGAAGGCAAATCTGTAAACTCCCCCACACTGGATACA 661 Query 481 ATCTCAAAAGGTTGTAAGGTGGCAGCTAAGACCATGTTCACAAGTACCATGACATTCGGG 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 662 ATCTCAAAAGGTTGTAAGGTGGCAGCTAAGACCATGTTCACAAGTACCATGACATTCGGG 721 Query 541 TGTAAATATTACAAGGCAGCCCAGGCTCAAGCTTGTTTCTGTCCTCCGACCAAGAAGAGA 600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 722 TGTAAATATTACAAGGCAGCCCAGGCTCAAGCTTGTTTCTGTCCTCCGACCAAGAAGAGA 781 Query 601 AAGTTTGCTGCTAATGAAGAGCTTTGA 627 ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 782 AAGTTTGCTGCTAATGAAGAGCTTTGA 808 >c108240/f3p2/1193 isoform=c108240;full_length_coverage=3;non_full_length_coverage=2;isoform_length=1193 Length=1193 Score = 1077 bits (583), Expect = 0.0 Identities = 614/627 (98%), Gaps = 9/627 (1%) Strand=Plus/Plus Query 1 ATGTTTCCGAAGGCCAAAGTTTTGATTTACACATTAACATTCCTAGGATATATCTACAGT 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 196 ATGTTTCCGAAGGCCAAAGTTTTGATTTACACATTAACATTCCTAGGATATATCTACAGT 255 Query 61 GGCTATGGGTCTGGCTTATTAGGAAACTTGCGAGAGGCAGTTTTGTCTGCTGAGAATATA 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 256 GGCTATGGGTCTGGCTTATTAGGAAACTTGCGAGAGGCAGTTTTGTCTGCTGAGAATATA 315 Query 121 TTTGGAAATGTCTTGGAGACTGTAGTCTCATTTACCAAAGAATTCAAACATATTCATGAA 180 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 316 TTTGGAAATGTCTTGGAGACTGTAGTCTCATTTACCAAAGAATTCAAACATATTCATGAA 375 Query 181 ACGATTGATGATGCAGCTGAAGAAGTGTGTACTTTCCAATGTCCTTCAGGAACTAAGCCT 240 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 376 ACGATCGATGATGCAGCTGAAGAAGTGTGTACTTTCCAATGTCCTTCAGGAACTAAGCCT 435 Query 241 GTAAAGAACAAATACTATGTACCCAAGCCTAATGGATGTGGTCAAGAAGGATCACAGGTA 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 436 GTAAAGAACAAATACTATGTACCCAAGCCTAATGGATGTGGTCAAGAAGGATCACA---- 491 Query 301 AATAGGCTCTCCCAGTATTTTTCATTTGAAGAACTCACCACCTGTTGCAATGAGCATGAC 360 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 492 -----GCTCTCCCAGTATTTTTCATTTGAAGAACTCACCACCTGTTGCAATGAGCATGAC 546 Query 361 ATCTGTTATGGCACTTGTAACAAGCTCAAGGAAACATGTGACTTTGACTTTAGGAAATGT 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 547 ATCTGTTATGGCACTTGTAACAAGCTCAAGGAAACATGTGACTTTGACTTTAGGAAATGT 606 Query 421 TTGTATCGGATATGTGATCAACTTGAAGGCAAATCTGTAAACTCCCCCACACTGGATACA 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 607 TTGTATCGGATATGTGATCAACTTGAAGGCAAATCTGTAAACTCCCCCACACTGGATACA 666 Query 481 ATCTCAAAAGGTTGTAAGGTGGCAGCTAAGACCATGTTCACAAGTACCATGACATTCGGG 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 667 ATCTCAAAAGGTTGTAAGGTGGCAGCTAAGACCATGTTCACAAGTACCATGACATTCGGG 726 Query 541 TGTAAATATTACAAGGCAGCCCAGGCTCAAGCTTGTTTCTGTCCTCCGACCAAGAAGAGA 600 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| Sbjct 727 TGTAAATATTATAAGGCAGCCCAGGCTCAAGCTTGTTTCTGTCCTCCAATCAAGAAGAGA 786 Query 601 AAGTTTGCTGCTAATGAAGAGCTTTGA 627 ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 787 AAGTTTGCTGCTAATGAAGAGCTTTGA 813 Lambda K H 1.33 0.621 1.12 Gapped Lambda K H 1.28 0.460 0.850 Effective search space used: 45513507466 Database: SS_all_quivered_hq.fasta Posted date: Feb 25, 2019 4:32 PM Number of letters in database: 76,657,983 Number of sequences in database: 42,166 Matrix: blastn matrix 1 -2 Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5